More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5216 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5216  nitrilotriacetate monooxygenase  100 
 
 		 461 aa  965    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.772157  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43740  monooxygenase, NtaA/SnaA/SoxA/DszA family  57.24 
 
 		 452 aa  540  9.999999999999999e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.514983  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2534  putative flavin-dependent oxidoreductase  51.1 
 
 		 458 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.688829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3662  putative flavin-dependent oxidoreductase  49.56 
 
 		 461 aa  446  1.0000000000000001e-124  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2169  putative monooxygenase  50.33 
 
 		 493 aa  447  1.0000000000000001e-124  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3516  putative monooxygenase  47.26 
 
 		 470 aa  435  1e-121  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.418377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3504  putative monooxygenase  47.26 
 
 		 470 aa  435  1e-121  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.267024  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3576  putative monooxygenase  47.26 
 
 		 470 aa  435  1e-121  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0535027 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3887  putative monooxygenase  46.29 
 
 		 468 aa  432  1e-120  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.693315  normal  0.163333 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1269  putative monooxygenase  45.05 
 
 		 461 aa  412  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0330886 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0352  DszA family monooxygenase  43.56 
 
 		 452 aa  385  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.895998  normal  0.798866 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6097  putative monooxygenase protein  43.58 
 
 		 452 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.97832  normal  0.472399 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2984  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family  43.05 
 
 		 466 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0528073  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5186  monooxygenase, DszA family  43.11 
 
 		 452 aa  382  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31500  Flavin-dependent oxidoreductase  42.76 
 
 		 463 aa  383  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419822  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2869  xenobiotic compound monooxygenase  42.04 
 
 		 466 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.927289  normal  0.14753 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43810  monoxygenase, NtaA/DszA family  41.06 
 
 		 467 aa  379  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.29629  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2933  hypothetical protein  42.83 
 
 		 469 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.820953  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34540  xenobiotic compound DszA family monooxygenase  42.83 
 
 		 469 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.748973  normal  0.0562583 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2363  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  42.44 
 
 		 467 aa  380  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000880106  hitchhiker  0.00124341 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2746  hypothetical protein  42.33 
 
 		 469 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0157125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1120  hypothetical protein  41.99 
 
 		 461 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3007  hypothetical protein  41.99 
 
 		 469 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.40837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34290  DszA family monooxygenase  42.16 
 
 		 462 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0671328  normal  0.0164622 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2397  monoxygenase  43.21 
 
 		 463 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.661365 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2244  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  43.21 
 
 		 463 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2914  hypothetical protein  41.94 
 
 		 462 aa  375  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.513081  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3529  monooxygenase, putative  43.21 
 
 		 454 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.756628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0238  DszA family monooxygenase  40.93 
 
 		 454 aa  369  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.552909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6510  putative monooxygenase protein  41.37 
 
 		 452 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1906  DszA family monooxygenase  40.49 
 
 		 457 aa  365  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.214665  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5029  flavin-dependent oxidoreductase  42.07 
 
 		 463 aa  367  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.177434  normal  0.283856 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1741  monoxygenase  42.83 
 
 		 467 aa  367  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.139435  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1543  DszA family monooxygenase  41.59 
 
 		 456 aa  367  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.9269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2257  monoxygenase  42.83 
 
 		 467 aa  364  2e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1016  monoxygenase  42.83 
 
 		 467 aa  364  2e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0291524  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1146  monoxygenase  42.83 
 
 		 467 aa  363  3e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.948118  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1520  monoxygenase  42.83 
 
 		 467 aa  363  3e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.148632  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0931  monoxygenase  42.83 
 
 		 467 aa  363  3e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639701  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0093  monoxygenase  42.83 
 
 		 467 aa  363  3e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6560  putative monooxygenase protein, DszA family  40.09 
 
 		 465 aa  360  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.176413  normal  0.397515 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0447  hypothetical protein  42.92 
 
 		 472 aa  360  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4538  flavin-dependent oxidoreductase  42.73 
 
 		 468 aa  360  3e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0857  hypothetical protein  42.92 
 
 		 472 aa  360  3e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1866  monoxygenase  42.92 
 
 		 464 aa  360  3e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0384468  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6145  DszA family monooxygenase  39.87 
 
 		 465 aa  360  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.453092  hitchhiker  0.00590526 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1440  monoxygenase  42.92 
 
 		 464 aa  360  4e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2173  monoxygenase  42.92 
 
 		 464 aa  360  4e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.417795  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4930  flavin-dependent oxidoreductase  41.56 
 
 		 470 aa  359  5e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.497416  normal  0.995257 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3028  flavin-dependent oxidoreductase  41.56 
 
 		 470 aa  359  6e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0660648  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0891  putative monooxygenase  42.54 
 
 		 480 aa  359  6e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5338  flavin-dependent oxidoreductase  41.56 
 
 		 470 aa  359  6e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.287655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0908  putative monooxygenase  42.54 
 
 		 480 aa  359  6e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0545  hypothetical protein  42.7 
 
 		 472 aa  359  6e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5152  nitrilotriacetate monooxygenase  40.71 
 
 		 454 aa  358  1.9999999999999998e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669149  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0897  putative monooxygenase  42.32 
 
 		 480 aa  357  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.125634  normal  0.0455418 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4990  monooxygenase  39.87 
 
 		 464 aa  354  2e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4688  flavin-dependent oxidoreductase  41.47 
 
 		 472 aa  352  1e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0991712  normal  0.791693 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1560  FMNH2-dependent monooxygenase  40.74 
 
 		 461 aa  351  2e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.414034  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0222  DszA family monooxygenase  39.91 
 
 		 461 aa  351  2e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0424148  hitchhiker  0.00698134 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0310  flavin-dependent oxidoreductase  41.54 
 
 		 470 aa  351  2e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3392  flavin-dependent oxidoreductase  41.5 
 
 		 465 aa  350  3e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.425797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0237  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  39.69 
 
 		 461 aa  349  5e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.782934  normal  0.380883 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0246  monooxygenase  40.13 
 
 		 463 aa  348  8e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5217  flavin-dependent oxidoreductase  41.72 
 
 		 472 aa  347  2e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.668453 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2085  monoxygenase  40.84 
 
 		 464 aa  344  2e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.924859  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4229  putative luciferase-like protein, putative alkanesulfonate monooxygenase  41.5 
 
 		 469 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02460  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  40.09 
 
 		 473 aa  343  4e-93  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.230038  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3195  putative luciferase-like protein, putative alkanesulfonate monooxygenase  40.75 
 
 		 454 aa  343  5e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4860  putative luciferase-like protein, putative alkanesulfonate monooxygenase  40.94 
 
 		 469 aa  342  7e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.06917  normal  0.729737 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1129  hypothetical protein  40.34 
 
 		 468 aa  342  8e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2573  putative luciferase-like protein, putative alkanesulfonate monooxygenase  41.21 
 
 		 478 aa  340  2e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.210511 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2052  putative luciferase-like protein, putative alkanesulfonate monooxygenase  40.66 
 
 		 463 aa  339  5e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.752934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1591  monoxygenase  40.52 
 
 		 483 aa  338  9.999999999999999e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.452627  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7155  nitrilotriacetate monooxygenase  39.96 
 
 		 468 aa  338  9.999999999999999e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1590  putative luciferase-like protein, putative alkanesulfonate monooxygenase  41.45 
 
 		 460 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0963352 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3462  monoxygenase  38.05 
 
 		 460 aa  333  3e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0705308  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02576  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family (AFU_orthologue; AFUA_3G15040)  39.52 
 
 		 481 aa  333  5e-90  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.285559 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4846  hypothetical protein  38.63 
 
 		 470 aa  328  9e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.318443 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1792  monooxygenase  40.13 
 
 		 460 aa  328  1.0000000000000001e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.318899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4268  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  37.17 
 
 		 462 aa  327  4.0000000000000003e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.375018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3798  putative monooxygenase  38.99 
 
 		 467 aa  323  3e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.438268 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1776  DszA family monooxygenase  38 
 
 		 454 aa  323  3e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3490  putative monooxygenase  38.99 
 
 		 467 aa  323  6e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.286781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5154  nitrilotriacetate monooxygenase  37.78 
 
 		 467 aa  322  9.999999999999999e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.866117  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3872  putative monooxygenase  38.77 
 
 		 467 aa  319  5e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0559897 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1591  hypothetical protein  39.52 
 
 		 457 aa  319  7e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.176548 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3997  monooxygenase  39.78 
 
 		 459 aa  319  7.999999999999999e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.784522  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6108  putative monooxygenase  38.58 
 
 		 469 aa  318  1e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7501  flavin-dependent oxidoreductase-like  39.29 
 
 		 466 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.180408  normal  0.269687 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2670  hypothetical protein  38.63 
 
 		 457 aa  311  1e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6751  flavin-dependent oxidoreductase-like protein  39.33 
 
 		 466 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0288588 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6517  flavin-dependent oxidoreductase-like  39.33 
 
 		 466 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2543  putative monooxygenase  38.46 
 
 		 462 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.779513  normal  0.2652 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6340  flavin-dependent oxidoreductase-like protein  38.89 
 
 		 466 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0096  hypothetical protein  39.61 
 
 		 458 aa  301  1e-80  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45532  predicted protein  36.4 
 
 		 505 aa  301  2e-80  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.533075 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2175  hypothetical protein  42.31 
 
 		 408 aa  295  1e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1259  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  38.84 
 
 		 460 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.860986  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6573  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductases-like protein  38.84 
 
 		 460 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.265801  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>