28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4186 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_4186  hypothetical protein  100 
 
 
602 aa  1157    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.286802  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2312  hypothetical protein  66.72 
 
 
599 aa  708    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0915  hypothetical protein  46.18 
 
 
597 aa  425  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.342242  normal  0.94369 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0952  hypothetical protein  46.18 
 
 
597 aa  422  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0111179 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0891  hypothetical protein  47.15 
 
 
597 aa  423  1e-117  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2015  hypothetical protein  41.28 
 
 
587 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7240  hypothetical protein  39.8 
 
 
588 aa  321  3e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.510618  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1333  hypothetical protein  35.66 
 
 
587 aa  260  7e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.367771  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5535  hypothetical protein  30.79 
 
 
623 aa  184  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0408605 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5545  hypothetical protein  39.53 
 
 
532 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.352354 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1101  hypothetical protein  39.44 
 
 
501 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.322758 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2544  hypothetical protein  36.02 
 
 
497 aa  132  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.337624 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4453  hypothetical protein  35.69 
 
 
535 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.74365  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1669  hypothetical protein  36.27 
 
 
535 aa  122  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.118231 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3815  hypothetical protein  37.37 
 
 
535 aa  120  9e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.108699  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1487  hypothetical protein  38.35 
 
 
525 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.707292 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1305  putative flagellar hook-associated protein  33.33 
 
 
333 aa  60.1  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2965  putative flagellar hook-associated protein  33.33 
 
 
333 aa  59.3  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.481259 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2738  hypothetical protein  33.1 
 
 
333 aa  56.6  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0696  flagellar hook-associated protein FlgL  27.32 
 
 
350 aa  51.2  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.136395  normal  0.134293 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0685  flagellar hook-associated protein FlgL  27.32 
 
 
350 aa  50.4  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0281521  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6508  flagellar hook-associated protein FlgL  30.66 
 
 
344 aa  49.7  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.632547  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2941  flagellar hook-associated protein FlgL family protein  27.91 
 
 
335 aa  49.7  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.383256  normal  0.308963 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1120  flagellar hook-associated protein FlgL  32.37 
 
 
360 aa  45.1  0.004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3555  flagellar hook-associated protein FlgL  27.5 
 
 
348 aa  44.7  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0766  flagellar hook-associated protein FlgL  30.86 
 
 
355 aa  44.7  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5249  flagellar hook-associated protein FlgL  25.53 
 
 
348 aa  44.7  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.490883 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4191  flagellar hook-associated protein FlgL  37.68 
 
 
348 aa  44.7  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.8937  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>