156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4477 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4477  preprotein translocase subunit SecG  100 
 
 		 127 aa  248  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2472  preprotein translocase subunit SecG  69.47 
 
 		 128 aa  147  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.259492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2825  preprotein translocase subunit SecG  68.7 
 
 		 128 aa  130  9e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1834  preprotein translocase subunit SecG  72.97 
 
 		 124 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.602434 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2791  preprotein translocase subunit SecG  69.3 
 
 		 130 aa  123  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0637779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3232  preprotein translocase subunit SecG  72.48 
 
 		 134 aa  120  6e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1737  preprotein translocase subunit SecG  72.57 
 
 		 130 aa  107  6e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2052  preprotein translocase subunit SecG  62.26 
 
 		 153 aa  106  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1635  preprotein translocase subunit SecG  52.59 
 
 		 162 aa  105  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1096  preprotein translocase subunit SecG  61.26 
 
 		 148 aa  104  5e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4199  preprotein translocase, SecG subunit  55.8 
 
 		 133 aa  104  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.291086 
 
 
-
 
NC_004310  BR1137  preprotein translocase subunit SecG  60.36 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1833  preprotein translocase subunit SecG  54.33 
 
 		 179 aa  91.3  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.352461  hitchhiker  0.00941444 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2030  preprotein translocase subunit SecG  59.43 
 
 		 177 aa  89.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.887761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1451  preprotein translocase, SecG subunit  53.72 
 
 		 139 aa  88.2  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.194361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0509  preprotein translocase, SecG subunit  57.85 
 
 		 123 aa  87  7e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.515447 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5401  preprotein translocase, SecG subunit  50.45 
 
 		 142 aa  78.6  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.5638  normal  0.323397 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3106  preprotein translocase, SecG subunit  48.72 
 
 		 140 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.741634 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5125  preprotein translocase, SecG subunit  49.17 
 
 		 155 aa  77  0.00000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.158574 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4662  preprotein translocase, SecG subunit  49.17 
 
 		 155 aa  77  0.00000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.702566  normal  0.77195 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1068  preprotein translocase subunit SecG  60.44 
 
 		 156 aa  76.3  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.104375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5203  preprotein translocase, SecG subunit  50 
 
 		 156 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2232  protein-export membrane protein SECG  59.43 
 
 		 128 aa  73.6  0.0000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5569  preprotein translocase, SecG subunit  47.75 
 
 		 135 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1237  preprotein translocase, SecG subunit  58.33 
 
 		 160 aa  72.8  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0153  preprotein translocase, SecG subunit  59.42 
 
 		 111 aa  71.2  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0231187 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0874  preprotein translocase subunit SecG  46.4 
 
 		 207 aa  67  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2010  preprotein translocase subunit SecG  43.68 
 
 		 130 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000141449  normal  0.683834 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1342  preprotein translocase subunit SecG  43.9 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000147273  hitchhiker  0.00888007 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0948  preprotein translocase subunit SecG  35.45 
 
 		 123 aa  62.4  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.141944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3215  preprotein translocase subunit SecG  43.21 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000788796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0529  preprotein translocase subunit SecG  52.53 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2349  protein translocase subunit secG  44.19 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2011  preprotein translocase subunit SecG  42.15 
 
 		 203 aa  60.5  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0745159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3420  preprotein translocase subunit SecG  39.13 
 
 		 111 aa  60.5  0.000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000118136  decreased coverage  0.0000944454 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3242  preprotein translocase subunit SecG  39.13 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000345429  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3283  preprotein translocase subunit SecG  39.13 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000869835  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1125  preprotein translocase subunit SecG  39.13 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000669441  unclonable  0.00000000000376809 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0569  preprotein translocase subunit SecG  32.8 
 
 		 110 aa  58.9  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.403182  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0367  preprotein translocase subunit SecG  42.15 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0958  preprotein translocase subunit SecG  40.23 
 
 		 108 aa  58.2  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.117439  normal  0.139091 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2837  preprotein translocase subunit SecG  38.04 
 
 		 111 aa  58.9  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000321144  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3468  preprotein translocase, SecG subunit  33.06 
 
 		 111 aa  58.2  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0707  preprotein translocase, SecG subunit  29.92 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.272316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1575  preprotein translocase subunit SecG  46.27 
 
 		 123 aa  57.4  0.00000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0574767  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0987  preprotein translocase subunit SecG  44.29 
 
 		 111 aa  57.4  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000357257  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1027  preprotein translocase subunit SecG  39.77 
 
 		 125 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000322315  normal  0.29727 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1831  preprotein translocase subunit SecG  40.74 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.691878  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1433  preprotein translocase subunit SecG  40.74 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422985  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1059  preprotein translocase subunit SecG  40.74 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000688057  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1004  preprotein translocase subunit SecG  40.51 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.03745  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1128  preprotein translocase subunit SecG  40.74 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.20608  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0739  preprotein translocase subunit SecG  40.74 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0201173  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1288  preprotein translocase subunit SecG  40.74 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1297  preprotein translocase subunit SecG  40.74 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.377781  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0411  preprotein translocase subunit SecG  40.74 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.59525  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3392  preprotein translocase subunit SecG  30.08 
 
 		 115 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000462887  hitchhiker  0.000698491 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0805  preprotein translocase subunit SecG  29.01 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.367958  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3564  preprotein translocase subunit SecG  33.04 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.202883  hitchhiker  0.00000390785 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5578  preprotein translocase subunit SecG  38.64 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000233541  normal  0.139933 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3712  preprotein translocase subunit SecG  33.33 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.179193 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2830  preprotein translocase subunit SecG  42.65 
 
 		 114 aa  54.3  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000815505  hitchhiker  0.00315875 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0985  preprotein translocase, SecG subunit  37.8 
 
 		 112 aa  54.3  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.460003  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2288  preprotein translocase subunit SecG  39.02 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  unclonable  0.000000000673415  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2167  preprotein translocase subunit SecG  39.02 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000804572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2258  preprotein translocase, SecG subunit  41.1 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.193094  hitchhiker  0.0000000564085 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2632  preprotein translocase, SecG subunit  41.1 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2274  preprotein translocase subunit SecG  37.8 
 
 		 120 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000142621  normal  0.0890733 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1888  protein translocase subunit secG  54.93 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.073496  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1638  preprotein translocase subunit SecG  37.8 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.000000000164362  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2250  preprotein translocase subunit SecG  37.8 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00000247894  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0169  preprotein translocase subunit SecG  33.33 
 
 		 111 aa  53.9  0.0000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000528486  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2743  preprotein translocase subunit SecG  41.27 
 
 		 122 aa  53.9  0.0000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0128436 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0814  preprotein translocase, SecG subunit  33.02 
 
 		 107 aa  53.5  0.0000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294174 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3447  preprotein translocase, SecG subunit  33.91 
 
 		 134 aa  53.5  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0153  preprotein translocase subunit SecG  39.24 
 
 		 105 aa  52.8  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03401  preprotein translocase subunit SecG  33.33 
 
 		 112 aa  53.5  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3349  preprotein translocase, SecG subunit  34.65 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389296  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2716  protein translocase subunit secG  32.18 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.110807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002606  preprotein translocase subunit SecG  34.38 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000104181  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1171  preprotein translocase, SecG subunit  44.09 
 
 		 154 aa  52.8  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.229698  normal  0.302902 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62810  preprotein translocase subunit SecG  39.19 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3611  preprotein translocase subunit SecG  34.07 
 
 		 125 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5467  preprotein translocase subunit SecG  39.19 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.352414  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3599  preprotein translocase subunit SecG  36.89 
 
 		 111 aa  52.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000162935  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0486  preprotein translocase subunit SecG  33.59 
 
 		 111 aa  52.8  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.065883  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3063  preprotein translocase subunit SecG  41.18 
 
 		 111 aa  52.4  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000201334  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3988  preprotein translocase subunit SecG  36.89 
 
 		 111 aa  52.8  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000109182  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42850  preprotein translocase subunit SecG  32.82 
 
 		 129 aa  51.2  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0776  preprotein translocase subunit SecG  33.02 
 
 		 127 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000389884  normal  0.0198479 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0816  preprotein translocase, SecG subunit  33.96 
 
 		 106 aa  51.6  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000238414  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2063  preprotein translocase subunit SecG  33.33 
 
 		 111 aa  51.6  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2837  preprotein translocase subunit SecG  34.07 
 
 		 107 aa  51.2  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2706  preprotein translocase subunit SecG  34.07 
 
 		 107 aa  51.2  0.000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3733  preprotein translocase subunit SecG  35.92 
 
 		 111 aa  50.8  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0213713  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1741  preprotein translocase subunit SecG  36.96 
 
 		 116 aa  50.8  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0339  AraC family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 109 aa  50.8  0.000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.137634  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0066  preprotein translocase subunit SecG  39.24 
 
 		 102 aa  50.4  0.000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0071  preprotein translocase subunit SecG  39.24 
 
 		 102 aa  50.8  0.000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.293061 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4493  preprotein translocase, SecG subunit  31.43 
 
 		 126 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.23755  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>