21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1520 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1520  hypothetical protein  100 
 
 
1278 aa  2577    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.334593  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0697  beta-glucanase precursor  29.95 
 
 
381 aa  165  7e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0698  beta-glucanase precursor  31.83 
 
 
369 aa  164  9e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1519  hypothetical protein  34.51 
 
 
1513 aa  161  9e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.44444  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6431  glycoside hydrolase family 43  31.55 
 
 
325 aa  156  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.756264  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1972  glycoside hydrolase family 43  31.05 
 
 
501 aa  147  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  26.76 
 
 
571 aa  114  8.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  25.74 
 
 
494 aa  108  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04330  putative carbohydrate-binding protein with Ig-like domain and F5/8 type C domain  27.03 
 
 
1197 aa  107  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.647548 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6866  Ricin B lectin  25.74 
 
 
493 aa  100  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191188  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02664  beta-glucanase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G14190)  25.54 
 
 
488 aa  95.1  7e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04290  putative carbohydrate-binding protein with Ig-like domain, F5/8 type C domain and ricin-type beta-trefoil lectin domain  35.45 
 
 
1410 aa  87.4  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0434  hypothetical protein  24.48 
 
 
345 aa  86.3  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07313  glycosyl hydrolase family 43 protein (AFU_orthologue; AFUA_8G02510)  29.43 
 
 
475 aa  86.7  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4425  hypothetical protein  24.62 
 
 
360 aa  74.3  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1730  Ig domain protein  32.53 
 
 
1170 aa  69.7  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.07641 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2129  fibronectin type III domain-containing protein  35.37 
 
 
1479 aa  60.5  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34830  hypothetical protein  22.49 
 
 
422 aa  58.9  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0102  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.05 
 
 
1781 aa  54.3  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.432951 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14870  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  46.34 
 
 
916 aa  51.6  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.44593  normal  0.0967933 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07070  alpha-glucuronidase  44 
 
 
1154 aa  50.4  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.509455 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>