35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5535 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5535  hypothetical protein  100 
 
 		 623 aa  1201    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0408605 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1333  hypothetical protein  46.39 
 
 		 587 aa  461  9.999999999999999e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.367771  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1101  hypothetical protein  58.1 
 
 		 501 aa  326  6e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.322758 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1669  hypothetical protein  43.06 
 
 		 535 aa  240  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.118231 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4453  hypothetical protein  41.94 
 
 		 535 aa  234  3e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.74365  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2544  hypothetical protein  39.38 
 
 		 497 aa  232  2e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.337624 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3815  hypothetical protein  42.22 
 
 		 535 aa  230  6e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.108699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1487  hypothetical protein  42.43 
 
 		 525 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.707292 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5545  hypothetical protein  34.02 
 
 		 532 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.352354 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1104  hypothetical protein  46.2 
 
 		 523 aa  110  8.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.926496  normal  0.217444 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0915  hypothetical protein  38.1 
 
 		 597 aa  109  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.342242  normal  0.94369 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0952  hypothetical protein  38.1 
 
 		 597 aa  108  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0111179 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0891  hypothetical protein  38.54 
 
 		 597 aa  104  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2015  hypothetical protein  36.98 
 
 		 587 aa  103  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5537  putative flagellar hook protein flgE  54.55 
 
 		 601 aa  101  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0639187 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2312  hypothetical protein  34.29 
 
 		 599 aa  97.4  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4186  hypothetical protein  33.68 
 
 		 602 aa  93.6  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.286802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3817  hypothetical protein  50 
 
 		 598 aa  92.8  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1485  hypothetical protein  41.42 
 
 		 599 aa  84  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4455  protein of unknown function DUF1078 domain protein  43.9 
 
 		 598 aa  80.9  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7240  hypothetical protein  31.14 
 
 		 588 aa  73.6  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.510618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1099  flagellar basal body rod protein, FlaE  37.5 
 
 		 613 aa  72.4  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.216398 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5527  putative flagellin protein, C-terminus  39.49 
 
 		 523 aa  70.1  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1331  flagellar basal body FlaE  37.78 
 
 		 615 aa  64.7  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5530  putative flagellin protein, C-terminus  40.65 
 
 		 516 aa  57.8  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.567075 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0522  hypothetical protein  39.34 
 
 		 522 aa  56.6  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0559459  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3800  flagellin  41.94 
 
 		 886 aa  53.5  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.139024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5528  putative flagellin protein, C-terminus  37.7 
 
 		 514 aa  52.8  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.757214 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1105  hypothetical protein  40.16 
 
 		 536 aa  52.4  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0838477  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4438  flagellin  34.05 
 
 		 886 aa  51.2  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6508  flagellar hook-associated protein FlgL  34.62 
 
 		 344 aa  50.4  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.632547  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1667  hypothetical protein  38.78 
 
 		 610 aa  49.7  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.551124  normal  0.12233 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1650  flagellar hook-associated protein 3  28.17 
 
 		 297 aa  47.8  0.0006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1337  hypothetical protein  37.59 
 
 		 537 aa  45.1  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0277  flagellar hook-associated protein FlgL  22.58 
 
 		 349 aa  44.3  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>