41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0769 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0769  flagellar hook-associated protein FlgL  100 
 
 		 303 aa  587  1e-167  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.807924 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0875  flagellar hook-associated protein FlgL  73.84 
 
 		 303 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0716  flagellar hook-associated protein FlgL  60.54 
 
 		 303 aa  328  5.0000000000000004e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3169  flagellar hook-associated protein FlgL  57.95 
 
 		 302 aa  325  6e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.247991 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2528  flagellar hook-associated protein FlgL  33.45 
 
 		 296 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.947437  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0692  flagellin, putative  23.89 
 
 		 304 aa  71.2  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.914125 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0277  flagellar hook-associated protein FlgL  23.87 
 
 		 349 aa  59.3  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2853  hypothetical protein  26.67 
 
 		 515 aa  57  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0163673  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4191  flagellar hook-associated protein FlgL  31.69 
 
 		 348 aa  56.2  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.8937  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2544  hypothetical protein  27.42 
 
 		 497 aa  53.1  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.337624 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1137  flagellar hook-associated protein FlgL  30.28 
 
 		 348 aa  53.1  0.000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.512733  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1042  flagellar hook-associated protein FlgL  30.28 
 
 		 351 aa  53.1  0.000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3456  flagellar hook-associated protein 3  25.85 
 
 		 295 aa  52.8  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1597  flagellar hook-associated protein FlgL  25.99 
 
 		 317 aa  52.4  0.000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3555  flagellar hook-associated protein FlgL  22.22 
 
 		 348 aa  51.2  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0452  flagellar hook-associated protein FlgL  25.78 
 
 		 297 aa  50.8  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0390  flagellar hook-associated protein 3  25.28 
 
 		 294 aa  50.4  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.133052  normal  0.988738 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1113  flagellar hook-associated protein FlgL  22.16 
 
 		 347 aa  50.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.406024  normal  0.67515 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1006  flagellin, putative  21.45 
 
 		 307 aa  50.1  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.370705  normal  0.587131 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2698  putative flagellar hook-associated protein  24.54 
 
 		 339 aa  47.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0649  flagellar hook-associated protein FlgL  23.85 
 
 		 305 aa  48.1  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1148  flagellar hook-filament junction protein  24.49 
 
 		 296 aa  47.4  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0766  flagellar hook-associated protein FlgL  22.07 
 
 		 355 aa  47  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1333  hypothetical protein  29.84 
 
 		 587 aa  46.6  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.367771  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2941  flagellar hook-associated protein FlgL family protein  25.09 
 
 		 335 aa  45.8  0.0009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.383256  normal  0.308963 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3815  hypothetical protein  27.34 
 
 		 535 aa  45.8  0.0009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.108699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0831  flagellar hook-associated protein 3  24.72 
 
 		 298 aa  45.4  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.795766  normal  0.995497 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0822  lagellar hook-associated protein FlgL  33.33 
 
 		 744 aa  44.7  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0865  flagellar hook-associated protein 3  23.68 
 
 		 304 aa  45.1  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1766  flagellar hook-associated protein 3  23.94 
 
 		 313 aa  44.3  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01298  flagellar hook-associated protein FlgL  27.33 
 
 		 396 aa  44.3  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0842  flagellar hook-associated protein 3  23.68 
 
 		 304 aa  45.1  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0273  lateral flagellar hook associated protein 3  28.2 
 
 		 309 aa  44.3  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.462118  normal  0.382201 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3573  flagellar hook-associated protein 3  27.87 
 
 		 436 aa  44.3  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4453  hypothetical protein  26.94 
 
 		 535 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.74365  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0044  flagellar hook-associated protein FlgL  22.92 
 
 		 347 aa  43.9  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1112  flagellar hook-associated protein FlgL  30.77 
 
 		 410 aa  43.5  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00867916  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0903  flagellar hook-associated protein 3  26.5 
 
 		 408 aa  43.9  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.432658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1101  hypothetical protein  26.57 
 
 		 501 aa  43.5  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.322758 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5545  hypothetical protein  29.75 
 
 		 532 aa  43.1  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.352354 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0439  flagellin-like  29.36 
 
 		 294 aa  43.1  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>