110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0867 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0867  Na+/H+ antiporter  100 
 
 
472 aa  922    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0408  Na+/H+ antiporter NhaC  42.29 
 
 
477 aa  328  9e-89  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2820  Na+/H+ antiporter NhaC  25.12 
 
 
457 aa  137  5e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.609382  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4232  Na+/H+ antiporter NhaC  25.88 
 
 
457 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845886  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1004  Na+/H+ antiporter NhaC  25.88 
 
 
457 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3953  Na+/H+ antiporter NhaC  25.18 
 
 
457 aa  125  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1829  Na+/H+ antiporter NhaC  25.51 
 
 
461 aa  117  6e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17400  Na+ antiporter NhaC  25.56 
 
 
488 aa  116  7.999999999999999e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.694784  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1496  Na+/H+ antiporter  24.87 
 
 
458 aa  115  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000011565  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0972  Na+/H+ antiporter NhaC  19.85 
 
 
454 aa  109  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000730047  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2159  Na+/H+ antiporter NhaC  23.34 
 
 
484 aa  107  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.318681  normal  0.208932 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1609  sodium/proton antiporter  25.11 
 
 
484 aa  105  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0896  Na+/H+ antiporter NhaC  23.45 
 
 
489 aa  103  9e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0793  Na(+)/H(+) antiporter  24.36 
 
 
469 aa  102  2e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2552  Na+/H+ antiporter NhaC  26.12 
 
 
463 aa  102  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0798211 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12540  Na+ antiporter NhaC  24.65 
 
 
475 aa  102  2e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.859822 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2006  Na+/H+ antiporter  26.75 
 
 
451 aa  101  3e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.16502  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2476  Na+/H+ antiporter NhaC  26.09 
 
 
502 aa  100  8e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.629323  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0184  Na+/H+ antiporter NhaC  25.33 
 
 
470 aa  99  1e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0528403  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1769  Na+/H+ antiporter NhaC  23.98 
 
 
496 aa  98.2  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.679407  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1629  Na+/H+ antiporter NhaC  24.62 
 
 
482 aa  97.4  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.835214  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4193  Na+/H+ antiporter NhaC  31.87 
 
 
457 aa  97.1  7e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3877  Na+/H+ antiporter  31.87 
 
 
457 aa  97.1  7e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.335407  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0461  Na+/H+ antiporter NhaC  27.03 
 
 
483 aa  96.7  9e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1787  Na+/H+ antiporter NhaC  25.76 
 
 
483 aa  95.9  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1552  Na+/H+ antiporter NhaC  23.08 
 
 
474 aa  95.5  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0548  Na+/H+ antiporter NhaC  25.52 
 
 
510 aa  95.1  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0362545  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0177  Na+/H+ antiporter NhaC  25.65 
 
 
471 aa  95.1  2e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.286543  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1670  Na+/H+ antiporter NhaC  25.76 
 
 
483 aa  95.1  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1733  Na+/H+ antiporter NhaC  25.76 
 
 
483 aa  95.1  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1668  Na+/H+ antiporter NhaC  25.81 
 
 
483 aa  95.1  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1609  Na+/H+ antiporter NhaC  25.81 
 
 
483 aa  95.1  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1400  Na+/H+ antiporter NhaC  22.94 
 
 
510 aa  94.4  4e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000509696  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4869  Na+/H+ antiporter IbeT  24.1 
 
 
467 aa  94  6e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0310  Na+/H+ antiporter  23.88 
 
 
473 aa  93.6  7e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.186537  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0313  Na+/H+ antiporter  23.88 
 
 
473 aa  93.6  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000868354  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0199  Na+/H+ antiporter NhaC  23.21 
 
 
494 aa  93.2  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1856  Na+/H+ antiporter NhaC  27.2 
 
 
484 aa  92.4  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1967  Na+/H+ antiporter NhaC  27.2 
 
 
484 aa  92.4  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02004  putative Na+/H+ antiporter NnaC  22.73 
 
 
491 aa  92.8  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.194925  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0388  Na+/H+ antiporter NhaC  23.63 
 
 
473 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0450556  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3649  Na+/H+ antiporter NhaC  25.06 
 
 
488 aa  92.4  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0435  Na+/H+ antiporter NhaC  23.76 
 
 
473 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00534613  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0435  Na+/H+ antiporter NhaC  23.76 
 
 
473 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1635  Na+/H+ antiporter NhaC  22.01 
 
 
467 aa  90.9  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0565201  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0372  Na+/H+ antiporter NhaC  23.63 
 
 
473 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1414  Na+/H+ antiporter NhaC  21.04 
 
 
467 aa  90.5  6e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0300822  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0326  Na+/H+ antiporter NhaC  23.54 
 
 
473 aa  89.7  9e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000241995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0341  Na+/H+ antiporter NhaC  23.54 
 
 
473 aa  89.7  9e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.142546  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0321  Na+/H+ antiporter NhaC  23.27 
 
 
473 aa  89.7  9e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2709  Na+/H+ antiporter NhaC  22.05 
 
 
480 aa  89.7  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0736  Na+/H+ antiporter NhaC  22.8 
 
 
467 aa  89.4  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000132088  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1834  Na+/H+ antiporter NhaC  24.37 
 
 
463 aa  89.7  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00796766  normal  0.538801 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1780  Na+/H+ antiporter NhaC  20.91 
 
 
467 aa  89.7  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.714234  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4931  Na+/H+ antiporter NhaC  23.35 
 
 
473 aa  89.7  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.312276  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1840  Na+/H+ antiporter NhaC  21.16 
 
 
467 aa  89  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1415  Na+/H+ antiporter NhaC  23.72 
 
 
502 aa  89  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3564  Na+/H+ antiporter NhaC  20.68 
 
 
467 aa  89  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1636  Na+/H+ antiporter NhaC  21.04 
 
 
467 aa  88.2  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00822114  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1614  Na+/H+ antiporter (NhaC)  21.04 
 
 
467 aa  88.2  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.213996  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1586  Na+/H+ antiporter  21.04 
 
 
467 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1766  Na+/H+ antiporter NhaC  21.04 
 
 
467 aa  88.2  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1894  Na+/H+ antiporter NhaC  21.04 
 
 
467 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115106  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1816  Na+/H+ antiporter NhaC  21.04 
 
 
467 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03793  Na+/H+ antiporter, NhaC family protein  22.43 
 
 
495 aa  87.8  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00082  Na+/H+ antiporter NhaC  24.44 
 
 
465 aa  87.4  5e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1995  Na+/H+ antiporter NhaC  22.7 
 
 
506 aa  87  6e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00594855  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3617  Na+/H+ antiporter NhaC  25.71 
 
 
479 aa  87  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.207119 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1622  Na+/H+ antiporter  20.74 
 
 
481 aa  84.3  0.000000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000132012  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0166  Na+/H+ antiporter NhaC  22.05 
 
 
472 aa  84  0.000000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2324  Na+/H+ antiporter NhaC  23.19 
 
 
466 aa  83.6  0.000000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2367  Na+/H+ antiporter NhaC  23.19 
 
 
466 aa  83.6  0.000000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0481816  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03022  Na+/H+ antiporter  20.91 
 
 
478 aa  83.6  0.000000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0273  Na+/H+ antiporter NhaC  23.27 
 
 
475 aa  83.6  0.000000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0717657 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002927  Na+/H+ antiporter NhaC  20.45 
 
 
477 aa  83.2  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0434616  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2457  Na+/H+ antiporter NhaC  24.89 
 
 
494 aa  82  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4486  Na+/H+ antiporter NhaC  23.04 
 
 
514 aa  82  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1400  Na+/H+ antiporter NhaC  21.09 
 
 
509 aa  81.6  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.226086  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1043  Na+/H+ antiporter NhaC  22.09 
 
 
470 aa  81.6  0.00000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2723  Na+/H+ antiporter NhaC  21.87 
 
 
472 aa  81.3  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2671  Na+/H+ antiporter NhaC  22.67 
 
 
474 aa  79.3  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0475  Na+/H+ antiporter NhaC  23.57 
 
 
505 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0344  Na+/H+ antiporter NhaC  22.9 
 
 
506 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2636  Na+/H+ antiporter NhaC  21.91 
 
 
482 aa  78.2  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2832  Na+/H+ antiporter NhaC  28.38 
 
 
496 aa  76.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.164293 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0133  NahC family Na(+)/H(+) antiporter  23.47 
 
 
496 aa  75.9  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2296  Na+/H+ antiporter NhaC  24.55 
 
 
487 aa  75.1  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.634393 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3531  Na+/H+ antiporter NhaC  23.1 
 
 
477 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0661235 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2651  Na+/H+ antiporter NhaC  22.2 
 
 
464 aa  73.9  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3226  Na+/H+ antiporter NhaC  23.98 
 
 
465 aa  73.2  0.000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1725  Na+/H+ antiporter NhaC  22.46 
 
 
482 aa  73.2  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0475  Na+/H+ antiporter NhaC  23.96 
 
 
509 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0490  Na+/H+ antiporter NhaC  22.83 
 
 
499 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12548  Na+/H+ antiporter  26.53 
 
 
501 aa  68.6  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.678652  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0226  Na+/H+ antiporter NhaC  21.63 
 
 
494 aa  67  0.0000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117171  normal  0.603299 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1881  Na+/H+ antiporter NhaC  20.22 
 
 
465 aa  65.5  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4039  Na+/H+ antiporter NhaC  23.87 
 
 
491 aa  63.9  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2609  Na+/H+ antiporter NhaC  24.21 
 
 
478 aa  63.5  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2809  Na+/H+ antiporter NhaC  25.35 
 
 
492 aa  61.2  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0607804  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3405  Na+/H+ antiporter NhaC  31.39 
 
 
491 aa  60.8  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.190303  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>