More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2900 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_2900  S-adenosyl-methyltransferase MraW  100 
 
 
341 aa  677    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2090  S-adenosyl-methyltransferase MraW  78.53 
 
 
362 aa  500  1e-140  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00955336 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2602  S-adenosyl-methyltransferase MraW  77.54 
 
 
341 aa  480  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172088  normal  0.713664 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2862  S-adenosyl-methyltransferase MraW  76.92 
 
 
341 aa  462  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0167683 
 
 
-
 
NC_004310  BR1439  S-adenosyl-methyltransferase MraW  65.01 
 
 
346 aa  426  1e-118  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.464087  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1736  S-adenosyl-methyltransferase MraW  64.24 
 
 
347 aa  426  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1396  S-adenosyl-methyltransferase MraW  64.72 
 
 
346 aa  423  1e-117  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0955  S-adenosyl-methyltransferase MraW  61.47 
 
 
331 aa  384  1e-105  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2015  S-adenosyl-methyltransferase MraW  62.65 
 
 
339 aa  384  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1852  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.56 
 
 
345 aa  310  2e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.787107 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4641  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.85 
 
 
351 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.059697 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5104  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.85 
 
 
353 aa  302  5.000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131212  normal  0.927807 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4056  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.96 
 
 
332 aa  301  8.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00662143  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0684  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.97 
 
 
355 aa  300  2e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.206992 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3402  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.01 
 
 
398 aa  300  3e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.160139  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1986  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.21 
 
 
337 aa  298  6e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.376194  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2413  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.95 
 
 
339 aa  298  9e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.881331  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5471  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.74 
 
 
339 aa  295  8e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.191975  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5180  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.36 
 
 
351 aa  293  2e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2365  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.77 
 
 
353 aa  293  4e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0749986 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1271  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.25 
 
 
399 aa  288  7e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0683  S-adenosyl-methyltransferase MraW  52.47 
 
 
331 aa  286  4e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.856779  normal  0.179081 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3675  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.96 
 
 
322 aa  286  4e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.188386 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2086  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.05 
 
 
334 aa  286  4e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.926608 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0263  S-adenosyl-methyltransferase MraW  58.31 
 
 
337 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0989467  normal  0.0563961 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3477  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.56 
 
 
346 aa  281  9e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6182  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.99 
 
 
331 aa  281  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.557144 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2015  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50.61 
 
 
329 aa  281  2e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3955  S-adenosyl-methyltransferase MraW  52.94 
 
 
322 aa  275  8e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1889  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.55 
 
 
325 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0524165 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0958  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.12 
 
 
326 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0772  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50.93 
 
 
331 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.11947  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6038  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50.93 
 
 
331 aa  272  6e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1125  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50.15 
 
 
329 aa  270  2.9999999999999997e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0583  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.59 
 
 
322 aa  269  5.9999999999999995e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.401485  normal  0.166979 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2769  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.84 
 
 
327 aa  266  5e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.66075  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2474  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.42 
 
 
333 aa  256  4e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.508671 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2186  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.53 
 
 
330 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.222915  normal  0.85718 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0761  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.04 
 
 
313 aa  248  2e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1043  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.85 
 
 
332 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57450  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.43 
 
 
313 aa  233  5e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4992  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.1 
 
 
313 aa  229  7e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0595  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.99 
 
 
322 aa  228  1e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.835578  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0733  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.87 
 
 
323 aa  226  4e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0144586  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4681  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.39 
 
 
315 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0572625 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04374  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44 
 
 
347 aa  225  1e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4416  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.25 
 
 
313 aa  222  7e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0799414  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0491  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.72 
 
 
297 aa  222  8e-57  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1034  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.51 
 
 
325 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4520  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.6 
 
 
315 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0542  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.43 
 
 
297 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.770048  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0963  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.81 
 
 
361 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0178075 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0346  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.86 
 
 
313 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.859571  normal  0.194945 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2055  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.75 
 
 
340 aa  219  3.9999999999999997e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.625831  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3788  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.67 
 
 
314 aa  219  5e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1976  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.08 
 
 
328 aa  219  6e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.169238  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0347  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.56 
 
 
313 aa  219  6e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.790423  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0936  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.6 
 
 
315 aa  219  6e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4110  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.93 
 
 
313 aa  218  1e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0936286  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0132  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.9 
 
 
313 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.673826  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0914  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.34 
 
 
314 aa  217  2e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357676  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1105  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.81 
 
 
327 aa  218  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4541  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.8 
 
 
313 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0129716 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1329  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.28 
 
 
315 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.95493  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0136  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.58 
 
 
313 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.130148 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0129  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.58 
 
 
313 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0132  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.58 
 
 
313 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000516622 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0137  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.58 
 
 
313 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3812  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.23 
 
 
313 aa  216  4e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0055  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50.16 
 
 
313 aa  216  4e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3600  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.35 
 
 
314 aa  216  5e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4395  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.95 
 
 
315 aa  216  5e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.216905  normal  0.387462 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00083  S-adenosyl-methyltransferase  42.58 
 
 
313 aa  215  7e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3518  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.58 
 
 
313 aa  215  7e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0088  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.58 
 
 
313 aa  215  7e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3982  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.76 
 
 
303 aa  215  7e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3575  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.58 
 
 
313 aa  215  7e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.723742  hitchhiker  0.000748743 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00082  hypothetical protein  42.58 
 
 
313 aa  215  7e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0087  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.58 
 
 
313 aa  215  7e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.519171  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0075  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.58 
 
 
313 aa  215  7e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0084  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.58 
 
 
313 aa  215  7e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.796275  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0090  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.58 
 
 
313 aa  215  7e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.929573 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0378  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.88 
 
 
313 aa  215  8e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.843738 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0402  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40.84 
 
 
314 aa  215  9e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000191827 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3578  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.56 
 
 
313 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.461351 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0500  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.38 
 
 
312 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.214758 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0975  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.39 
 
 
308 aa  214  1.9999999999999998e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0945  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.39 
 
 
308 aa  214  1.9999999999999998e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1139  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.45 
 
 
315 aa  214  1.9999999999999998e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.148614  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3751  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.56 
 
 
313 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187007 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0393  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.88 
 
 
313 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13170  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.65 
 
 
313 aa  213  2.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.916249  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0394  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.88 
 
 
313 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0766  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.34 
 
 
308 aa  213  2.9999999999999995e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0405  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.88 
 
 
313 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000604669 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0419  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.88 
 
 
313 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000814721 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4227  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.23 
 
 
313 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0640  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.67 
 
 
313 aa  213  5.999999999999999e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1269  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.63 
 
 
316 aa  212  7e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2198  methyltransferase  45.86 
 
 
331 aa  212  9e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>