67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3022 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3022  hypothetical protein  100 
 
 
395 aa  790    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.628375  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2734  hypothetical protein  61.62 
 
 
378 aa  440  9.999999999999999e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00345786 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1330  hypothetical protein  43.12 
 
 
353 aa  257  3e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789559  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4328  hypothetical protein  43.37 
 
 
353 aa  233  6e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0822537 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02110  hypothetical protein  33.51 
 
 
384 aa  167  4e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.447654  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5001  hypothetical protein  30.86 
 
 
352 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0712295  normal  0.0100104 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5273  hypothetical protein  28.73 
 
 
357 aa  161  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2788  hypothetical protein  33.06 
 
 
369 aa  152  1e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0878  hypothetical protein  26.61 
 
 
357 aa  128  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6445  hypothetical protein  30.79 
 
 
412 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0946516  normal  0.0409741 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5047  hypothetical protein  30.73 
 
 
374 aa  122  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1894  hypothetical protein  30.45 
 
 
367 aa  117  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143005  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1325  hypothetical protein  30.91 
 
 
383 aa  117  5e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.397251  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6013  hypothetical protein  32.27 
 
 
342 aa  115  8.999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.994195  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2094  hypothetical protein  30.92 
 
 
370 aa  107  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0155004  normal  0.0950605 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4094  hypothetical protein  26.95 
 
 
389 aa  94.4  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5370  hypothetical protein  28.2 
 
 
371 aa  94  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.861425 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0283  hypothetical protein  22.16 
 
 
367 aa  82.4  0.00000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3211  hypothetical protein  29.38 
 
 
368 aa  82.8  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.474284  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4736  hypothetical protein  24.85 
 
 
366 aa  81.6  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.968842 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5461  hypothetical protein  26.45 
 
 
367 aa  78.2  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.898004  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2728  hypothetical protein  27.65 
 
 
367 aa  77.8  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.683635  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1484  hypothetical protein  25.47 
 
 
378 aa  77.8  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0801709  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2452  hypothetical protein  26.25 
 
 
384 aa  71.6  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000678716  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7095  hypothetical protein  26.5 
 
 
362 aa  71.2  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0405  hypothetical protein  29.25 
 
 
394 aa  70.5  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.499307  normal  0.272447 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1617  hypothetical protein  34.94 
 
 
391 aa  69.7  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.862313  normal  0.915931 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1142  hypothetical protein  22.83 
 
 
372 aa  69.3  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.561604  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3996  hypothetical protein  26.55 
 
 
397 aa  68.9  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.880784  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3338  hypothetical protein  29.18 
 
 
395 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7108  hypothetical protein  28.49 
 
 
387 aa  67.4  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.273158  normal  0.753701 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0441  hypothetical protein  27.37 
 
 
373 aa  66.2  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.22704 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5228  hypothetical protein  27.01 
 
 
383 aa  65.1  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160159  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7635  hypothetical protein  26.45 
 
 
363 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.678328 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0975  hypothetical protein  32.52 
 
 
377 aa  65.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0139  hypothetical protein  26.59 
 
 
393 aa  64.7  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0821  hypothetical protein  28.24 
 
 
391 aa  64.7  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.452627  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2792  hypothetical protein  24.71 
 
 
362 aa  64.3  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0226993  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3454  hypothetical protein  34.34 
 
 
396 aa  63.9  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.863709  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5246  hypothetical protein  26.61 
 
 
366 aa  63.5  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.422141 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4303  hypothetical protein  26.42 
 
 
374 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4984  hypothetical protein  27.33 
 
 
373 aa  61.2  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.405454  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1792  hypothetical protein  25.45 
 
 
377 aa  60.8  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3538  hypothetical protein  27.64 
 
 
398 aa  59.7  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4150  hypothetical protein  28.23 
 
 
374 aa  59.7  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4070  hypothetical protein  26.34 
 
 
365 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0178352  normal  0.419833 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3370  hypothetical protein  24.77 
 
 
368 aa  58.2  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.357323 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3488  hypothetical protein  28.23 
 
 
355 aa  58.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3510  hypothetical protein  27.7 
 
 
404 aa  56.6  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0541422  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5325  hypothetical protein  25.65 
 
 
365 aa  56.2  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4213  hypothetical protein  30.97 
 
 
397 aa  55.8  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4016  hypothetical protein  26.83 
 
 
385 aa  56.2  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.102828  normal  0.620979 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3547  hypothetical protein  25.87 
 
 
412 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.412698 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1410  hypothetical protein  28.62 
 
 
352 aa  55.5  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.246412  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0019  hypothetical protein  31.97 
 
 
389 aa  53.9  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2067  hypothetical protein  30 
 
 
379 aa  53.5  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0357547 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4281  hypothetical protein  25.14 
 
 
374 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.355185  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4941  hypothetical protein  29.08 
 
 
392 aa  52.8  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0164  hypothetical protein  24.74 
 
 
355 aa  51.6  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6205  hypothetical protein  24.73 
 
 
372 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.454836  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3435  protein of unknown function DUF1006  24.13 
 
 
382 aa  50.1  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0286  hypothetical protein  27.49 
 
 
375 aa  48.9  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.513722 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3001  hypothetical protein  25.66 
 
 
355 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0393285  normal  0.0371418 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1142  hypothetical protein  26.79 
 
 
392 aa  45.1  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.202037  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3523  hypothetical protein  27.67 
 
 
375 aa  44.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2986  hypothetical protein  28.09 
 
 
355 aa  42.7  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.223704  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3030  hypothetical protein  28.09 
 
 
355 aa  42.7  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>