37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2106 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2106  hypothetical protein  100 
 
 
206 aa  431  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.415163  normal  0.123582 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3240  hypothetical protein  70.65 
 
 
185 aa  259  2e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3606  hypothetical protein  58.38 
 
 
206 aa  254  8e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.20256  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38662  predicted protein  39.57 
 
 
248 aa  119  1.9999999999999998e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_86822  predicted protein  36.96 
 
 
202 aa  109  3e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.836197 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0887  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.46 
 
 
504 aa  49.3  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.389457  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1820  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26 
 
 
174 aa  49.3  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0341047  normal  0.900404 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1362  TPR repeat-containing protein  31.78 
 
 
376 aa  49.3  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2023  TPR repeat-containing protein  24.24 
 
 
187 aa  48.5  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.665741  normal  0.869796 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 
301 aa  47  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1397  hypothetical protein  22.22 
 
 
253 aa  47  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  22.41 
 
 
4079 aa  46.6  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 
804 aa  45.8  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0192  TPR repeat-containing protein  28.04 
 
 
349 aa  45.1  0.0008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.906422  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6629  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.85 
 
 
458 aa  45.1  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0935269 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1009  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.14 
 
 
528 aa  45.1  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.781757  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  29.67 
 
 
602 aa  44.7  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0955  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.47 
 
 
220 aa  44.7  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.84 
 
 
373 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0897  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.14 
 
 
541 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.713797  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1062  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
290 aa  43.5  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 
1276 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  26.92 
 
 
1192 aa  43.1  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1798  TPR repeat-containing protein  25.71 
 
 
211 aa  42.7  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.53381e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5158  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.71 
 
 
474 aa  42.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.927175  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0299  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
458 aa  43.1  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0554  caspase-like domain- and TPR repeat-containing peptidase  32.88 
 
 
518 aa  43.1  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.463703 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  26.19 
 
 
1056 aa  42.7  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2468  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.76 
 
 
629 aa  42.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0996556  normal  0.406351 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1309  TPR repeat-containing protein  27.37 
 
 
515 aa  42.7  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153473  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  24.3 
 
 
635 aa  42.7  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2441  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 
687 aa  42.4  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0004983  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3555  lipoprotein NlpI  25 
 
 
302 aa  42  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000743312 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  28.77 
 
 
750 aa  42  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0454  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.58 
 
 
357 aa  41.6  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3965  TPR repeat-containing protein  23.37 
 
 
425 aa  41.6  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  24.39 
 
 
3035 aa  41.2  0.01  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>