42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0716 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0716  flagellar hook-associated protein FlgL  100 
 
 		 303 aa  587  1e-167  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3169  flagellar hook-associated protein FlgL  68.67 
 
 		 302 aa  377  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.247991 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0875  flagellar hook-associated protein FlgL  61.33 
 
 		 303 aa  335  5.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0769  flagellar hook-associated protein FlgL  60.54 
 
 		 303 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.807924 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2528  flagellar hook-associated protein FlgL  34.53 
 
 		 296 aa  122  5e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.947437  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2853  hypothetical protein  29.3 
 
 		 515 aa  77  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0163673  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0692  flagellin, putative  24.28 
 
 		 304 aa  75.9  0.0000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.914125 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0747  flagellar hook-associated protein FlgL  25.91 
 
 		 305 aa  59.7  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2941  flagellar hook-associated protein FlgL family protein  23.21 
 
 		 335 aa  58.5  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.383256  normal  0.308963 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0603  flagellar hook-associated protein 3  22.19 
 
 		 292 aa  57.4  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.891148  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3042  flagellar hook-associated protein FlgL  23.47 
 
 		 298 aa  54.7  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.947446  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0277  flagellar hook-associated protein FlgL  27.21 
 
 		 349 aa  54.3  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0439  flagellin-like  25.48 
 
 		 294 aa  52.8  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2544  hypothetical protein  26.35 
 
 		 497 aa  52.8  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.337624 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2698  putative flagellar hook-associated protein  23.58 
 
 		 339 aa  52.8  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4098  flagellar hook-associated protein 3  25.22 
 
 		 298 aa  52  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2240  flagellar hook-associated protein 3  24.12 
 
 		 310 aa  51.6  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1006  flagellin, putative  23.81 
 
 		 307 aa  50.8  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.370705  normal  0.587131 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1333  hypothetical protein  33.58 
 
 		 587 aa  50.8  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.367771  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0392  flagellar hook-associated protein 3  23.08 
 
 		 298 aa  48.5  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0452  flagellar hook-associated protein FlgL  22.91 
 
 		 297 aa  48.5  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1101  hypothetical protein  28.46 
 
 		 501 aa  48.1  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.322758 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4191  flagellar hook-associated protein FlgL  32.35 
 
 		 348 aa  48.1  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.8937  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3227  flagellar hook-associated protein FlgL  22.73 
 
 		 297 aa  47.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3456  flagellar hook-associated protein 3  23.35 
 
 		 295 aa  47.8  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1674  flagellar hook-associated protein FlgL  23.19 
 
 		 315 aa  47.4  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0766  flagellar hook-associated protein FlgL  22.64 
 
 		 355 aa  46.6  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0096  flagellar hook-associated protein FlgL  22.47 
 
 		 309 aa  46.2  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3754  flagellar hook-associated protein 3  23.1 
 
 		 306 aa  46.2  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1137  flagellar hook-associated protein FlgL  25.34 
 
 		 348 aa  46.2  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.512733  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1042  flagellar hook-associated protein FlgL  25.34 
 
 		 351 aa  46.2  0.0007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1148  flagellar hook-filament junction protein  21.99 
 
 		 296 aa  46.2  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0865  flagellar hook-associated protein 3  22.19 
 
 		 304 aa  45.4  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2242  flagellar hook-associated protein FlgL  24.14 
 
 		 302 aa  45.4  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0021  flagellar hook-associated protein 3  22.47 
 
 		 301 aa  45.8  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2914  flagellar hook-associated protein FlgL  25.47 
 
 		 302 aa  44.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.481604  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0831  flagellar hook-associated protein 3  24.04 
 
 		 298 aa  45.1  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.795766  normal  0.995497 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3470  flagellar hook-associated protein FlgL  34.15 
 
 		 530 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0249  flagellar hook-associated protein FlgL  23.2 
 
 		 296 aa  43.5  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3479  flagellar hook-associated protein FlgL  22.81 
 
 		 358 aa  43.1  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.927973  normal  0.0673338 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2358  flagellar hook-associated protein 3  22.51 
 
 		 292 aa  43.1  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1113  flagellar hook-associated protein FlgL  22.33 
 
 		 347 aa  42.7  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.406024  normal  0.67515 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>