23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2015 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2015  hypothetical protein  100 
 
 		 587 aa  1157    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7240  hypothetical protein  56.29 
 
 		 588 aa  634  1e-180  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.510618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0915  hypothetical protein  44.66 
 
 		 597 aa  411  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.342242  normal  0.94369 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0891  hypothetical protein  45.56 
 
 		 597 aa  410  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0952  hypothetical protein  44.66 
 
 		 597 aa  409  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0111179 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2312  hypothetical protein  40.78 
 
 		 599 aa  357  5e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4186  hypothetical protein  40.2 
 
 		 602 aa  312  1e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.286802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1333  hypothetical protein  32.27 
 
 		 587 aa  230  4e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.367771  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5545  hypothetical protein  40.96 
 
 		 532 aa  206  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.352354 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1669  hypothetical protein  28.3 
 
 		 535 aa  170  7e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.118231 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1487  hypothetical protein  29.08 
 
 		 525 aa  159  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.707292 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1101  hypothetical protein  37.41 
 
 		 501 aa  144  6e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.322758 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2544  hypothetical protein  33.33 
 
 		 497 aa  119  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.337624 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4453  hypothetical protein  31.21 
 
 		 535 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.74365  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3815  hypothetical protein  31.56 
 
 		 535 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.108699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5535  hypothetical protein  36.98 
 
 		 623 aa  108  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0408605 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0692  flagellin, putative  30.61 
 
 		 304 aa  58.9  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.914125 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6508  flagellar hook-associated protein FlgL  27.23 
 
 		 344 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.632547  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0044  flagellar hook-associated protein FlgL  38.81 
 
 		 347 aa  55.1  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2941  flagellar hook-associated protein FlgL family protein  26.62 
 
 		 335 aa  52.8  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.383256  normal  0.308963 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3377  flagellar hook-associated protein FlgL  27.27 
 
 		 336 aa  48.5  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3555  flagellar hook-associated protein FlgL  27.78 
 
 		 348 aa  45.1  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0766  flagellar hook-associated protein FlgL  31.88 
 
 		 355 aa  45.1  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>