21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2312 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_2312  hypothetical protein  100 
 
 
599 aa  1155    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4186  hypothetical protein  66.72 
 
 
602 aa  684    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.286802  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0915  hypothetical protein  47.52 
 
 
597 aa  458  1e-127  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.342242  normal  0.94369 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0952  hypothetical protein  47.52 
 
 
597 aa  456  1e-127  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0111179 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0891  hypothetical protein  47.35 
 
 
597 aa  449  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2015  hypothetical protein  41.59 
 
 
587 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7240  hypothetical protein  41.55 
 
 
588 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.510618  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1333  hypothetical protein  34.93 
 
 
587 aa  258  2e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.367771  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5545  hypothetical protein  42.16 
 
 
532 aa  196  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.352354 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5535  hypothetical protein  31.03 
 
 
623 aa  181  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0408605 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1101  hypothetical protein  35.55 
 
 
501 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.322758 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4453  hypothetical protein  35.94 
 
 
535 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.74365  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2544  hypothetical protein  33.54 
 
 
497 aa  135  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.337624 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3815  hypothetical protein  36.62 
 
 
535 aa  128  3e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.108699  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1669  hypothetical protein  36.88 
 
 
535 aa  127  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.118231 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1487  hypothetical protein  37.76 
 
 
525 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.707292 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2738  hypothetical protein  31.91 
 
 
333 aa  54.3  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3377  flagellar hook-associated protein FlgL  28.22 
 
 
336 aa  48.5  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1305  putative flagellar hook-associated protein  27.75 
 
 
333 aa  47.4  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2965  putative flagellar hook-associated protein  27.75 
 
 
333 aa  46.2  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.481259 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6508  flagellar hook-associated protein FlgL  27.95 
 
 
344 aa  44.3  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.632547  normal  0.0167613 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>