30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0454 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0454  preprotein translocase subunit  100 
 
 
145 aa  292  1e-78  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00883496  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0835  preprotein translocase, YajC subunit  57.61 
 
 
133 aa  90.5  7e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1288  protein translocase subunit yajC  37.66 
 
 
120 aa  61.2  0.000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1917  preprotein translocase subunit YajC  35.37 
 
 
113 aa  56.6  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000185631  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0530  protein translocase subunit yajC  32.14 
 
 
154 aa  56.6  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1669  preprotein translocase, YajC subunit  34.26 
 
 
132 aa  55.5  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.698269  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1797  preprotein translocase, YajC subunit  34.07 
 
 
128 aa  53.1  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.284758  normal  0.10344 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0377  protein translocase subunit yajC  32.2 
 
 
120 aa  50.8  0.000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.26742  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1367  preprotein translocase, YajC subunit  28.89 
 
 
129 aa  50.4  0.000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.263653 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2436  hypothetical protein  41.43 
 
 
110 aa  48.9  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000321077  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2355  preprotein translocase, YajC subunit  29.87 
 
 
159 aa  47.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.458983  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1695  preprotein translocase, YajC subunit  31.08 
 
 
86 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1728  preprotein translocase, YajC subunit  31.08 
 
 
86 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.136772  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2646  preprotein translocase, YajC subunit  40.54 
 
 
108 aa  46.2  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808918  hitchhiker  0.00137205 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1801  preprotein translocase, YajC subunit  31.58 
 
 
112 aa  46.2  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0543558  hitchhiker  0.0000220066 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0416  preprotein translocase subunit YajC  31.65 
 
 
150 aa  45.4  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12870  preprotein translocase, YajC subunit  26.76 
 
 
152 aa  45.4  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.195332  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2030  preprotein translocase, YajC subunit  30.67 
 
 
181 aa  45.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000255015 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12280  preprotein translocase, YajC subunit  33.78 
 
 
91 aa  44.3  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107658  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1811  preprotein translocase, YajC subunit  30.49 
 
 
111 aa  43.9  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.690098  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2092  protein translocase subunit yajC  37.04 
 
 
102 aa  43.9  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0243  preprotein translocase, YajC subunit, putative  31.11 
 
 
112 aa  43.9  0.0008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000181073  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0834  preprotein translocase subunit YajC  36.59 
 
 
111 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.550481  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4344  preprotein translocase subunit YajC  36.59 
 
 
111 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000136476 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0877  preprotein translocase subunit YajC  36.59 
 
 
111 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.203563 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0864  preprotein translocase subunit YajC  36.59 
 
 
111 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.226856  normal  0.522349 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0108  hypothetical protein  27.5 
 
 
118 aa  42  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0147  preprotein translocase, YajC subunit  31.33 
 
 
101 aa  41.2  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000391893  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1995  preprotein translocase, YajC subunit  28.05 
 
 
119 aa  40.8  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0113559 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12608  preprotein translocase subunit YajC  23.93 
 
 
115 aa  40.8  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0597309  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>