More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2534 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_2534  putative flavin-dependent oxidoreductase  100 
 
 
458 aa  934    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.688829  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2169  putative monooxygenase  62.72 
 
 
493 aa  563  1.0000000000000001e-159  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3662  putative flavin-dependent oxidoreductase  59.87 
 
 
461 aa  523  1e-147  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43740  monooxygenase, NtaA/SnaA/SoxA/DszA family  55.26 
 
 
452 aa  493  9.999999999999999e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.514983  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5216  nitrilotriacetate monooxygenase  51.1 
 
 
461 aa  459  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.772157  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3504  putative monooxygenase  51.22 
 
 
470 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.267024  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3576  putative monooxygenase  51.22 
 
 
470 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0535027 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3887  putative monooxygenase  50.98 
 
 
468 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.693315  normal  0.163333 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3516  putative monooxygenase  51.22 
 
 
470 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.418377  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5186  monooxygenase, DszA family  44.22 
 
 
452 aa  385  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5029  flavin-dependent oxidoreductase  43.3 
 
 
463 aa  379  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.177434  normal  0.283856 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0352  DszA family monooxygenase  44.22 
 
 
452 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.895998  normal  0.798866 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1543  DszA family monooxygenase  45.92 
 
 
456 aa  380  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.9269  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6097  putative monooxygenase protein  44.47 
 
 
452 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.97832  normal  0.472399 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1269  putative monooxygenase  45.15 
 
 
461 aa  380  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0330886 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3195  putative luciferase-like protein, putative alkanesulfonate monooxygenase  43.78 
 
 
454 aa  381  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31500  Flavin-dependent oxidoreductase  44.76 
 
 
463 aa  376  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419822  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3007  hypothetical protein  44.32 
 
 
469 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.40837  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1906  DszA family monooxygenase  44.32 
 
 
457 aa  377  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.214665  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43810  monoxygenase, NtaA/DszA family  43.43 
 
 
467 aa  372  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.29629  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2914  hypothetical protein  46.22 
 
 
462 aa  375  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.513081  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34290  DszA family monooxygenase  46.22 
 
 
462 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0671328  normal  0.0164622 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2746  hypothetical protein  43.88 
 
 
469 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0157125  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6510  putative monooxygenase protein  43.27 
 
 
452 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2397  monoxygenase  45.82 
 
 
463 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.661365 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2052  putative luciferase-like protein, putative alkanesulfonate monooxygenase  43.89 
 
 
463 aa  370  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.752934  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6560  putative monooxygenase protein, DszA family  43.93 
 
 
465 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.176413  normal  0.397515 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1120  hypothetical protein  43.4 
 
 
461 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2984  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family  44.3 
 
 
466 aa  366  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0528073  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2869  xenobiotic compound monooxygenase  43.88 
 
 
466 aa  366  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.927289  normal  0.14753 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6145  DszA family monooxygenase  43.43 
 
 
465 aa  368  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.453092  hitchhiker  0.00590526 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1560  FMNH2-dependent monooxygenase  43.36 
 
 
461 aa  365  1e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.414034  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2244  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  44.92 
 
 
463 aa  361  1e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0891  putative monooxygenase  43.33 
 
 
480 aa  361  2e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34540  xenobiotic compound DszA family monooxygenase  42.76 
 
 
469 aa  360  2e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.748973  normal  0.0562583 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2933  hypothetical protein  42.76 
 
 
469 aa  360  2e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.820953  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0908  putative monooxygenase  43.33 
 
 
480 aa  361  2e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89307  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0897  putative monooxygenase  43.53 
 
 
480 aa  361  2e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.125634  normal  0.0455418 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4229  putative luciferase-like protein, putative alkanesulfonate monooxygenase  45.53 
 
 
469 aa  360  4e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3529  monooxygenase, putative  44.72 
 
 
454 aa  359  5e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.756628  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1741  monoxygenase  42.95 
 
 
467 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.139435  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2257  monoxygenase  43.4 
 
 
467 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0238  DszA family monooxygenase  42.28 
 
 
454 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.552909  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1146  monoxygenase  43.4 
 
 
467 aa  356  5e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.948118  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1520  monoxygenase  43.4 
 
 
467 aa  356  5e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148632  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0931  monoxygenase  43.4 
 
 
467 aa  356  5e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639701  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0093  monoxygenase  43.4 
 
 
467 aa  356  5e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2363  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  42.98 
 
 
467 aa  356  5.999999999999999e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000880106  hitchhiker  0.00124341 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4990  monooxygenase  42.04 
 
 
464 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1016  monoxygenase  43.18 
 
 
467 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0291524  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2573  putative luciferase-like protein, putative alkanesulfonate monooxygenase  45.67 
 
 
478 aa  353  5e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.210511 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4538  flavin-dependent oxidoreductase  43.71 
 
 
468 aa  351  1e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182426  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6108  putative monooxygenase  42.98 
 
 
469 aa  351  2e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5154  nitrilotriacetate monooxygenase  41.79 
 
 
467 aa  350  2e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.866117  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3462  monoxygenase  42.51 
 
 
460 aa  349  6e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0705308  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0222  DszA family monooxygenase  41.65 
 
 
461 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0424148  hitchhiker  0.00698134 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0246  monooxygenase  41.65 
 
 
463 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3872  putative monooxygenase  42.54 
 
 
467 aa  344  2e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0559897 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0237  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  41.65 
 
 
461 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.782934  normal  0.380883 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3798  putative monooxygenase  42.51 
 
 
467 aa  343  4e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.438268 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5152  nitrilotriacetate monooxygenase  40.04 
 
 
454 aa  343  4e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669149  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3490  putative monooxygenase  42.51 
 
 
467 aa  342  7e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.286781  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4846  hypothetical protein  42 
 
 
470 aa  342  8e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.318443 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4860  putative luciferase-like protein, putative alkanesulfonate monooxygenase  42.67 
 
 
469 aa  340  2e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.06917  normal  0.729737 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02460  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  41.94 
 
 
473 aa  339  5e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.230038  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4268  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  40.93 
 
 
462 aa  339  5.9999999999999996e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.375018  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7155  nitrilotriacetate monooxygenase  41.43 
 
 
468 aa  338  8e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1590  putative luciferase-like protein, putative alkanesulfonate monooxygenase  42.76 
 
 
460 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0963352 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3028  flavin-dependent oxidoreductase  41.56 
 
 
470 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0660648  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4930  flavin-dependent oxidoreductase  41.56 
 
 
470 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.497416  normal  0.995257 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5338  flavin-dependent oxidoreductase  41.56 
 
 
470 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.287655  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1776  DszA family monooxygenase  40.62 
 
 
454 aa  336  5e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3392  flavin-dependent oxidoreductase  41.74 
 
 
465 aa  336  5e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.425797  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1440  monoxygenase  41.61 
 
 
464 aa  335  1e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7501  flavin-dependent oxidoreductase-like  42.41 
 
 
466 aa  335  1e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.180408  normal  0.269687 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0857  hypothetical protein  41.61 
 
 
472 aa  335  1e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2173  monoxygenase  41.61 
 
 
464 aa  335  1e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.417795  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2085  monoxygenase  42.67 
 
 
464 aa  334  2e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.924859  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0545  hypothetical protein  41.83 
 
 
472 aa  334  2e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0447  hypothetical protein  41.83 
 
 
472 aa  333  3e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1866  monoxygenase  41.83 
 
 
464 aa  333  4e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0384468  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1591  monoxygenase  40.04 
 
 
483 aa  333  5e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.452627  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6751  flavin-dependent oxidoreductase-like protein  41.61 
 
 
466 aa  332  1e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0288588 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2670  hypothetical protein  42 
 
 
457 aa  331  2e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6517  flavin-dependent oxidoreductase-like  41.61 
 
 
466 aa  331  2e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6340  flavin-dependent oxidoreductase-like protein  41.61 
 
 
466 aa  330  4e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2543  putative monooxygenase  42.31 
 
 
462 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.779513  normal  0.2652 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4688  flavin-dependent oxidoreductase  41.67 
 
 
472 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0991712  normal  0.791693 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1591  hypothetical protein  41.78 
 
 
457 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.176548 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5217  flavin-dependent oxidoreductase  41.37 
 
 
472 aa  327  3e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.668453 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0310  flavin-dependent oxidoreductase  41.19 
 
 
470 aa  325  1e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09004  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17580)  41.24 
 
 
482 aa  324  2e-87  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1129  hypothetical protein  40.79 
 
 
468 aa  318  2e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1792  monooxygenase  41.07 
 
 
460 aa  309  6.999999999999999e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.318899 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3997  monooxygenase  39.78 
 
 
459 aa  307  3e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.784522  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02576  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family (AFU_orthologue; AFUA_3G15040)  38.97 
 
 
481 aa  306  4.0000000000000004e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.285559 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6178  hypothetical protein  39.73 
 
 
460 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0589592 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1259  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  39.73 
 
 
460 aa  300  4e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.860986  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6573  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductases-like protein  39.73 
 
 
460 aa  300  4e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.265801  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45532  predicted protein  39.06 
 
 
505 aa  300  5e-80  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.533075 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>