152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_2885 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_2885  hypothetical protein  100 
 
 
143 aa  295  2e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.101704  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2582  hypothetical protein  96.5 
 
 
143 aa  287  4e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.532005  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2661  hypothetical protein  96.5 
 
 
143 aa  286  8e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189501  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2855  hypothetical protein  96.5 
 
 
143 aa  286  8e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.266671  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2860  hypothetical protein  96.5 
 
 
143 aa  286  8e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00728659 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2902  hypothetical protein  95.8 
 
 
143 aa  284  2e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1291  hypothetical protein  44.2 
 
 
141 aa  120  7e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4168  hypothetical protein  42.45 
 
 
142 aa  117  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.250781  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4270  hypothetical protein  39.86 
 
 
141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.372249  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4804  hypothetical protein  42.75 
 
 
141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.558671  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6907  hypothetical protein  44.85 
 
 
139 aa  106  8.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.373552 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1001  cytidine deaminase  34.96 
 
 
137 aa  81.6  0.000000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1508  cytidine deaminase  40 
 
 
129 aa  80.1  0.000000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0045  cytidine deaminase  31.82 
 
 
127 aa  79.7  0.00000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.51644  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0011  cytidine deaminase  33.08 
 
 
127 aa  79.3  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3635  cytidine deaminase  33.87 
 
 
142 aa  75.5  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.825648 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0081  cytidine deaminase  32.81 
 
 
132 aa  75.1  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000394049  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1068  cytidine deaminase  31.06 
 
 
128 aa  73.9  0.0000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1085  cytidine deaminase  29.13 
 
 
138 aa  73.2  0.000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0042  cytidine deaminase  29.13 
 
 
131 aa  72.8  0.000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0173738 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0081  cytidine deaminase  32.81 
 
 
132 aa  72  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000436242  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1028  cytidine deaminase  32.33 
 
 
132 aa  70.5  0.000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12520  cytidine deaminase  33.86 
 
 
133 aa  68.9  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2422  cytidine deaminase  32.48 
 
 
159 aa  68.6  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1469  cytidine deaminase  29.63 
 
 
388 aa  68.6  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.127234  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1203  cytidine deaminase  29.01 
 
 
138 aa  68.2  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0287032  normal  0.397725 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2480  cytidine deaminase  30.22 
 
 
142 aa  67  0.00000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548526  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1324  cytidine deaminase  29.63 
 
 
131 aa  67  0.00000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0294653  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1931  cytidine deaminase  35.04 
 
 
136 aa  66.6  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0599  cytidine deaminase  29.2 
 
 
129 aa  65.5  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4587  cytidine deaminase  31.85 
 
 
135 aa  65.5  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00127227  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2005  cytidine deaminase  31.54 
 
 
131 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000237527  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0855  cytidine deaminase  29.41 
 
 
132 aa  63.2  0.000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4191  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  27.27 
 
 
147 aa  62.8  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1978  cytidine deaminase  31.25 
 
 
131 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00152916  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1757  cytidine deaminase  30.77 
 
 
131 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000261998  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1735  cytidine deaminase  30.77 
 
 
131 aa  62.4  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000541202  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1706  cytidine deaminase  30.77 
 
 
131 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000355072  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1895  cytidine deaminase  30.77 
 
 
131 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000738736  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1930  cytidine deaminase  30.77 
 
 
131 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.03425e-50 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1470  cytidine deaminase  31.5 
 
 
131 aa  62  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000737931  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4152  cytidine deaminase  34.09 
 
 
132 aa  62.8  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000232365  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3448  cytidine deaminase  31.25 
 
 
131 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000204883 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1898  cytidine deaminase  31.25 
 
 
131 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000087188  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1777  cytidine deaminase  28.57 
 
 
135 aa  61.2  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.172773  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1755  cytidine deaminase  30.77 
 
 
131 aa  60.8  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000792295  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1286  cytidine deaminase, homotetrameric  25 
 
 
149 aa  60.5  0.000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.887812  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4418  cytidine deaminase  33.62 
 
 
132 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0143762  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4381  cytidine deaminase  33.62 
 
 
132 aa  60.5  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00104367  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01844  Cytidine deaminase  30.97 
 
 
157 aa  60.1  0.000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.595326  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11146  cytidine deaminase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02770)  25.71 
 
 
138 aa  60.1  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152404  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0953  cytidine deaminase  31.86 
 
 
129 aa  59.7  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.234119  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4200  cytidine deaminase  33.62 
 
 
132 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0101414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4038  cytidine deaminase  33.62 
 
 
132 aa  60.1  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000126639  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4048  cytidine deaminase  33.62 
 
 
132 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000101486  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4434  cytidine deaminase  33.62 
 
 
132 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000171056  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4525  cytidine deaminase  33.62 
 
 
132 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00234494  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4323  cytidine deaminase  33.62 
 
 
132 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09373e-57 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0511  cytidine deaminase  27.48 
 
 
139 aa  59.7  0.00000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1828  cytidine deaminase  25.89 
 
 
132 aa  59.7  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0818  cytidine deaminase  33.62 
 
 
132 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000529216  decreased coverage  5.58138e-23 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0754  cytidine deaminase  32.41 
 
 
175 aa  59.3  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1582  cytidine deaminase  28.68 
 
 
138 aa  57.4  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.993126  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39066  predicted protein  24.63 
 
 
151 aa  57.4  0.00000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1969  cytidine deaminase  24.43 
 
 
139 aa  57  0.00000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0331  cytidine deaminase  28.91 
 
 
131 aa  57  0.00000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3067  cytidine deaminase  32.28 
 
 
130 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00456588  decreased coverage  0.0000000642957 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0578  cytidine deaminase  25.95 
 
 
129 aa  55.5  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0739  cytidine deaminase  28.7 
 
 
137 aa  55.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0939  cytidine deaminase  25.4 
 
 
133 aa  55.1  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.743414  normal  0.851216 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2536  cytidine deaminase  23.74 
 
 
136 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.289649  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1386  cytidine deaminase  26.61 
 
 
133 aa  55.1  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.67349  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1390  hypothetical protein  27.13 
 
 
131 aa  54.3  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1594  cytidine deaminase  31.82 
 
 
134 aa  54.3  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1794  cytidine deaminase  28.91 
 
 
133 aa  54.3  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000395488  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0247  cytidine deaminase  32.31 
 
 
130 aa  54.3  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.710107  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2739  cytidine deaminase  25 
 
 
129 aa  54.3  0.0000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3099  cytidine deaminase  27.13 
 
 
138 aa  53.9  0.0000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.296617 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1606  hypothetical protein  27.13 
 
 
131 aa  53.5  0.0000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0827  cytidine deaminase  31.36 
 
 
140 aa  53.1  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0111434  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0137  cytidine deaminase  28.24 
 
 
126 aa  53.5  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2223  cytidine deaminase  30.47 
 
 
131 aa  53.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3340  cytidine deaminase  25 
 
 
152 aa  53.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.568351 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0636  cytidine deaminase  27.86 
 
 
139 aa  53.1  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00119957 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0407  cytidine deaminase  29.41 
 
 
135 aa  53.1  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1393  cytidine deaminase  28.46 
 
 
125 aa  52  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.245306  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4276  cytidine deaminase  29.01 
 
 
139 aa  51.6  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1562  cytidine deaminase  22.12 
 
 
132 aa  51.6  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.546128  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2867  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  28.15 
 
 
135 aa  51.2  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0275  cytidine deaminase  30.71 
 
 
130 aa  51.6  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0443  cytidine deaminase  25.38 
 
 
129 aa  51.2  0.000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.617897  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2657  cytidine deaminase  28.57 
 
 
135 aa  51.2  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.697109  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2761  cytidine deaminase  32.26 
 
 
135 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4396  cytidine deaminase  26.72 
 
 
136 aa  50.4  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.300415  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2273  cytidine deaminase  24.79 
 
 
132 aa  50.1  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1988  cytidine deaminase  23.93 
 
 
132 aa  49.7  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1731  cytidine deaminase  25 
 
 
132 aa  50.1  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4462  cytidine deaminase  29.06 
 
 
129 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.238856  normal  0.450546 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3376  cytidine deaminase  27.21 
 
 
132 aa  50.1  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.212028  normal  0.0792246 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1634  cytidine deaminase  28.95 
 
 
160 aa  48.9  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.574132  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>