33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3973 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3973  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 98 aa  191  2e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3755  transcriptional regulator, XRE family  62.12 
 
 		 87 aa  78.6  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2426  hypothetical protein  38.33 
 
 		 75 aa  47.4  0.00006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5678  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 90 aa  47.4  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.669501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1776  transcriptional regulator, XRE family  39.73 
 
 		 79 aa  47.4  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0912116  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0857  transcriptional regulator, putative  42.11 
 
 		 74 aa  46.6  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000197317 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0249  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 68 aa  45.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2168  transcriptional regulator, XRE family  41.07 
 
 		 68 aa  45.1  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.117298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0212  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 68 aa  45.1  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4154  hypothetical protein  42.37 
 
 		 82 aa  44.3  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2711  hypothetical protein  42.11 
 
 		 94 aa  44.3  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.75348 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2290  hypothetical protein  36.51 
 
 		 74 aa  43.9  0.0007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0496  DNA-binding protein, putative  38.6 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03585  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 206 aa  43.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0283  XRE family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1196  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.151247 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2282  XRE family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.545722  normal  0.280221 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2575  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 230 aa  41.6  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1918  transcriptional regulator, XRE family  41.51 
 
 		 94 aa  41.6  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0543598  normal  0.812558 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2161  helix-turn-helix domain-containing protein  38.46 
 
 		 126 aa  41.6  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2954  putative addiction module antidote protein  45.45 
 
 		 109 aa  41.6  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.331148  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3153  transcriptional regulator, XRE family  33.7 
 
 		 290 aa  41.2  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2661  putative transcription regulator protein  45.28 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.574569 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2034  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 83 aa  40.8  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.194194 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6366  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 191 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0311191  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1712  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 191 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526366  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1727  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 191 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170715  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3342  putative transcriptional regulatory protein  29.59 
 
 		 87 aa  40.4  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0179651  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30630  transcription regulator protein  39.68 
 
 		 122 aa  40.4  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.635425  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5665  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 156 aa  40.4  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5293  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 81 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5392  helix-turn-helix domain-containing protein  40.38 
 
 		 183 aa  40  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.471231  normal  0.0187132 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5565  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 81 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>