246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1881 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1881  Na+/H+ antiporter NhaC  100 
 
 
465 aa  932    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2324  Na+/H+ antiporter NhaC  76.96 
 
 
466 aa  706    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2367  Na+/H+ antiporter NhaC  77.17 
 
 
466 aa  707    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0481816  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0793  Na(+)/H(+) antiporter  36.5 
 
 
469 aa  336  5e-91  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1609  sodium/proton antiporter  38.72 
 
 
484 aa  329  6e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0177  Na+/H+ antiporter NhaC  36.97 
 
 
471 aa  323  4e-87  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.286543  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0184  Na+/H+ antiporter NhaC  37.04 
 
 
470 aa  320  5e-86  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0528403  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1856  Na+/H+ antiporter NhaC  38.38 
 
 
484 aa  316  5e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1967  Na+/H+ antiporter NhaC  38.38 
 
 
484 aa  316  5e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1733  Na+/H+ antiporter NhaC  36.97 
 
 
483 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1609  Na+/H+ antiporter NhaC  36.97 
 
 
483 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1787  Na+/H+ antiporter NhaC  36.75 
 
 
483 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1668  Na+/H+ antiporter NhaC  36.97 
 
 
483 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1670  Na+/H+ antiporter NhaC  36.97 
 
 
483 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3617  Na+/H+ antiporter NhaC  37.28 
 
 
479 aa  307  3e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.207119 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1400  Na+/H+ antiporter NhaC  34.77 
 
 
509 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.226086  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4869  Na+/H+ antiporter IbeT  35.06 
 
 
467 aa  281  2e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1629  Na+/H+ antiporter NhaC  33.19 
 
 
482 aa  273  6e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.835214  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1635  Na+/H+ antiporter NhaC  32.75 
 
 
467 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0565201  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2723  Na+/H+ antiporter NhaC  36.17 
 
 
472 aa  270  5.9999999999999995e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1840  Na+/H+ antiporter NhaC  32.6 
 
 
467 aa  267  2e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3564  Na+/H+ antiporter NhaC  32.82 
 
 
467 aa  268  2e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1780  Na+/H+ antiporter NhaC  32.6 
 
 
467 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.714234  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1636  Na+/H+ antiporter NhaC  32.6 
 
 
467 aa  265  2e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00822114  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1614  Na+/H+ antiporter (NhaC)  32.6 
 
 
467 aa  265  2e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.213996  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1586  Na+/H+ antiporter  32.6 
 
 
467 aa  265  2e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02004  putative Na+/H+ antiporter NnaC  32.78 
 
 
491 aa  264  2e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.194925  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1766  Na+/H+ antiporter NhaC  32.6 
 
 
467 aa  265  2e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1894  Na+/H+ antiporter NhaC  32.6 
 
 
467 aa  265  2e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115106  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1816  Na+/H+ antiporter NhaC  32.6 
 
 
467 aa  265  2e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1725  Na+/H+ antiporter NhaC  32.39 
 
 
482 aa  263  4.999999999999999e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1414  Na+/H+ antiporter NhaC  32.82 
 
 
467 aa  262  1e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0300822  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1834  Na+/H+ antiporter NhaC  33.4 
 
 
463 aa  258  2e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00796766  normal  0.538801 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4486  Na+/H+ antiporter NhaC  32.77 
 
 
514 aa  258  2e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0199  Na+/H+ antiporter NhaC  32.7 
 
 
494 aa  256  5e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2809  Na+/H+ antiporter NhaC  32.99 
 
 
492 aa  255  1.0000000000000001e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0607804  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2159  Na+/H+ antiporter NhaC  32.01 
 
 
484 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.318681  normal  0.208932 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0344  Na+/H+ antiporter NhaC  30.93 
 
 
506 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1995  Na+/H+ antiporter NhaC  34.53 
 
 
506 aa  254  3e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00594855  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2552  Na+/H+ antiporter NhaC  32.91 
 
 
463 aa  252  8.000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0798211 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0475  Na+/H+ antiporter NhaC  32.02 
 
 
505 aa  251  2e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0273  Na+/H+ antiporter NhaC  32.04 
 
 
475 aa  249  6e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0717657 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3226  Na+/H+ antiporter NhaC  32.26 
 
 
465 aa  249  9e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0490  Na+/H+ antiporter NhaC  30.52 
 
 
499 aa  248  1e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0475  Na+/H+ antiporter NhaC  32.09 
 
 
509 aa  248  1e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2457  Na+/H+ antiporter NhaC  30.11 
 
 
494 aa  248  1e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3405  Na+/H+ antiporter NhaC  31.54 
 
 
491 aa  247  4e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.190303  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2651  Na+/H+ antiporter NhaC  32.17 
 
 
464 aa  246  8e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1769  Na+/H+ antiporter NhaC  33.03 
 
 
496 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.679407  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0461  Na+/H+ antiporter NhaC  33.41 
 
 
483 aa  244  3e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17400  Na+ antiporter NhaC  31.3 
 
 
488 aa  243  5e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.694784  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2820  Na+/H+ antiporter NhaC  34.15 
 
 
457 aa  241  2e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.609382  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00082  Na+/H+ antiporter NhaC  33.26 
 
 
465 aa  241  2.9999999999999997e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0896  Na+/H+ antiporter NhaC  30.44 
 
 
489 aa  238  2e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2476  Na+/H+ antiporter NhaC  31.72 
 
 
502 aa  237  3e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.629323  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0388  Na+/H+ antiporter NhaC  33.26 
 
 
473 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0450556  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0326  Na+/H+ antiporter NhaC  32.45 
 
 
473 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000241995  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0310  Na+/H+ antiporter  32.23 
 
 
473 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.186537  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0313  Na+/H+ antiporter  32.23 
 
 
473 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000868354  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0133  NahC family Na(+)/H(+) antiporter  33.26 
 
 
496 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0341  Na+/H+ antiporter NhaC  32.45 
 
 
473 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.142546  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0372  Na+/H+ antiporter NhaC  32.45 
 
 
473 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0736  Na+/H+ antiporter NhaC  29.46 
 
 
467 aa  234  2.0000000000000002e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000132088  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0321  Na+/H+ antiporter NhaC  34.29 
 
 
473 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4931  Na+/H+ antiporter NhaC  33.26 
 
 
473 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.312276  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0435  Na+/H+ antiporter NhaC  32.23 
 
 
473 aa  231  2e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00534613  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0435  Na+/H+ antiporter NhaC  32.23 
 
 
473 aa  231  2e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2832  Na+/H+ antiporter NhaC  32.8 
 
 
496 aa  231  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.164293 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002927  Na+/H+ antiporter NhaC  31.41 
 
 
477 aa  225  1e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0434616  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03793  Na+/H+ antiporter, NhaC family protein  30.32 
 
 
495 aa  224  3e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1622  Na+/H+ antiporter  29.09 
 
 
481 aa  224  3e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000132012  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12548  Na+/H+ antiporter  31.83 
 
 
501 aa  224  3e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.678652  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3531  Na+/H+ antiporter NhaC  32.74 
 
 
477 aa  224  3e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0661235 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3953  Na+/H+ antiporter NhaC  32.77 
 
 
457 aa  224  4e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2006  Na+/H+ antiporter  30.51 
 
 
451 aa  223  4e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.16502  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03022  Na+/H+ antiporter  30.95 
 
 
478 aa  222  9e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4232  Na+/H+ antiporter NhaC  32.52 
 
 
457 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845886  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1004  Na+/H+ antiporter NhaC  32.52 
 
 
457 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2636  Na+/H+ antiporter NhaC  30.22 
 
 
482 aa  221  1.9999999999999999e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2671  Na+/H+ antiporter NhaC  30.54 
 
 
474 aa  221  3e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0548  Na+/H+ antiporter NhaC  31.22 
 
 
510 aa  220  3.9999999999999997e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0362545  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1415  Na+/H+ antiporter NhaC  29.91 
 
 
502 aa  219  6e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3877  Na+/H+ antiporter  32.52 
 
 
457 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.335407  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4030  Na+/H+ antiporter NhaC  32.52 
 
 
457 aa  219  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.623571  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3863  Na+/H+ antiporter  32.52 
 
 
457 aa  219  1e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4345  Na+/H+ antiporter NhaC  32.52 
 
 
457 aa  219  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4146  Na+/H+ antiporter NhaC  32.52 
 
 
457 aa  219  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4193  Na+/H+ antiporter NhaC  32.28 
 
 
457 aa  218  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2709  Na+/H+ antiporter NhaC  29.16 
 
 
480 aa  218  2e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4256  Na+/H+ antiporter NhaC  32.28 
 
 
457 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3649  Na+/H+ antiporter NhaC  29.2 
 
 
488 aa  214  2.9999999999999995e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1400  Na+/H+ antiporter NhaC  31.87 
 
 
510 aa  211  2e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000509696  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2609  Na+/H+ antiporter NhaC  27.84 
 
 
478 aa  209  1e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1552  Na+/H+ antiporter NhaC  29.85 
 
 
474 aa  206  6e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1829  Na+/H+ antiporter NhaC  31.3 
 
 
461 aa  203  5e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1043  Na+/H+ antiporter NhaC  28.19 
 
 
470 aa  200  3.9999999999999996e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1496  Na+/H+ antiporter  31.22 
 
 
458 aa  198  2.0000000000000003e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000011565  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4039  Na+/H+ antiporter NhaC  28.17 
 
 
491 aa  196  9e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12540  Na+ antiporter NhaC  29.3 
 
 
475 aa  194  2e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.859822 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0226  Na+/H+ antiporter NhaC  28.43 
 
 
494 aa  193  4e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117171  normal  0.603299 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>