21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1636 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1636  peptidase  100 
 
 
800 aa  1520    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1893  peptidase-like  33.21 
 
 
2632 aa  354  2.9999999999999997e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  29.69 
 
 
3193 aa  287  5.999999999999999e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1891  peptidase-like  28.59 
 
 
1156 aa  230  7e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0870492  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1974  peptidase-like  28.16 
 
 
1594 aa  227  6e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.195376  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1892  peptidase-like  28.04 
 
 
863 aa  201  3e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124288  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2814  peptidase-like  30.47 
 
 
2334 aa  189  2e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4303  peptidase-like  33.14 
 
 
1289 aa  172  2e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0594037  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1835  peptidyl-Asp metallopeptidase. metallo peptidase. MEROPS family M72  35.5 
 
 
2062 aa  136  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1461  peptidase-like  30.79 
 
 
715 aa  116  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.264021  normal  0.909062 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1886  peptidase  31.1 
 
 
827 aa  114  7.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.582939 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4572  peptidase M23B  37.87 
 
 
995 aa  93.6  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.109216  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3082  peptidase domain protein  23.26 
 
 
539 aa  66.2  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  23.25 
 
 
5839 aa  65.9  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.61 
 
 
891 aa  62.8  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.28 
 
 
1009 aa  60.8  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1649  peptidase-like  35.71 
 
 
167 aa  58.5  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.165499  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4197  peptidase domain protein  37.69 
 
 
1063 aa  55.5  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000751128  normal  0.547659 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1890  integrin, beta chain-like  41.25 
 
 
663 aa  49.3  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.77 
 
 
1113 aa  45.1  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0599  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.06 
 
 
1012 aa  44.7  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387425  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>