218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5948 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5948  exopolysaccharide export protein  100 
 
 		 406 aa  820    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0198  polysaccharide export protein  63.14 
 
 		 395 aa  489  1e-137  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2714  polysaccharide export protein  34.92 
 
 		 393 aa  209  6e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6357  polysaccharide export protein  36.29 
 
 		 389 aa  209  8e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.168651 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3820  polysaccharide export protein  33.51 
 
 		 404 aa  207  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.388057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3660  polysaccharide export protein  33.42 
 
 		 388 aa  207  3e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.208413 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3770  polysaccharide export protein  31.99 
 
 		 388 aa  205  1e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.951102 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2463  polysaccharide export protein  33.85 
 
 		 390 aa  204  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.118558 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3782  polysaccharide export protein  34.64 
 
 		 402 aa  203  5e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2754  polysaccharide export protein  33.6 
 
 		 391 aa  202  7e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.982682  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1533  polysaccharide export protein  31.87 
 
 		 397 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3767  polysaccharide export protein  33.76 
 
 		 419 aa  200  3e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.607345 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1938  polysaccharide export protein  33.58 
 
 		 410 aa  201  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.231854  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2758  polysaccharide export protein  33.16 
 
 		 390 aa  200  3e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.261698 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0324  polysaccharide export protein  33.58 
 
 		 410 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2535  polysaccharide export protein  32.64 
 
 		 417 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3462  polysaccharide export protein  31.99 
 
 		 388 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.775015  normal  0.722378 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1028  putative capsule polysaccharide export outer membrane protein  34.29 
 
 		 440 aa  196  5.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.220124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0950  polysaccharide export protein  33.96 
 
 		 394 aa  196  6e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7135  polysaccharide export protein  33.76 
 
 		 389 aa  196  7e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3232  polysaccharide export protein  32.58 
 
 		 422 aa  193  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2984  polysaccharide export protein  31.91 
 
 		 403 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.182191  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2307  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  31.54 
 
 		 387 aa  189  1e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3301  WcbC  31.54 
 
 		 387 aa  189  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0776528  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3859  polysaccharide export protein  33.69 
 
 		 398 aa  189  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.329436 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1327  WcbC  33.16 
 
 		 422 aa  189  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1078  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  31.99 
 
 		 378 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.273848  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3254  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  31.54 
 
 		 387 aa  189  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2185  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  31.54 
 
 		 387 aa  189  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0521  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  31.99 
 
 		 373 aa  188  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.21613  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3289  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  31.99 
 
 		 373 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3781  polysaccharide export protein  32.29 
 
 		 396 aa  186  9e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543784  normal  0.42896 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1161  polysaccharide export protein  30.75 
 
 		 388 aa  184  3e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0571636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0740  polysaccharide export protein  30.89 
 
 		 379 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3057  polysaccharide export protein  31.28 
 
 		 440 aa  182  1e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.521526  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0753  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 392 aa  177  3e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2589  polysaccharide export protein  30.46 
 
 		 397 aa  168  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0287  polysaccharide export protein  30.61 
 
 		 409 aa  167  4e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0771  polysaccharide export protein  30.61 
 
 		 409 aa  167  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2975  capsule polysaccharide export protein, BexD/CtrA/VexA family  30.29 
 
 		 390 aa  167  4e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2079  polysaccharide export protein  30.79 
 
 		 394 aa  166  6.9999999999999995e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.238275 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0664  polysaccharide export protein  32.8 
 
 		 386 aa  163  5.0000000000000005e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0130788  normal  0.0340972 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3494  polysaccharide export protein  29.19 
 
 		 387 aa  162  7e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1033  polysaccharide export protein  26.39 
 
 		 400 aa  162  1e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1486  polysaccharide export protein  31.94 
 
 		 408 aa  159  1e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.721781  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1559  polysaccharide export protein  31.2 
 
 		 392 aa  158  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.053083  normal  0.0507525 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0093  polysaccharide export protein  28.24 
 
 		 410 aa  155  9e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.249835 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6038  polysaccharide export protein  28.34 
 
 		 380 aa  153  4e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2347  polysaccharide export protein  31.37 
 
 		 363 aa  152  7e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2133  polysaccharide export protein  30.35 
 
 		 375 aa  152  1e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2254  putative polysaccharide export protein  31.43 
 
 		 385 aa  139  7e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.732758 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0759  putative capsule polysaccharide exporter  30.29 
 
 		 378 aa  135  9e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2418  polysaccharide export protein  30.03 
 
 		 378 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.160125 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3037  polysaccharide export protein  28.57 
 
 		 365 aa  134  3.9999999999999996e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0416  polysaccharide export protein  30.85 
 
 		 377 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.482624  normal  0.901304 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0728  polysaccharide export protein  27.32 
 
 		 406 aa  123  7e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0592295  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3419  polysaccharide export protein  27.69 
 
 		 384 aa  119  7e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0961152  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01968  lipoprotein required for capsular polysaccharide translocation through the outer membrane  26.05 
 
 		 379 aa  96.3  9e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1595  polysaccharide export protein  26.05 
 
 		 379 aa  96.3  9e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.249253  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1579  polysaccharide export protein  26.05 
 
 		 379 aa  96.3  9e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.479279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2997  polysaccharide biosynthesis/export protein  26.05 
 
 		 379 aa  96.3  9e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0597184 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1170  polysaccharide biosynthesis/export protein  26.05 
 
 		 379 aa  96.3  9e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2355  polysaccharide biosynthesis/export protein  26.05 
 
 		 379 aa  96.3  9e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1000  polysaccharide biosynthesis/export protein  26.05 
 
 		 379 aa  96.3  9e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01957  hypothetical protein  26.05 
 
 		 379 aa  96.3  9e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2344  polysaccharide biosynthesis/export protein  26.37 
 
 		 379 aa  95.5  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.675285  normal  0.855008 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2458  polysaccharide biosynthesis/export protein  26.37 
 
 		 379 aa  95.5  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0550214 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4093  hypothetical protein  27.78 
 
 		 356 aa  95.5  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.818341  normal  0.104815 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2351  polysaccharide biosynthesis/export protein  26.37 
 
 		 351 aa  95.1  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2243  polysaccharide biosynthesis/export protein  26.37 
 
 		 348 aa  95.5  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2300  polysaccharide biosynthesis/export protein  26.37 
 
 		 348 aa  95.5  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.631767  normal  0.480899 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1728  putative capsular polysaccharide transport outermembrane protein  27.95 
 
 		 352 aa  95.1  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0503982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2676  polysaccharide export protein  27.9 
 
 		 379 aa  94.4  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.259667 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2193  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.73 
 
 		 378 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000597973  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3701  polysaccharide export protein  27.21 
 
 		 392 aa  93.2  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4540  polysaccharide export protein  27.21 
 
 		 387 aa  93.2  8e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0169971  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3823  polysaccharide export protein  27.21 
 
 		 387 aa  93.2  8e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2273  polysaccharide export protein  26.84 
 
 		 392 aa  92.4  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.534811  normal  0.26202 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4916  polysaccharide export protein  27.21 
 
 		 397 aa  92  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.713407  hitchhiker  0.000554375 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3726  polysaccharide export protein  26.47 
 
 		 392 aa  92  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal  0.448229 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0546  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  27.52 
 
 		 396 aa  91.7  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1092  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  24.81 
 
 		 386 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5549  polysaccharide export protein  26.47 
 
 		 392 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4409  polysaccharide export protein  26.63 
 
 		 398 aa  92  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06665  hypothetical protein  26.3 
 
 		 373 aa  91.7  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0915  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  27.52 
 
 		 396 aa  91.3  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.138032  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0619  polysaccharide export protein  26.05 
 
 		 376 aa  91.3  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112684  normal  0.159669 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2620  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  27.52 
 
 		 391 aa  91.3  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2482  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  27.52 
 
 		 391 aa  91.3  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.153813  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1099  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  24.57 
 
 		 386 aa  90.5  5e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0031657  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2332  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  24.57 
 
 		 386 aa  90.5  5e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.132677  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2613  polysaccharide export protein  24.85 
 
 		 379 aa  90.5  5e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.139508 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1352  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  25.45 
 
 		 396 aa  90.1  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3036  polysaccharide export protein  24.12 
 
 		 378 aa  90.1  6e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00986  predicted exopolysaccharide export protein  24.85 
 
 		 379 aa  90.1  7e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2660  polysaccharide export protein  24.85 
 
 		 379 aa  90.1  7e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00993  hypothetical protein  24.85 
 
 		 379 aa  90.1  7e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1219  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  24.85 
 
 		 379 aa  90.1  7e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0578  polysaccharide biosynthesis/export protein  23.14 
 
 		 375 aa  89  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.809222  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2717  polysaccharide export protein  24.34 
 
 		 379 aa  88.6  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.335454  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>