20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1669 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3815  hypothetical protein  85.42 
 
 		 535 aa  865    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.108699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1669  hypothetical protein  100 
 
 		 535 aa  1064    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.118231 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4453  hypothetical protein  80.37 
 
 		 535 aa  837    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.74365  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1487  hypothetical protein  61.58 
 
 		 525 aa  601  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.707292 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1101  hypothetical protein  49.16 
 
 		 501 aa  443  1e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.322758 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2544  hypothetical protein  38.29 
 
 		 497 aa  277  3e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.337624 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1333  hypothetical protein  48 
 
 		 587 aa  270  5e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.367771  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5535  hypothetical protein  43.06 
 
 		 623 aa  258  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0408605 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2015  hypothetical protein  28.38 
 
 		 587 aa  173  9e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5545  hypothetical protein  30.63 
 
 		 532 aa  159  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.352354 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0915  hypothetical protein  37.46 
 
 		 597 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.342242  normal  0.94369 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0952  hypothetical protein  37.46 
 
 		 597 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0111179 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0891  hypothetical protein  37.46 
 
 		 597 aa  130  7.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2312  hypothetical protein  36.3 
 
 		 599 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4186  hypothetical protein  35.92 
 
 		 602 aa  114  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.286802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7240  hypothetical protein  32.3 
 
 		 588 aa  106  9e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.510618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6508  flagellar hook-associated protein FlgL  39 
 
 		 344 aa  58.5  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.632547  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0277  flagellar hook-associated protein FlgL  26 
 
 		 349 aa  43.9  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0685  flagellar hook-associated protein FlgL  30.67 
 
 		 350 aa  43.5  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0281521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0696  flagellar hook-associated protein FlgL  30.67 
 
 		 350 aa  43.5  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.136395  normal  0.134293 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>