33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_0275 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_0275  hypothetical protein  100 
 
 
132 aa  263  4e-70  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00079  transposase subfamily, putative  62.34 
 
 
233 aa  105  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.251545  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3960  hypothetical protein  50 
 
 
107 aa  85.5  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0606215 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3023  PilT domain-containing protein  35.83 
 
 
128 aa  84.7  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.769466 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0615  hypothetical protein  34.88 
 
 
136 aa  61.6  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.466526  normal  0.0181742 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24970  predicted nucleic-acid-binding protein, contains PIN domain  31.93 
 
 
134 aa  60.1  0.000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2443  hypothetical protein  34.71 
 
 
132 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1340  PilT protein-like  34.51 
 
 
136 aa  55.5  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0194017 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3493  PilT domain-containing protein  30 
 
 
136 aa  55.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4258  PilT domain-containing protein  33.06 
 
 
132 aa  54.3  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25020  predicted nucleic-acid-binding protein, contains PIN domain  28.46 
 
 
134 aa  53.9  0.0000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2285  PilT protein-like protein  31.67 
 
 
133 aa  53.1  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.420791  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4815  PilT protein-like  29.37 
 
 
140 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830494  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1917  PilT protein domain protein  33.33 
 
 
133 aa  52  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.209239  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03477  PilT-like protein  34.74 
 
 
146 aa  51.6  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3352  PilT domain-containing protein  29.27 
 
 
139 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4164  PilT domain-containing protein  29.27 
 
 
139 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0375778  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5676  hypothetical protein  30.08 
 
 
132 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.304221 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1077  hypothetical protein  31.15 
 
 
133 aa  50.1  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.918095  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3501  PilT protein-like  31.36 
 
 
130 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1987  PilT protein domain protein  25.19 
 
 
138 aa  48.1  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000443268  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0197  Nucleotide binding protein PINc  27.48 
 
 
136 aa  48.1  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000623662  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2544  PilT protein-like  33.33 
 
 
136 aa  47.8  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3693  PilT protein-like  27.78 
 
 
130 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1277  hypothetical protein  28.33 
 
 
133 aa  47  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.836734  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2481  nucleic-acid-binding protein contains PIN domain-like protein  25.95 
 
 
136 aa  47  0.00009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3013  PilT domain-containing protein  30.25 
 
 
133 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3084  PilT protein  24.79 
 
 
129 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2132  PilT protein domain protein  31.4 
 
 
130 aa  45.1  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3176  hypothetical protein  32.26 
 
 
132 aa  44.7  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0661  Pil-like protein  27.56 
 
 
136 aa  44.3  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2205  PilT protein domain protein  25.19 
 
 
138 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000141921 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1698  PilT domain-containing protein  22.5 
 
 
133 aa  41.2  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.249544  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>