26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_B0288 on replicon NC_007410
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007410  Ava_B0288  Excalibur  100 
 
 		 114 aa  238  2e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0290  SNase-like nuclease  84.35 
 
 		 227 aa  207  3e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1467  Excalibur domain-containing protein  59.68 
 
 		 259 aa  85.1  3e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2046  nuclease (SNase-like)  39.02 
 
 		 233 aa  80.1  0.000000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879712  normal  0.484882 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2245  nuclease (SNase domain protein)  58.93 
 
 		 183 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3707  nuclease (SNase domain protein)  53.85 
 
 		 171 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.112464  normal  0.156975 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3653  nuclease (SNase domain protein)  53.85 
 
 		 171 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0135  nuclease (SNase-like)  50 
 
 		 142 aa  50.4  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000156916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  43.64 
 
 		 171 aa  50.1  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1593  nuclease-like protein  32.74 
 
 		 196 aa  49.3  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4496  nuclease  43.64 
 
 		 187 aa  49.3  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  42.31 
 
 		 179 aa  47.8  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  41.82 
 
 		 183 aa  47  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  44.23 
 
 		 187 aa  46.6  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2407  nuclease (SNase domain protein)  40.38 
 
 		 158 aa  45.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000492982 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1199  nuclease, putative  36.84 
 
 		 187 aa  45.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000552466  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2526  SNase-like nuclease  38.6 
 
 		 171 aa  45.1  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0971838  normal  0.0202736 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2776  nuclease (SNase-like)  42.59 
 
 		 186 aa  45.1  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  38.46 
 
 		 169 aa  44.7  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2144  nuclease (SNase-like)  37.74 
 
 		 162 aa  44.3  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.149778  normal  0.293408 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1627  nuclease (SNase domain protein)  28.95 
 
 		 221 aa  43.5  0.0009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.839518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  36.07 
 
 		 232 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  42.86 
 
 		 244 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2515  nuclease (SNase domain protein)  28.95 
 
 		 221 aa  42.7  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.893874 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2377  SNase-like nuclease  40.38 
 
 		 185 aa  41.6  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0106322  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2942  prophage MuMc02, nuclease, putative  31.11 
 
 		 216 aa  40.8  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375298  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>