22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7240 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7240  hypothetical protein  100 
 
 		 588 aa  1143    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.510618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2015  hypothetical protein  56.29 
 
 		 587 aa  614  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0915  hypothetical protein  41.49 
 
 		 597 aa  354  2e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.342242  normal  0.94369 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0952  hypothetical protein  41.49 
 
 		 597 aa  354  2e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0111179 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0891  hypothetical protein  41.6 
 
 		 597 aa  349  6e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2312  hypothetical protein  40.1 
 
 		 599 aa  312  9e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4186  hypothetical protein  38.86 
 
 		 602 aa  276  8e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.286802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1333  hypothetical protein  31.88 
 
 		 587 aa  214  4.9999999999999996e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.367771  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5545  hypothetical protein  37.07 
 
 		 532 aa  162  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.352354 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1101  hypothetical protein  34.75 
 
 		 501 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.322758 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2544  hypothetical protein  31.06 
 
 		 497 aa  107  7e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.337624 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4453  hypothetical protein  30.34 
 
 		 535 aa  100  6e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.74365  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1669  hypothetical protein  32.3 
 
 		 535 aa  99  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.118231 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1487  hypothetical protein  31.36 
 
 		 525 aa  92.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.707292 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3815  hypothetical protein  31.96 
 
 		 535 aa  90.9  6e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.108699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5535  hypothetical protein  31.14 
 
 		 623 aa  73.6  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0408605 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1120  flagellar hook-associated protein FlgL  28.83 
 
 		 360 aa  48.1  0.0004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0692  flagellin, putative  25.9 
 
 		 304 aa  47  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.914125 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3377  flagellar hook-associated protein FlgL  27.61 
 
 		 336 aa  45.8  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0766  flagellar hook-associated protein FlgL  28.48 
 
 		 355 aa  44.7  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3555  flagellar hook-associated protein FlgL  28.35 
 
 		 348 aa  44.3  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6508  flagellar hook-associated protein FlgL  30.65 
 
 		 344 aa  43.9  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.632547  normal  0.0167613 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>