68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5006 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5006  hypothetical protein  100 
 
 		 274 aa  572  1.0000000000000001e-162  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5757  hypothetical protein  75.82 
 
 		 273 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6664  hypothetical protein  72.69 
 
 		 272 aa  435  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00516575 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2830  hypothetical protein  67.15 
 
 		 280 aa  396  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.428728  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1072  hypothetical protein  66.06 
 
 		 279 aa  392  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.278788  normal  0.0185429 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3472  hypothetical protein  65.33 
 
 		 276 aa  392  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.489268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0079  hypothetical protein  64.44 
 
 		 282 aa  389  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5329  hypothetical protein  66.18 
 
 		 278 aa  388  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2060  hypothetical protein  65.33 
 
 		 279 aa  384  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.122553  normal  0.0117178 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0362  hypothetical protein  65.44 
 
 		 272 aa  384  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5334  hypothetical protein  64.96 
 
 		 276 aa  385  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.716705 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3330  hypothetical protein  65.44 
 
 		 278 aa  385  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0228247 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4827  hypothetical protein  65.81 
 
 		 278 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.576773 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5442  hypothetical protein  65.81 
 
 		 278 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.529147 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4787  hypothetical protein  65.81 
 
 		 278 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.133323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5420  hypothetical protein  65.81 
 
 		 278 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.120325  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0211  hypothetical protein  65.81 
 
 		 278 aa  386  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.986717 
 
 
-
 
NC_004310  BR0346  hypothetical protein  65.44 
 
 		 272 aa  384  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.134093  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1741  hypothetical protein  64.96 
 
 		 279 aa  383  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0448  hypothetical protein  64.94 
 
 		 278 aa  382  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3617  hypothetical protein  64.34 
 
 		 278 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3295  hypothetical protein  65.07 
 
 		 278 aa  380  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2601  hypothetical protein  64.04 
 
 		 277 aa  378  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.119813  normal  0.874863 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0205  hypothetical protein  66.17 
 
 		 278 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7819  hypothetical protein  65.07 
 
 		 278 aa  377  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4304  hypothetical protein  63.24 
 
 		 278 aa  378  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.208475 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2243  hypothetical protein  62.87 
 
 		 311 aa  371  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.9431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0241  hypothetical protein  62.5 
 
 		 277 aa  373  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4237  hypothetical protein  62.5 
 
 		 278 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3530  hypothetical protein  62.87 
 
 		 278 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.660502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49650  hypothetical protein  62.5 
 
 		 278 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.473389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1325  hypothetical protein  64.42 
 
 		 280 aa  368  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0226639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2396  hypothetical protein  62.5 
 
 		 278 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.737785 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2487  hypothetical protein  62.87 
 
 		 278 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0929015 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3200  hypothetical protein  63.43 
 
 		 289 aa  365  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.228169  normal  0.637752 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3034  hypothetical protein  66.17 
 
 		 278 aa  365  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.432048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1553  hypothetical protein  66.17 
 
 		 278 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3011  hypothetical protein  63.5 
 
 		 279 aa  365  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0659197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1921  hypothetical protein  61.57 
 
 		 278 aa  363  2e-99  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08180  hypothetical protein  62.93 
 
 		 280 aa  362  3e-99  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.874298  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0555  hypothetical protein  65.07 
 
 		 279 aa  351  5.9999999999999994e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3794  hypothetical protein  60.66 
 
 		 275 aa  348  6e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.332323  normal  0.0189653 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3214  hypothetical protein  57.84 
 
 		 270 aa  331  7.000000000000001e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3435  hypothetical protein  58.21 
 
 		 271 aa  331  9e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2030  allantoin catabolism protein  56.62 
 
 		 271 aa  328  5.0000000000000004e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3172  hypothetical protein  55.88 
 
 		 271 aa  320  9.999999999999999e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.535542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2420  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.39 
 
 		 284 aa  238  1e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00497597 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.68 
 
 		 253 aa  145  5e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.199171  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1387  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  36.68 
 
 		 249 aa  142  8e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00099914  normal  0.234758 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2608  hypothetical protein  30.47 
 
 		 268 aa  130  3e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1786  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.37 
 
 		 246 aa  129  5.0000000000000004e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.106894  normal  0.350828 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5701  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.46 
 
 		 261 aa  125  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0787064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6771  hypothetical protein  28.69 
 
 		 248 aa  112  7.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0616  hypothetical protein  27.04 
 
 		 261 aa  104  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3098  allantoin catabolism protein  27.04 
 
 		 261 aa  103  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0553  hypothetical protein  27.04 
 
 		 261 aa  103  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00465  hypothetical protein  27.04 
 
 		 261 aa  103  4e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00470  hypothetical protein  27.04 
 
 		 261 aa  103  4e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0560  hypothetical protein  27.04 
 
 		 261 aa  103  4e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0579  hypothetical protein  27.47 
 
 		 261 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.855495 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0572  hypothetical protein  27.47 
 
 		 261 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3108  hypothetical protein  27.04 
 
 		 261 aa  102  6e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.520209 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0633  hypothetical protein  27.47 
 
 		 261 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0574  hypothetical protein  27.47 
 
 		 261 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0589  hypothetical protein  26.67 
 
 		 261 aa  100  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0016  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose- 6-phosphate isomerase  32.86 
 
 		 447 aa  44.3  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0432  cupin region  27.27 
 
 		 117 aa  44.3  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.583729  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01840  transcriptional regulator, XRE family  31.08 
 
 		 182 aa  42.4  0.008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>