49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0875 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0875  flagellar hook-associated protein FlgL  100 
 
 		 303 aa  589  1e-167  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0769  flagellar hook-associated protein FlgL  73.6 
 
 		 303 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.807924 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3169  flagellar hook-associated protein FlgL  63.58 
 
 		 302 aa  352  2.9999999999999997e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.247991 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0716  flagellar hook-associated protein FlgL  61.33 
 
 		 303 aa  341  9e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2528  flagellar hook-associated protein FlgL  32.98 
 
 		 296 aa  124  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.947437  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0692  flagellin, putative  23.77 
 
 		 304 aa  75.9  0.0000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.914125 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2853  hypothetical protein  31.79 
 
 		 515 aa  65.9  0.0000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0163673  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3555  flagellar hook-associated protein FlgL  23.78 
 
 		 348 aa  63.2  0.000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3754  flagellar hook-associated protein 3  24.31 
 
 		 306 aa  62  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0329  flagellar hook-associated protein 3  27.04 
 
 		 295 aa  59.7  0.00000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0390  flagellar hook-associated protein 3  25.64 
 
 		 294 aa  58.5  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.133052  normal  0.988738 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4191  flagellar hook-associated protein FlgL  31.03 
 
 		 348 aa  58.9  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.8937  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1137  flagellar hook-associated protein FlgL  30.34 
 
 		 348 aa  56.6  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.512733  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1042  flagellar hook-associated protein FlgL  30.34 
 
 		 351 aa  56.6  0.0000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0392  flagellar hook-associated protein 3  25.09 
 
 		 298 aa  55.8  0.0000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0277  flagellar hook-associated protein FlgL  20.36 
 
 		 349 aa  55.5  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3838  flagellar hook-associated protein 3  23.15 
 
 		 306 aa  55.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0146959 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1535  flagellar hook-associated protein 3  26.67 
 
 		 312 aa  54.7  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2698  putative flagellar hook-associated protein  24.63 
 
 		 339 aa  53.1  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2941  flagellar hook-associated protein FlgL family protein  23.01 
 
 		 335 aa  52.4  0.000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.383256  normal  0.308963 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2242  flagellar hook-associated protein FlgL  25.27 
 
 		 302 aa  52.4  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1006  flagellin, putative  22.88 
 
 		 307 aa  52.4  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.370705  normal  0.587131 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1650  flagellar hook-associated protein 3  25.97 
 
 		 297 aa  50.8  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0766  flagellar hook-associated protein FlgL  24.69 
 
 		 355 aa  50.4  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1101  hypothetical protein  25.85 
 
 		 501 aa  50.8  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.322758 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0452  flagellar hook-associated protein FlgL  26.56 
 
 		 297 aa  50.8  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2738  hypothetical protein  26.69 
 
 		 333 aa  50.8  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1120  flagellar hook-associated protein FlgL  25.28 
 
 		 360 aa  50.1  0.00004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4098  flagellar hook-associated protein 3  32.04 
 
 		 298 aa  50.1  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0096  flagellar hook-associated protein FlgL  28.71 
 
 		 309 aa  49.3  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0603  flagellar hook-associated protein 3  21.7 
 
 		 292 aa  49.3  0.00009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.891148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0439  flagellin-like  31.07 
 
 		 294 aa  48.1  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1148  flagellar hook-filament junction protein  23.05 
 
 		 296 aa  47.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0671  flagellar hook-associated protein 3  24.81 
 
 		 305 aa  47  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0367286 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3042  flagellar hook-associated protein FlgL  20.93 
 
 		 298 aa  47  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.947446  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2203  flagellin-like protein  31.37 
 
 		 532 aa  45.8  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1333  hypothetical protein  24.49 
 
 		 587 aa  45.8  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.367771  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2965  putative flagellar hook-associated protein  24.8 
 
 		 333 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.481259 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3456  flagellar hook-associated protein 3  23.18 
 
 		 295 aa  45.4  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2544  hypothetical protein  21.53 
 
 		 497 aa  43.9  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.337624 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2015  hypothetical protein  35.62 
 
 		 587 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0842  flagellar hook-associated protein 3  24.66 
 
 		 304 aa  43.5  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0865  flagellar hook-associated protein 3  24.66 
 
 		 304 aa  43.5  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2235  flagellar hook-associated protein 3  26.26 
 
 		 328 aa  43.1  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000208019 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0831  flagellar hook-associated protein 3  25 
 
 		 298 aa  43.1  0.006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.795766  normal  0.995497 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2240  flagellar hook-associated protein 3  23.43 
 
 		 310 aa  42.7  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1674  flagellar hook-associated protein FlgL  27.18 
 
 		 315 aa  42.7  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3815  hypothetical protein  25.19 
 
 		 535 aa  42.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.108699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0273  lateral flagellar hook associated protein 3  24.33 
 
 		 309 aa  42.4  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.462118  normal  0.382201 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>