34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2312 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2312  Bacteriophage capsid protein  100 
 
 		 545 aa  1123    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2391  phage portal protein, lambda  39.24 
 
 		 538 aa  331  2e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2462  phage portal protein, lambda family  34.33 
 
 		 536 aa  252  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4145  lambda family phage portal protein  30.88 
 
 		 534 aa  196  9e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1887  lambda family phage portal protein  26.17 
 
 		 556 aa  124  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000167275 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3064  putative phage portal protein Gp17  25.25 
 
 		 551 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0202724  hitchhiker  0.000118688 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0596  phage portal protein, lambda family  25.89 
 
 		 532 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1658  lambda family phage portal protein  23.36 
 
 		 574 aa  105  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0805551  normal  0.257873 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2092  lambda family phage portal protein  23.95 
 
 		 524 aa  105  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.778496  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01980  hypothetical protein  23.33 
 
 		 518 aa  97.4  6e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1288  phage portal protein, lambda family  24.44 
 
 		 530 aa  88.2  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1456  phage portal protein, lambda family  24.77 
 
 		 530 aa  85.9  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1188  phage portal protein, lambda family  24.86 
 
 		 530 aa  84.3  0.000000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2775  phage portal protein, lambda family  24.86 
 
 		 530 aa  84.3  0.000000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1785  phage portal protein, lambda family  23.24 
 
 		 533 aa  82.4  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0988466 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1622  phage portal protein, lambda family  23.24 
 
 		 533 aa  82.4  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0251357 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10038  capsid component  23.03 
 
 		 533 aa  80.1  0.00000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00733  hypothetical protein  23.03 
 
 		 533 aa  80.1  0.00000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4921  lambda family phage portal protein  22.44 
 
 		 524 aa  79.7  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.149822 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2093  lambda family phage portal protein  22.61 
 
 		 533 aa  78.2  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0127798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2813  phage portal protein lambda family  23.08 
 
 		 526 aa  78.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.579589 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1445  lambda family phage portal protein  24.27 
 
 		 360 aa  70.1  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0895  phage portal protein, lambda family  25.51 
 
 		 257 aa  68.6  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1204  lambda family phage portal protein  25.76 
 
 		 531 aa  68.6  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3359  lambda family phage portal protein  25.57 
 
 		 496 aa  66.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.591009 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3783  bacteriophage-related protein lambda family phage portal protein  25.14 
 
 		 496 aa  66.2  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.401598  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1062  lambda family phage portal protein  23.04 
 
 		 517 aa  54.7  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.544007 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1070  phage portal protein lambda family  21.86 
 
 		 515 aa  47.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.815422  hitchhiker  0.0000926741 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1142  phage portal protein, lambda family  22.09 
 
 		 515 aa  47  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.57853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1407  phage portal protein, lambda family  21.86 
 
 		 515 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.981703  hitchhiker  0.000144883 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1044  lytic transglycosylase, catalytic  25.19 
 
 		 367 aa  45.1  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.093004  normal  0.206829 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3044  lambda family phage portal protein  22.52 
 
 		 497 aa  44.7  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.426475  normal  0.205307 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1863  phage portal protein, lambda family  22.52 
 
 		 500 aa  43.9  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353733 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3203  phage portal protein, lambda family  22.52 
 
 		 500 aa  43.9  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254824 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>