More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0159 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_0159  dephospho-CoA kinase  100 
 
 
199 aa  394  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0114  dephospho-CoA kinase  81.31 
 
 
199 aa  326  2.0000000000000001e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.147885  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0302  dephospho-CoA kinase  81.31 
 
 
199 aa  325  3e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.747826  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0397  dephospho-CoA kinase  79.29 
 
 
199 aa  315  2e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.523463 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0424  dephospho-CoA kinase  80.85 
 
 
199 aa  309  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0296  dephospho-CoA kinase  77.89 
 
 
199 aa  295  3e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0104  dephospho-CoA kinase  72.36 
 
 
199 aa  282  3.0000000000000004e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.118217 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0850  dephospho-CoA kinase  63.08 
 
 
222 aa  253  1.0000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3481  dephospho-CoA kinase  54.01 
 
 
194 aa  227  8e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.286559  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2070  dephospho-CoA kinase  57.95 
 
 
200 aa  226  1e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1990  dephospho-CoA kinase  57.44 
 
 
200 aa  224  6e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4264  dephospho-CoA kinase  53.4 
 
 
203 aa  214  8e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.914249  normal  0.426289 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2538  dephospho-CoA kinase  56.91 
 
 
201 aa  214  9e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1830  dephospho-CoA kinase  54.77 
 
 
200 aa  213  9.999999999999999e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.037258 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3212  dephospho-CoA kinase  53.19 
 
 
194 aa  207  6e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0005  dephospho-CoA kinase  52.69 
 
 
195 aa  203  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1488  dephospho-CoA kinase  56.25 
 
 
217 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0833932  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3938  dephospho-CoA kinase  52.88 
 
 
203 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.39098  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1766  dephospho-CoA kinase  55.73 
 
 
217 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.294685  normal  0.215779 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3197  dephospho-CoA kinase  49.75 
 
 
211 aa  195  3e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.189898  normal  0.0250351 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1488  dephospho-CoA kinase  54.64 
 
 
206 aa  192  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0808878  normal  0.0946842 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5012  dephospho-CoA kinase  55.79 
 
 
207 aa  191  4e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4284  dephospho-CoA kinase  54.5 
 
 
212 aa  187  5.999999999999999e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00917274 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1253  dephospho-CoA kinase  53.68 
 
 
208 aa  186  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2977  dephospho-CoA kinase  51.4 
 
 
200 aa  180  1e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0195  dephospho-CoA kinase  50 
 
 
194 aa  177  1e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2672  dephospho-CoA kinase  49.47 
 
 
197 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.152116  normal  0.348643 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0114  dephospho-CoA kinase  51.6 
 
 
201 aa  176  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1235  dephospho-CoA kinase  48.95 
 
 
197 aa  173  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2896  dephospho-CoA kinase  47.89 
 
 
197 aa  168  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0215113  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3449  dephospho-CoA kinase  46.43 
 
 
198 aa  168  5e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1034  dephospho-CoA kinase  51.04 
 
 
204 aa  168  6e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.108495  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1276  dephospho-CoA kinase  50 
 
 
207 aa  167  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2814  dephospho-CoA kinase  48.44 
 
 
198 aa  166  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3385  dephospho-CoA kinase  48.3 
 
 
204 aa  162  4.0000000000000004e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.31936 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2829  dephospho-CoA kinase  47.12 
 
 
202 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0960542 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2859  dephospho-CoA kinase  47.37 
 
 
197 aa  161  5.0000000000000005e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.68987  normal  0.490957 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0005  dephospho-CoA kinase  43.37 
 
 
200 aa  160  2e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00364709  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40654  predicted protein  48.45 
 
 
201 aa  158  5e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.114893  normal  0.0526833 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2839  dephospho-CoA kinase  48.11 
 
 
207 aa  154  8e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0481374 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2760  dephospho-CoA kinase  46.91 
 
 
215 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3612  dephospho-CoA kinase  47.78 
 
 
229 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2777  dephospho-CoA kinase  41.54 
 
 
211 aa  132  3e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.03803  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2870  dephospho-CoA kinase  43.08 
 
 
211 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2215  dephospho-CoA kinase  39.89 
 
 
207 aa  126  3e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1583  dephospho-CoA kinase  38.46 
 
 
192 aa  124  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.311661  normal  0.292339 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2684  dephospho-CoA kinase  42.05 
 
 
211 aa  122  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0189  dephospho-CoA kinase  37.57 
 
 
208 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2472  dephospho-CoA kinase  37.77 
 
 
200 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.73797e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1419  dephospho-CoA kinase  31.25 
 
 
198 aa  118  3.9999999999999996e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000153204  hitchhiker  0.000000000230419 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0594  dephospho-CoA kinase  34.38 
 
 
197 aa  115  5e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0677  dephospho-CoA kinase  33.85 
 
 
297 aa  114  7.999999999999999e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.347634  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2675  dephospho-CoA kinase  44.69 
 
 
210 aa  114  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.597099  normal  0.0402246 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0789  dephospho-CoA kinase  39.27 
 
 
201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1245  dephospho-CoA kinase  37.02 
 
 
199 aa  113  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000344021  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3462  dephospho-CoA kinase  32 
 
 
198 aa  112  5e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0035973  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3786  dephospho-CoA kinase  34.41 
 
 
209 aa  112  5e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4316  dephospho-CoA kinase  37.57 
 
 
211 aa  109  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0410  dephospho-CoA kinase  33.87 
 
 
201 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0501  dephospho-CoA kinase  37.37 
 
 
200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.197247 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3455  dephospho-CoA kinase  39.47 
 
 
200 aa  109  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11135  hitchhiker  0.00293873 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0828  dephospho-CoA kinase  44.63 
 
 
219 aa  108  5e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3269  dephospho-CoA kinase  34.72 
 
 
200 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000097205  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4223  dephospho-CoA kinase  37.37 
 
 
201 aa  107  8.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.254941  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0366  dephospho-CoA kinase  33.84 
 
 
205 aa  107  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.153347  unclonable  0.00000795871 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1193  dephospho-CoA kinase  30.15 
 
 
208 aa  107  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.53954  normal  0.175104 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0529  dephospho-CoA kinase  34.01 
 
 
206 aa  107  1e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0183  dephospho-CoA kinase  31.98 
 
 
206 aa  107  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.26164  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0416  dephospho-CoA kinase  33.51 
 
 
205 aa  106  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.367029  hitchhiker  0.000957115 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2728  dephospho-CoA kinase  38.02 
 
 
202 aa  105  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.652095  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2658  dephospho-CoA kinase  39.25 
 
 
200 aa  105  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3945  dephospho-CoA kinase  33.51 
 
 
205 aa  105  5e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0413  dephospho-CoA kinase  36.36 
 
 
205 aa  105  6e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4715  dephospho-CoA kinase  35.26 
 
 
200 aa  104  7e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000225461  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3643  dephospho-CoA kinase  36.84 
 
 
215 aa  104  7e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000484329  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0503  dephospho-CoA kinase  40.34 
 
 
202 aa  104  7e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.206836  normal  0.43555 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0670  dephospho-CoA kinase  37.37 
 
 
207 aa  104  8e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.0684500000000001e-34 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3870  dephospho-CoA kinase  34.03 
 
 
205 aa  104  8e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0478  dephospho-CoA kinase  39.77 
 
 
202 aa  104  8e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.56306  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4180  dephospho-CoA kinase  35.83 
 
 
204 aa  104  8e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.376004  unclonable  0.000000000202737 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4063  dephospho-CoA kinase  33.51 
 
 
205 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.494634 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4479  dephospho-CoA kinase  34.74 
 
 
200 aa  103  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0168528  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4314  dephospho-CoA kinase  34.74 
 
 
200 aa  103  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000130257  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1420  dephospho-CoA kinase  36.14 
 
 
218 aa  103  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4709  dephospho-CoA kinase  34.74 
 
 
201 aa  103  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000925481  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4699  dephospho-CoA kinase  34.74 
 
 
200 aa  103  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3423e-36 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4828  dephospho-CoA kinase  34.74 
 
 
200 aa  103  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000028193  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3608  dephospho-CoA kinase  33.51 
 
 
205 aa  103  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0422  dephospho-CoA kinase  31 
 
 
201 aa  103  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000341611 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3426  dephospho-CoA kinase  33.85 
 
 
205 aa  103  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1121  dephospho-CoA kinase  32.99 
 
 
198 aa  103  2e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.22108  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0417  dephospho-CoA kinase  34.04 
 
 
205 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2023  dephospho-CoA kinase  36.82 
 
 
210 aa  103  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0993224  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1788  dephospho-CoA kinase  37.5 
 
 
202 aa  103  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4694  dephospho-CoA kinase  34.21 
 
 
200 aa  102  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000280087  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0513  dephospho-CoA kinase  39.44 
 
 
197 aa  102  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.167933  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0544  dephospho-CoA kinase  34.74 
 
 
200 aa  102  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000847962  hitchhiker  1.1531e-16 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1133  dephospho-CoA kinase  36.14 
 
 
203 aa  102  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3922  dephospho-CoA kinase  33.51 
 
 
205 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2671  dephospho-CoA kinase  32.98 
 
 
199 aa  102  4e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177736  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>