More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0704 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0704  30S ribosomal protein S8  100 
 
 
133 aa  271  2.0000000000000002e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000118286  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2572  30S ribosomal protein S8  91.73 
 
 
133 aa  253  6e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.675088  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2999  30S ribosomal protein S8  80.45 
 
 
133 aa  224  4e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.402588  hitchhiker  0.00660095 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1305  30S ribosomal protein S8  79.7 
 
 
133 aa  220  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.574405  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2219  30S ribosomal protein S8  75.94 
 
 
133 aa  216  7e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.969535  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3716  30S ribosomal protein S8  76.69 
 
 
133 aa  214  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23161  30S ribosomal protein S8  66.92 
 
 
133 aa  195  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0236  30S ribosomal protein S8  75.19 
 
 
133 aa  194  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.88489 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0239  30S ribosomal protein S8  75.19 
 
 
133 aa  194  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0363  30S ribosomal protein S8  65.41 
 
 
133 aa  194  5.000000000000001e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.10558  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16651  30S ribosomal protein S8  64.66 
 
 
133 aa  193  8.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1968  30S ribosomal protein S8  65.41 
 
 
133 aa  192  2e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1116  30S ribosomal protein S8  63.91 
 
 
133 aa  187  4e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19901  30S ribosomal protein S8  63.16 
 
 
133 aa  186  9e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17361  30S ribosomal protein S8  60.15 
 
 
133 aa  184  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1637  30S ribosomal protein S8  60.15 
 
 
133 aa  184  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17521  30S ribosomal protein S8  60.15 
 
 
133 aa  184  4e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17271  30S ribosomal protein S8  61.65 
 
 
133 aa  184  5e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0881  30S ribosomal protein S8  59.4 
 
 
132 aa  165  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.242013  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0239  ribosomal protein S8  58.33 
 
 
131 aa  160  8.000000000000001e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.363753  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0576  30S ribosomal protein S8  57.89 
 
 
132 aa  159  9e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1731  30S ribosomal protein S8  61.19 
 
 
132 aa  159  1e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000337802  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6600  ribosomal protein S8  57.14 
 
 
132 aa  159  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2697  ribosomal protein S8  60.47 
 
 
131 aa  158  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4012  30S ribosomal protein S8  54.89 
 
 
132 aa  157  4e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.0000631247 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2632  30S ribosomal protein S8  57.14 
 
 
132 aa  156  8e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.17852  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0436  30S ribosomal protein S8  54.14 
 
 
132 aa  156  9e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000494107  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2917  30S ribosomal protein S8  57.14 
 
 
132 aa  155  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0246807  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0300  30S ribosomal protein S8  54.89 
 
 
132 aa  155  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  normal  0.100936 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0641  ribosomal protein S8  54.14 
 
 
132 aa  154  3e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.968083  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0125  30S ribosomal protein S8  58.65 
 
 
132 aa  154  3e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1199  30S ribosomal protein S8  55.15 
 
 
135 aa  154  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0257081 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1171  30S ribosomal protein S8  54.62 
 
 
130 aa  154  4e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0152092  normal  0.183963 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3653  30S ribosomal protein S8  56.3 
 
 
133 aa  153  7e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00001719  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0772  30S ribosomal protein S8  54.89 
 
 
131 aa  153  9e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000396885  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4307  ribosomal protein S8  54.89 
 
 
132 aa  153  9e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.550875  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20730  SSU ribosomal protein S8P  55.64 
 
 
132 aa  153  9e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0119  30S ribosomal protein S8  56.39 
 
 
132 aa  152  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000110605  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3692  ribosomal protein S8  54.89 
 
 
132 aa  152  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0000284397  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04120  SSU ribosomal protein S8P  55.64 
 
 
132 aa  152  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10732  30S ribosomal protein S8  55.64 
 
 
132 aa  152  1e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.697308  normal  0.840798 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2319  ribosomal protein S8  53.68 
 
 
132 aa  152  1e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000478289  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4928  30S ribosomal protein S8  52.63 
 
 
132 aa  151  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000649182  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3403  ribosomal protein S8  54.14 
 
 
132 aa  152  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.337748  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0337  ribosomal protein S8  57.89 
 
 
130 aa  152  2e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000518879  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl137  30S ribosomal protein S8  57.36 
 
 
129 aa  151  2.9999999999999998e-36  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0702  30S ribosomal protein S8  54.14 
 
 
132 aa  151  2.9999999999999998e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0121  30S ribosomal protein S8  57.89 
 
 
132 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0229  30S ribosomal protein S8  52.63 
 
 
132 aa  151  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000764714  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0208  SSU ribosomal protein S8P  52.63 
 
 
132 aa  151  2.9999999999999998e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0121954  normal  0.508174 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4493  ribosomal protein S8  53.62 
 
 
136 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1100  30S ribosomal protein S8  54.14 
 
 
132 aa  151  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2645  ribosomal protein S8  52.63 
 
 
132 aa  150  4e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2263  30S ribosomal protein S8  51.88 
 
 
132 aa  150  4e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00271668  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1893  30S ribosomal protein S8  53.38 
 
 
132 aa  150  4e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000438805  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2304  30S ribosomal protein S8  51.88 
 
 
132 aa  150  4e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00657198  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1932  30S ribosomal protein S8  54.89 
 
 
132 aa  150  5e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1510  ribosomal protein S8  57.14 
 
 
134 aa  150  5e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.401558  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2141  SSU ribosomal protein S8P  53.38 
 
 
132 aa  150  5e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210808  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5138  ribosomal protein S8  54.89 
 
 
132 aa  150  5e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.632245 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2032  30S ribosomal protein S8  54.14 
 
 
132 aa  150  7e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1947  30S ribosomal protein S8  54.14 
 
 
132 aa  150  7e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0304  30S ribosomal protein S8  53.38 
 
 
132 aa  150  7e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  1.2871700000000001e-28 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3010  30S ribosomal protein S8  54.81 
 
 
133 aa  150  8e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0643705  hitchhiker  0.00964869 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0124  30S ribosomal protein S8  55.64 
 
 
132 aa  149  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000599604  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0124  30S ribosomal protein S8  55.64 
 
 
132 aa  149  8.999999999999999e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000492709  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0120  30S ribosomal protein S8  55.64 
 
 
132 aa  149  8.999999999999999e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.00907e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0118  30S ribosomal protein S8  55.64 
 
 
132 aa  149  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000509251  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0124  30S ribosomal protein S8  55.64 
 
 
132 aa  149  8.999999999999999e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000367768  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5181  30S ribosomal protein S8  55.64 
 
 
132 aa  149  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000454317  unclonable  1.4651299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0136  30S ribosomal protein S8  55.64 
 
 
132 aa  149  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.126e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0155  30S ribosomal protein S8  55.64 
 
 
132 aa  149  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000000616269  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0145  30S ribosomal protein S8  55.64 
 
 
132 aa  149  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000739316  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1817  30S ribosomal protein S8  51.13 
 
 
132 aa  149  1e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.266254  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0118  30S ribosomal protein S8  55.64 
 
 
132 aa  149  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000179838  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_430  ribosomal protein S8  54.62 
 
 
131 aa  149  1e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000283482  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2446  30S ribosomal protein S8  54.26 
 
 
130 aa  149  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.621263 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0945  ribosomal protein S8  53.38 
 
 
132 aa  149  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.26193  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1925  30S ribosomal protein S8  54.14 
 
 
132 aa  149  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.452799 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0320  SSU ribosomal protein S8P  56.06 
 
 
134 aa  149  1e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00355814 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1029  30S ribosomal protein S8  54.14 
 
 
132 aa  149  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00000138076  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3981  ribosomal protein S8  52.24 
 
 
131 aa  148  2e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0995  30S ribosomal protein S8  54.89 
 
 
131 aa  148  2e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.159174  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1046  30S ribosomal protein S8  54.14 
 
 
132 aa  149  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000643761  normal  0.194021 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0465  30S ribosomal protein S8  53.85 
 
 
131 aa  149  2e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000455878  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1058  30S ribosomal protein S8  54.14 
 
 
132 aa  149  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000455347  normal  0.366439 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5033  30S ribosomal protein S8  54.14 
 
 
132 aa  148  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000369377  normal  0.531992 
 
 
-
 
NC_002936  DET0488  30S ribosomal protein S8  53.85 
 
 
131 aa  148  3e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000071854  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2700  30S ribosomal protein S8  51.88 
 
 
132 aa  148  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2385  30S ribosomal protein S8  51.88 
 
 
132 aa  148  3e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3129  ribosomal protein S8  54.62 
 
 
130 aa  148  3e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0209  30S ribosomal protein S8  51.88 
 
 
132 aa  148  3e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4301  30S ribosomal protein S8  55.15 
 
 
135 aa  148  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.660154  hitchhiker  0.00325802 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1336  30S ribosomal protein S8  54.14 
 
 
132 aa  148  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000316434  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0072  30S ribosomal protein S8  51.13 
 
 
132 aa  147  4e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00771687  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05790  ribosomal protein S8  49.61 
 
 
132 aa  147  4e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0682  30S ribosomal protein S8  55.81 
 
 
129 aa  147  6e-35  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2962  30S ribosomal protein S8  51.13 
 
 
132 aa  147  6e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00876753  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3909  30S ribosomal protein S8  54.41 
 
 
135 aa  146  7e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.239493  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1137  ribosomal protein S8  53.38 
 
 
132 aa  147  7e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>