66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3652 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3652  fructose bisphosphate aldolase  100 
 
 		 341 aa  697    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3242  Fructose-bisphosphate aldolase  82.99 
 
 		 341 aa  585  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.453092 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3539  Fructose-bisphosphate aldolase  82.11 
 
 		 341 aa  580  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3436  fructose-bisphosphate aldolase  77.13 
 
 		 341 aa  559  1e-158  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127219  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2654  fructose-bisphosphate aldolase  76.54 
 
 		 341 aa  547  1e-154  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.426367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1185  fructose-bisphosphate aldolase  75.37 
 
 		 341 aa  546  1e-154  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3077  fructose-bisphosphate aldolase  68.02 
 
 		 341 aa  464  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.918976  normal  0.730291 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2105  fructose-bisphosphate aldolase  66.96 
 
 		 339 aa  463  1e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267884  normal  0.0305048 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0141  fructose-bisphosphate aldolase, class I  66.37 
 
 		 342 aa  461  1e-129  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1010  Fructose-bisphosphate aldolase  68.84 
 
 		 344 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3466  fructose-bisphosphate aldolase  66.37 
 
 		 341 aa  455  1e-127  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.237573  normal  0.977621 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4471  fructose-bisphosphate aldolase  66.37 
 
 		 346 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4317  fructose-bisphosphate aldolase  65.97 
 
 		 342 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.280107  normal  0.443925 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3534  fructose-bisphosphate aldolase  64.71 
 
 		 343 aa  436  1e-121  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4773  fructose-bisphosphate aldolase  61.18 
 
 		 347 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.762754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2595  fructose-bisphosphate aldolase  61.7 
 
 		 345 aa  418  1e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2737  fructose-bisphosphate aldolase, class-I  62.65 
 
 		 343 aa  420  1e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.349178  normal  0.970752 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6929  fructose-bisphosphate aldolase  59.29 
 
 		 346 aa  398  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.188304  normal  0.15918 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3213  Fructose-bisphosphate aldolase  55.39 
 
 		 334 aa  369  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0504236  normal  0.268274 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1513  fructose-bisphosphate aldolase  57.35 
 
 		 340 aa  367  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.205372 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02119  fructose-bisphosphate aldolase class-I  55.09 
 
 		 334 aa  367  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1070  Fructose-bisphosphate aldolase  54.39 
 
 		 344 aa  362  4e-99  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2028  Fructose-bisphosphate aldolase  53.8 
 
 		 342 aa  362  6e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.382897  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2993  Fructose-bisphosphate aldolase  54.63 
 
 		 343 aa  361  1e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.689557  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2541  fructose-bisphosphate aldolase  53.82 
 
 		 341 aa  359  3e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.242648  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1561  fructose-bisphosphate aldolase  52.94 
 
 		 340 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1149  Fructose-bisphosphate aldolase  54.98 
 
 		 334 aa  354  1e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0710998  hitchhiker  0.00000000000576119 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1927  Fructose-bisphosphate aldolase  52.51 
 
 		 338 aa  349  3e-95  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1334  fructose-bisphosphate aldolase  55.45 
 
 		 339 aa  349  3e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0119283 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3478  Fructose-bisphosphate aldolase  51.03 
 
 		 348 aa  348  9e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1946  fructose-bisphosphate aldolase  52.99 
 
 		 334 aa  347  1e-94  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2023  fructose-bisphosphate aldolase  52.99 
 
 		 334 aa  347  1e-94  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1687  fructose-bisphosphate aldolase  51.01 
 
 		 346 aa  347  2e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.275968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4512  fructose-bisphosphate aldolase  52.71 
 
 		 343 aa  340  2e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.232594  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0565  fructose-bisphosphate aldolase  52.58 
 
 		 340 aa  338  7e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1003  fructose-bisphosphate aldolase  51.98 
 
 		 339 aa  336  2.9999999999999997e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.366961  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1058  fructose-bisphosphate aldolase  50 
 
 		 339 aa  331  1e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0511  hypothetical protein  48.96 
 
 		 336 aa  327  2.0000000000000001e-88  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0535  hypothetical protein  48.66 
 
 		 336 aa  325  5e-88  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0519  fructose-bisphosphate aldolase  50.75 
 
 		 335 aa  324  1e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0019401  normal  0.235286 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4741  fructose-bisphosphate aldolase  51.52 
 
 		 339 aa  323  4e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.894735  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0177  Fructose-bisphosphate aldolase  55.3 
 
 		 327 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0152366  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1951  fructose-bisphosphate aldolase  48.12 
 
 		 359 aa  315  8e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.750609 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33820  predicted protein  52.38 
 
 		 337 aa  309  4e-83  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_51289  fructose-bisphosphate aldolase  47.65 
 
 		 401 aa  295  5e-79  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.341823  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0188  fructose-bisphosphate aldolase  47.62 
 
 		 355 aa  289  4e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.709503  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08201  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  47.62 
 
 		 355 aa  290  4e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13796  predicted protein  47.37 
 
 		 336 aa  289  6e-77  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.994398  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08001  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  48.65 
 
 		 355 aa  288  7e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08451  fructose-1,6-bisphosphate aldolase class I  48.05 
 
 		 355 aa  284  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0796  fructose-bisphosphate aldolase  48.53 
 
 		 355 aa  278  1e-73  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.776973  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_24461  predicted protein  38.26 
 
 		 350 aa  208  1e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.104318  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23391  hypothetical protein  49.15 
 
 		 241 aa  203  4e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1087  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  29.28 
 
 		 296 aa  50.4  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00966018  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0953  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  26.35 
 
 		 298 aa  49.3  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1976  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  27.45 
 
 		 300 aa  48.5  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.162018 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1516  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  29.36 
 
 		 298 aa  48.5  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.821863  normal  0.336499 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4157  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  29.84 
 
 		 295 aa  48.5  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2156  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  27.3 
 
 		 294 aa  45.8  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3208  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  30.38 
 
 		 296 aa  44.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0085  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  26.8 
 
 		 296 aa  44.3  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.249059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1964  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  28.73 
 
 		 301 aa  43.9  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0905905  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0340  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  27.59 
 
 		 295 aa  43.9  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1317  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  27.59 
 
 		 296 aa  43.1  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.274126 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2682  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  24.51 
 
 		 296 aa  42.4  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2628  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  24.51 
 
 		 296 aa  42.4  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>