28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0372 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0340  flagellar hook-associated protein FlgL  94.57 
 
 
350 aa  664    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.112309  normal  0.583206 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0372  flagellar hook-associated protein FlgL  100 
 
 
350 aa  702    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5249  flagellar hook-associated protein FlgL  62.57 
 
 
348 aa  432  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.490883 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5529  flagellar hook-associated protein FlgL  62.57 
 
 
348 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0173454 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0766  flagellar hook-associated protein FlgL  43.02 
 
 
355 aa  275  6e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0278  flagellar hook-associated protein FlgL  43.34 
 
 
350 aa  259  5.0000000000000005e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.99362 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0277  flagellar hook-associated protein FlgL  35.88 
 
 
349 aa  218  1e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1042  flagellar hook-associated protein FlgL  33.52 
 
 
351 aa  194  2e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1137  flagellar hook-associated protein FlgL  33.52 
 
 
348 aa  194  2e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.512733  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4191  flagellar hook-associated protein FlgL  33.52 
 
 
348 aa  191  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.8937  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6508  flagellar hook-associated protein FlgL  33.33 
 
 
344 aa  191  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.632547  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1113  flagellar hook-associated protein FlgL  34.83 
 
 
347 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.406024  normal  0.67515 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0685  flagellar hook-associated protein FlgL  30.23 
 
 
350 aa  167  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0281521  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0696  flagellar hook-associated protein FlgL  29.66 
 
 
350 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.136395  normal  0.134293 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3555  flagellar hook-associated protein FlgL  32.26 
 
 
348 aa  163  5.0000000000000005e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0044  flagellar hook-associated protein FlgL  30.2 
 
 
347 aa  145  1e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0659  flagellar hook-associated protein FlgL  29.1 
 
 
350 aa  144  3e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.404384 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1705  flagellar hook-associated protein FlgL  28.97 
 
 
351 aa  138  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.173366 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1120  flagellar hook-associated protein FlgL  27.61 
 
 
360 aa  132  7.999999999999999e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2941  flagellar hook-associated protein FlgL family protein  27.61 
 
 
335 aa  73.2  0.000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.383256  normal  0.308963 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3377  flagellar hook-associated protein FlgL  23.38 
 
 
336 aa  70.5  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2698  putative flagellar hook-associated protein  22.92 
 
 
339 aa  68.2  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1305  putative flagellar hook-associated protein  24.38 
 
 
333 aa  64.7  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2965  putative flagellar hook-associated protein  24.1 
 
 
333 aa  63.9  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.481259 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2738  hypothetical protein  34.25 
 
 
333 aa  50.1  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1148  flagellar hook-filament junction protein  38.04 
 
 
296 aa  45.1  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2544  hypothetical protein  27.08 
 
 
497 aa  44.7  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.337624 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0692  flagellin, putative  21.84 
 
 
304 aa  43.9  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.914125 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>