18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0607 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_0607  Ig domain protein  100 
 
 		 334 aa  684    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0857  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  34.56 
 
 		 619 aa  126  6e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1555  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  30.53 
 
 		 612 aa  89.7  6e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.428291  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1617  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  30.53 
 
 		 606 aa  89.7  7e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0588913  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04100  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  31.29 
 
 		 557 aa  77  0.0000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14870  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  28.99 
 
 		 916 aa  68.2  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.44593  normal  0.0967933 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6906  glycoside hydrolase family 16  35.92 
 
 		 628 aa  61.6  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00349487  hitchhiker  0.000227833 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0385  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  25.23 
 
 		 732 aa  60.5  0.00000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.677811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2448  putative secreted protein  44.87 
 
 		 1363 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.903982 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3080  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  27.01 
 
 		 777 aa  55.1  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0685  fibronectin type III domain-containing protein  43.06 
 
 		 1686 aa  54.3  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1003  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  25.96 
 
 		 897 aa  54.3  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.629221  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2348  Ig-related protein  40 
 
 		 1036 aa  49.3  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0040576  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1474  beta-galactosidase  34.21 
 
 		 1355 aa  47  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0102  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  36.11 
 
 		 1781 aa  46.2  0.0009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.432951 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01090  Ig-like domain-containing protein  36.51 
 
 		 583 aa  45.4  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04290  putative carbohydrate-binding protein with Ig-like domain, F5/8 type C domain and ricin-type beta-trefoil lectin domain  38.46 
 
 		 1410 aa  45.1  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01458  hypothetical protein  37.1 
 
 		 1419 aa  44.3  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.523698  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>