22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2479 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2479  hypothetical protein  100 
 
 		 193 aa  383  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1504  conserved hypothetical conserved membrane protein  52.58 
 
 		 196 aa  183  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1702  conserved hypothetical conserved membrane protein  53.04 
 
 		 196 aa  181  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.653343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0893  hypothetical protein  37.37 
 
 		 189 aa  118  4.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0897  hypothetical protein  36.84 
 
 		 189 aa  115  3.9999999999999997e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.672038  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2659  hypothetical protein  35.53 
 
 		 199 aa  114  7.999999999999999e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.765719  normal  0.533611 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2330  hypothetical protein  35.71 
 
 		 189 aa  104  6e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1363  hypothetical protein  32.4 
 
 		 703 aa  72.4  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000334966  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2355  hypothetical protein  29.45 
 
 		 183 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000541115  hitchhiker  0.000000775471 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0370  hypothetical protein  31.43 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17309  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2230  hypothetical protein  25.32 
 
 		 190 aa  54.3  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.389542  hitchhiker  0.000590839 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2228  hypothetical protein  28.48 
 
 		 697 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2239  hypothetical protein  30 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.402107  normal  0.0267673 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1829  hypothetical protein  28 
 
 		 219 aa  53.1  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.186354  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1097  hypothetical protein  25 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.222925  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1461  hypothetical protein  31.17 
 
 		 183 aa  48.9  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.790498  normal  0.683662 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1714  hypothetical protein  32.39 
 
 		 163 aa  43.9  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.613584  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1296  hypothetical protein  36.92 
 
 		 161 aa  43.1  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2049  hypothetical protein  41.18 
 
 		 166 aa  42.7  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2509  hypothetical protein  35.48 
 
 		 163 aa  42.7  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0018  hypothetical protein  31.25 
 
 		 1006 aa  41.2  0.009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.774764 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1846  hypothetical protein  39.68 
 
 		 166 aa  41.2  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.589694  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>