46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2370 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2370  von Willebrand factor, type A  100 
 
 
336 aa  667    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2127  von Willebrand factor type A  61.54 
 
 
317 aa  350  2e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000421408 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3961  von Willebrand factor type A  37.24 
 
 
399 aa  191  2e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.308126 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18980  von Willebrand factor type A-like protein  37.27 
 
 
331 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.136451  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35740  von Willebrand factor type A-like protein  40.08 
 
 
341 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.496633  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2454  von Willebrand factor type A  38.15 
 
 
332 aa  159  5e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00561279 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3079  von Willebrand factor type A  37.74 
 
 
364 aa  136  4e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0708582  hitchhiker  0.000000341622 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0710  von Willebrand factor type A domain protein  26.25 
 
 
371 aa  106  4e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.283279 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0043  hypothetical protein  29.92 
 
 
304 aa  82.8  0.000000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.4949 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1985  hypothetical protein  26.85 
 
 
343 aa  80.5  0.00000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.184995  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0875  hypothetical protein  30.28 
 
 
302 aa  79.7  0.00000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.134729  normal  0.367408 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5542  hypothetical protein  29.52 
 
 
297 aa  79.3  0.00000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5161  hypothetical protein  29.52 
 
 
297 aa  79.3  0.00000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5250  hypothetical protein  29.52 
 
 
297 aa  79.3  0.00000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02145  hypothetical protein  21.15 
 
 
346 aa  60.8  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2318  von Willebrand factor type A  28.14 
 
 
339 aa  56.6  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1908  hypothetical protein  19.44 
 
 
319 aa  55.1  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.137204 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0524  hypothetical protein  25.25 
 
 
320 aa  54.3  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5483  von Willebrand factor type A  24.88 
 
 
320 aa  53.9  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0243  von Willebrand factor type A  27.98 
 
 
343 aa  53.9  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0131225  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2667  von Willebrand factor type A  24.87 
 
 
320 aa  53.5  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0137073  normal  0.240647 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2319  von Willebrand factor type A  27.59 
 
 
331 aa  53.5  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2655  BatA-like protein, aerotolerance-related  24.06 
 
 
351 aa  53.1  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3085  batB protein, putative  27.85 
 
 
328 aa  52.8  0.000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0242  von Willebrand factor type A  24.8 
 
 
336 aa  52.8  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0239154  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1106  hypothetical protein  23.8 
 
 
318 aa  52  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1525  von Willebrand factor, type A  22.38 
 
 
330 aa  52  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1733  von Willebrand factor type A  23.4 
 
 
342 aa  50.1  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.818001  normal  0.561199 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2291  von Willebrand factor type A  25.21 
 
 
340 aa  49.7  0.00007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1122  von Willebrand factor type A  21.83 
 
 
335 aa  49.7  0.00007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.51147  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2029  von Willebrand factor type A domain-containing protein  27.52 
 
 
358 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.34439  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3713  von Willebrand factor, type A  27.52 
 
 
358 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.512513  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2452  von Willebrand factor, type A  21.69 
 
 
344 aa  47.4  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1887  von Willebrand factor, type A  24.02 
 
 
334 aa  47  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.615946  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0649  von Willebrand factor, type A  25.56 
 
 
471 aa  46.6  0.0007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1582  batA protein  22.35 
 
 
327 aa  45.4  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0073  von Willebrand factor, type A  24.2 
 
 
349 aa  45.8  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1948  von Willebrand factor, type A  23.49 
 
 
339 aa  45.4  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1561  von Willebrand factor type A  26.85 
 
 
358 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.604958 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0098  von Willebrand factor, type A  26.73 
 
 
363 aa  44.7  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4900  von Willebrand factor type A  29 
 
 
337 aa  45.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2681  von Willebrand factor, type A  22.22 
 
 
334 aa  43.9  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1744  BatB protein, putative  24 
 
 
341 aa  43.9  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0720  von Willebrand factor, type A  22.5 
 
 
344 aa  43.5  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.799777  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2292  von Willebrand factor type A  25.29 
 
 
325 aa  43.5  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2438  von Willebrand factor type A  27.46 
 
 
315 aa  43.5  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>