34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2941 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2941  flagellar hook-associated protein FlgL family protein  100 
 
 		 335 aa  673    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.383256  normal  0.308963 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1305  putative flagellar hook-associated protein  30.45 
 
 		 333 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2965  putative flagellar hook-associated protein  30.45 
 
 		 333 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.481259 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3377  flagellar hook-associated protein FlgL  30.95 
 
 		 336 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2698  putative flagellar hook-associated protein  31.34 
 
 		 339 aa  145  9e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4175  flagellar hook-associated protein FlgL family protein  28.87 
 
 		 336 aa  127  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2738  hypothetical protein  28.96 
 
 		 333 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0277  flagellar hook-associated protein FlgL  26.02 
 
 		 349 aa  73.2  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0372  flagellar hook-associated protein FlgL  27.61 
 
 		 350 aa  73.2  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6508  flagellar hook-associated protein FlgL  26.57 
 
 		 344 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.632547  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0340  flagellar hook-associated protein FlgL  26.2 
 
 		 350 aa  70.5  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.112309  normal  0.583206 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5249  flagellar hook-associated protein FlgL  25.47 
 
 		 348 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.490883 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1120  flagellar hook-associated protein FlgL  26.1 
 
 		 360 aa  60.8  0.00000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1705  flagellar hook-associated protein FlgL  25.63 
 
 		 351 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.173366 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0696  flagellar hook-associated protein FlgL  23.98 
 
 		 350 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.136395  normal  0.134293 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0685  flagellar hook-associated protein FlgL  23.98 
 
 		 350 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0281521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0716  flagellar hook-associated protein FlgL  23.96 
 
 		 303 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1042  flagellar hook-associated protein FlgL  23.78 
 
 		 351 aa  53.1  0.000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0659  flagellar hook-associated protein FlgL  23.82 
 
 		 350 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.404384 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1137  flagellar hook-associated protein FlgL  23.78 
 
 		 348 aa  53.1  0.000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.512733  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5529  flagellar hook-associated protein FlgL  25.47 
 
 		 348 aa  52.8  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0173454 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3555  flagellar hook-associated protein FlgL  24.82 
 
 		 348 aa  52.4  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1113  flagellar hook-associated protein FlgL  25 
 
 		 347 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.406024  normal  0.67515 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4186  hypothetical protein  27.91 
 
 		 602 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.286802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0278  flagellar hook-associated protein FlgL  24.12 
 
 		 350 aa  49.7  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.99362 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2544  hypothetical protein  26.29 
 
 		 497 aa  48.5  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.337624 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4191  flagellar hook-associated protein FlgL  23.48 
 
 		 348 aa  49.3  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.8937  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2015  hypothetical protein  26.62 
 
 		 587 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1333  hypothetical protein  24.22 
 
 		 587 aa  45.8  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.367771  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0915  hypothetical protein  24.05 
 
 		 597 aa  44.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.342242  normal  0.94369 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0952  hypothetical protein  24.05 
 
 		 597 aa  44.3  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0111179 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1101  hypothetical protein  25 
 
 		 501 aa  44.7  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.322758 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0766  flagellar hook-associated protein FlgL  19.94 
 
 		 355 aa  43.9  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0891  hypothetical protein  24.68 
 
 		 597 aa  43.5  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>