More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3611 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3611  MutT/nudix family protein  100 
 
 		 169 aa  352  1e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.454124  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3223  NUDIX hydrolase  70.41 
 
 		 170 aa  251  4.0000000000000004e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3518  NUDIX hydrolase  68.05 
 
 		 170 aa  239  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3612  MutT/nudix family protein  44.03 
 
 		 169 aa  149  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.463705  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0614  NUDIX hydrolase  42.59 
 
 		 169 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.287275  normal  0.48295 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3244  NUDIX hydrolase  37.01 
 
 		 158 aa  105  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2836  NUDIX hydrolase  36.65 
 
 		 158 aa  105  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927915  normal  0.666703 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0645  NUDIX hydrolase  37.25 
 
 		 153 aa  104  7e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0664584 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2108  NUDIX hydrolase  35.03 
 
 		 157 aa  98.2  5e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000452555  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2831  NUDIX hydrolase  33.77 
 
 		 155 aa  97.4  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00779282  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3074  mutT/nudix family protein  33.12 
 
 		 155 aa  95.1  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2202  phosphohydrolase  32.48 
 
 		 155 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.784536  hitchhiker  0.000000000000369619 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3056  mutT/nudix family protein  31.82 
 
 		 157 aa  92.4  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3048  MutT/Nudix family protein  31.82 
 
 		 155 aa  90.9  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2802  MutT/Nudix family protein  31.17 
 
 		 157 aa  90.5  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.187325  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2765  MutT/Nudix family protein  31.17 
 
 		 157 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2037  NUDIX hydrolase  32.88 
 
 		 155 aa  90.5  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3081  mutT/nudix family protein  31.82 
 
 		 155 aa  88.2  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.401788  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2830  mutT/nudix family protein  31.82 
 
 		 155 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.582109  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3044  mutT/nudix family protein  31.82 
 
 		 155 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0073  MutT/nudix family protein  29.45 
 
 		 162 aa  78.6  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4321  NUDIX hydrolase  31.93 
 
 		 181 aa  71.6  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00183396  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1195  MutT/nudix family protein  26.49 
 
 		 153 aa  71.6  0.000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1043  NUDIX family hydrolase  27.56 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0598  NUDIX hydrolase  26.14 
 
 		 163 aa  60.8  0.000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0227  hypothetical protein  29.38 
 
 		 167 aa  60.8  0.000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4370  MutT/Nudix family protein  33.04 
 
 		 144 aa  60.5  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4745  mutT/nudix family protein  36.61 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.710264  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3311  NUDIX hydrolase  34.26 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3377  MutT/Nudix family protein  41.79 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3327  MutT/Nudix family protein  41.79 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3416  mutT/nudix family protein  40.3 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4534  mutT/nudix family protein  34.82 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3636  mutT/nudix family protein  40.3 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3685  mutT/nudix family protein  40.3 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293788  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4887  mutT/nudix family protein  34.82 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0317  ADP-ribose pyrophosphatase  27.27 
 
 		 156 aa  57  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4380  MutT/Nudix family protein  33.33 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4467  NUDIX hydrolase  33.93 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0844  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 		 282 aa  54.7  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0803503  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3733  mutT/nudix family protein  37.31 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.412613  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0490  NUDIX/MutT family protein  34.18 
 
 		 168 aa  54.3  0.0000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000000225283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1584  mutT/nudix family protein  37.31 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0325451 
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  32.98 
 
 		 138 aa  53.9  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  32.98 
 
 		 138 aa  53.9  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6062  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 268 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107373 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1319  ADP-ribose pyrophosphatase  26.8 
 
 		 148 aa  53.9  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0720149  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2611  mutT/nudix family protein  30.28 
 
 		 148 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000504287 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3653  mutT/nudix family protein  37.31 
 
 		 147 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4771  mutT/nudix family protein  33.93 
 
 		 144 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3644  mutT/nudix family protein  35.82 
 
 		 147 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5487  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 270 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.746959  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  28.57 
 
 		 142 aa  52.4  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5398  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 270 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4772  mutT/nudix family protein  33.93 
 
 		 144 aa  52  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4754  mutT/nudix family protein  33.04 
 
 		 137 aa  52  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5774  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 270 aa  52  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.528861 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  28.57 
 
 		 137 aa  51.6  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1648  NUDIX hydrolase  34.57 
 
 		 172 aa  51.6  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000051086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2057  NUDIX hydrolase  33.75 
 
 		 168 aa  51.6  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000169928  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3674  NUDIX hydrolase  34.83 
 
 		 157 aa  51.2  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.369267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2839  NUDIX hydrolase  29.46 
 
 		 140 aa  51.2  0.000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00261887  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0490  mutT/nudix family protein  35.19 
 
 		 144 aa  50.8  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2699  mutT/nudix family protein  30.28 
 
 		 148 aa  50.8  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1860  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00730748  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0710  NUDIX hydrolase  57.14 
 
 		 154 aa  50.8  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2204  NUDIX hydrolase  40.3 
 
 		 141 aa  50.4  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00160  ADP-ribose pyrophosphatase  34.48 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.119195 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1486  NUDIX hydrolase  33.73 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00282357  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  33.7 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0251  mutator mutT protein  39.76 
 
 		 130 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13943  hypothetical protein  36.67 
 
 		 248 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00635151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  38.46 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4504  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 		 134 aa  50.1  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0549022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  30.21 
 
 		 347 aa  49.3  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1790  NUDIX hydrolase  34.18 
 
 		 168 aa  49.7  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000145412  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0299  mutator mutT protein  40.98 
 
 		 139 aa  48.9  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0361617  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1483  NUDIX hydrolase  29.91 
 
 		 148 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.084812  normal  0.135646 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04356  hypothetical protein  39.34 
 
 		 302 aa  49.3  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  27.21 
 
 		 135 aa  49.3  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0771  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  50 
 
 		 134 aa  48.5  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  0.720455 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3330  mutT/nudix family protein  35.21 
 
 		 153 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371651  unclonable  1.49498e-25 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2535  NUDIX hydrolase  29.46 
 
 		 140 aa  48.5  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.240977  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  41.67 
 
 		 318 aa  48.5  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1854  mutT/nudix family protein  35.21 
 
 		 153 aa  48.5  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1825  MutT/Nudix family protein  35.21 
 
 		 153 aa  48.9  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200422  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1809  MutT/Nudix family protein  35.21 
 
 		 153 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00380434  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4841  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 		 272 aa  48.5  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1997  mutT/nudix family protein  35.21 
 
 		 153 aa  48.5  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000428877  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  36.05 
 
 		 151 aa  48.5  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2716  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.51 
 
 		 133 aa  48.5  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1999  mutT/nudix family protein  35.21 
 
 		 153 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00120864  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2094  mutT/nudix family protein  35.21 
 
 		 153 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000267721  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2030  mutT/nudix family protein  35.21 
 
 		 153 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.83484e-43 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2074  mutT/nudix family protein  36.92 
 
 		 229 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000276659  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1977  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.35 
 
 		 128 aa  48.1  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000101182  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0910  NUDIX hydrolase  55.56 
 
 		 141 aa  48.1  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.479251  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1501  NUDIX hydrolase  37.88 
 
 		 102 aa  48.1  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0954993  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2554  NUDIX hydrolase  27.85 
 
 		 160 aa  48.5  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2086  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.35 
 
 		 128 aa  48.1  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.16532  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>