33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2738 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2738  hypothetical protein  100 
 
 		 333 aa  639    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1305  putative flagellar hook-associated protein  63.96 
 
 		 333 aa  409  1e-113  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2965  putative flagellar hook-associated protein  64.56 
 
 		 333 aa  410  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.481259 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2698  putative flagellar hook-associated protein  36.58 
 
 		 339 aa  179  9e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3377  flagellar hook-associated protein FlgL  32.54 
 
 		 336 aa  162  7e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2941  flagellar hook-associated protein FlgL family protein  29.25 
 
 		 335 aa  155  7e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.383256  normal  0.308963 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4175  flagellar hook-associated protein FlgL family protein  35.52 
 
 		 336 aa  145  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1120  flagellar hook-associated protein FlgL  28.63 
 
 		 360 aa  75.9  0.0000000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5249  flagellar hook-associated protein FlgL  27.46 
 
 		 348 aa  67  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.490883 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0766  flagellar hook-associated protein FlgL  25.14 
 
 		 355 aa  65.9  0.0000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0277  flagellar hook-associated protein FlgL  25.21 
 
 		 349 aa  63.5  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0340  flagellar hook-associated protein FlgL  23.39 
 
 		 350 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.112309  normal  0.583206 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0278  flagellar hook-associated protein FlgL  43.28 
 
 		 350 aa  61.6  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.99362 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5529  flagellar hook-associated protein FlgL  25.83 
 
 		 348 aa  61.2  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0173454 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0659  flagellar hook-associated protein FlgL  27.81 
 
 		 350 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.404384 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0696  flagellar hook-associated protein FlgL  27.62 
 
 		 350 aa  59.7  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.136395  normal  0.134293 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0685  flagellar hook-associated protein FlgL  26.8 
 
 		 350 aa  59.7  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0281521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4186  hypothetical protein  31.14 
 
 		 602 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.286802  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0372  flagellar hook-associated protein FlgL  24.05 
 
 		 350 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6508  flagellar hook-associated protein FlgL  28.27 
 
 		 344 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.632547  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0875  flagellar hook-associated protein FlgL  25.79 
 
 		 303 aa  53.5  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3169  flagellar hook-associated protein FlgL  29.86 
 
 		 302 aa  52.8  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.247991 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1137  flagellar hook-associated protein FlgL  30.65 
 
 		 348 aa  52.4  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.512733  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4191  flagellar hook-associated protein FlgL  41.79 
 
 		 348 aa  52.4  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.8937  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1042  flagellar hook-associated protein FlgL  30.65 
 
 		 351 aa  52.4  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3555  flagellar hook-associated protein FlgL  23.87 
 
 		 348 aa  51.2  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2312  hypothetical protein  31.91 
 
 		 599 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2544  hypothetical protein  27.52 
 
 		 497 aa  48.9  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.337624 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0891  hypothetical protein  28.41 
 
 		 597 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0044  flagellar hook-associated protein FlgL  24.5 
 
 		 347 aa  46.2  0.0008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0952  hypothetical protein  27.97 
 
 		 597 aa  43.1  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0111179 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0915  hypothetical protein  27.27 
 
 		 597 aa  42.7  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.342242  normal  0.94369 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0692  flagellin, putative  24.14 
 
 		 304 aa  42.4  0.01  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.914125 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>