111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0842 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_0842  hypothetical protein  100 
 
 		 377 aa  765    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0960  hypothetical protein  67.73 
 
 		 381 aa  501  1e-141  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3234  hypothetical protein  52.04 
 
 		 361 aa  357  9.999999999999999e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11250  predicted Rossmann fold nucleotide-binding protein  43.51 
 
 		 392 aa  241  1e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.818521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6766  hypothetical protein  40.46 
 
 		 360 aa  209  5e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2047  hypothetical protein  27.6 
 
 		 245 aa  64.7  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0014212  normal  0.263203 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3030  hypothetical protein  26.58 
 
 		 235 aa  58.9  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.862157  hitchhiker  0.00666776 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0395  hypothetical protein  28.38 
 
 		 245 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0342519  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0806  hypothetical protein  30.59 
 
 		 267 aa  58.2  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.489855 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1555  hypothetical protein  24.54 
 
 		 273 aa  57  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6911  hypothetical protein  28.09 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.135288  normal  0.167118 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8428  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  28.24 
 
 		 267 aa  56.2  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0774  hypothetical protein  30.56 
 
 		 255 aa  55.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7947  hypothetical protein  28.25 
 
 		 259 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0357  hypothetical protein  27.73 
 
 		 245 aa  55.1  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.216985  normal  0.764349 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0297  hypothetical protein  28.57 
 
 		 240 aa  54.7  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1863  hypothetical protein  27.53 
 
 		 217 aa  53.5  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.9915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4494  hypothetical protein  26.11 
 
 		 252 aa  53.5  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.535293  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3871  hypothetical protein  26.11 
 
 		 252 aa  53.5  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3656  hypothetical protein  26.11 
 
 		 252 aa  53.5  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.387963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0269  hypothetical protein  27.59 
 
 		 270 aa  53.5  0.000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2219  hypothetical protein  26.11 
 
 		 252 aa  53.1  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1495  putative dape protein  27.89 
 
 		 291 aa  53.1  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.395565  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4084  hypothetical protein  28.09 
 
 		 275 aa  52.8  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16211  dehydrogenase  25.66 
 
 		 288 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1082  hypothetical protein  26.57 
 
 		 225 aa  52.4  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.396045  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0604  decarboxylase family protein  26.26 
 
 		 249 aa  51.6  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.266669  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3242  hypothetical protein  26.11 
 
 		 252 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0247899 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3662  hypothetical protein  25.69 
 
 		 263 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0914373  normal  0.810533 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4828  hypothetical protein  25.56 
 
 		 252 aa  52  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.203832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3768  hypothetical protein  26.11 
 
 		 252 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00574254  hitchhiker  0.00551314 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1298  hypothetical protein  28.65 
 
 		 288 aa  51.2  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.244078  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19460  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  27.37 
 
 		 288 aa  51.2  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0125018 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0875  hypothetical protein  29.22 
 
 		 332 aa  50.4  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.237559 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2390  hypothetical protein  25.57 
 
 		 245 aa  50.4  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.311617  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11771  Rossmann fold nucleotide-binding protein  24.67 
 
 		 282 aa  50.1  0.00006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0454643 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0462  putative dape gene and orf2  24.67 
 
 		 282 aa  49.7  0.00008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25950  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  29.03 
 
 		 280 aa  49.7  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256647  normal  0.891073 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0496  hypothetical protein  29.73 
 
 		 269 aa  48.9  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12211  dehydrogenase  26.53 
 
 		 294 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.316821  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4048  hypothetical protein  24.42 
 
 		 266 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4418  hypothetical protein  24.76 
 
 		 247 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.52452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0471  hypothetical protein  30.53 
 
 		 292 aa  49.3  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.359118  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2928  hypothetical protein  28.65 
 
 		 263 aa  49.3  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00045368 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15410  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 1 TIGR00725/conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2 TIGR00730  28.64 
 
 		 267 aa  49.3  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.47781  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11220  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  25.11 
 
 		 266 aa  48.9  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124999  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0164  hypothetical protein  23.26 
 
 		 242 aa  48.5  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2835  hypothetical protein  25.56 
 
 		 247 aa  48.5  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5908  hypothetical protein  28.48 
 
 		 342 aa  48.5  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0391937  normal  0.412056 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6789  hypothetical protein  25.56 
 
 		 218 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0818446  hitchhiker  0.00000113726 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1201  hypothetical protein  29.09 
 
 		 243 aa  47.8  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1499  decarboxylase family protein  25.14 
 
 		 244 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780956  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1695  decarboxylase family protein  25.14 
 
 		 244 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.232557  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2547  hypothetical protein  25.14 
 
 		 244 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0928666  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2404  decarboxylase family protein  25.14 
 
 		 244 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0352  decarboxylase family protein  25.14 
 
 		 244 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3814  hypothetical protein  24.65 
 
 		 241 aa  48.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.383956  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3314  hypothetical protein  25.2 
 
 		 270 aa  48.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.686515  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0318  decarboxylase family protein  25.14 
 
 		 249 aa  47.8  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0852  decarboxylase family protein  25.14 
 
 		 249 aa  47.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.134375  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2215  hypothetical protein  25.23 
 
 		 263 aa  47.4  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.531186  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0045  hypothetical protein  26.7 
 
 		 268 aa  47.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06300  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  29.3 
 
 		 260 aa  47.4  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1132  hypothetical protein  25.73 
 
 		 274 aa  47  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0045  hypothetical protein  25 
 
 		 241 aa  47  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.666378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2800  hypothetical protein  28.65 
 
 		 275 aa  47  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.983756  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0974  hypothetical protein  25 
 
 		 229 aa  47.4  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130247 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1602  hypothetical protein  37.31 
 
 		 218 aa  47  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0899  hypothetical protein  26.87 
 
 		 340 aa  47.4  0.0005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.114072  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2756  decarboxylase family protein  29.27 
 
 		 292 aa  47  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2614  decarboxylase family protein  29.27 
 
 		 292 aa  47  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.672113  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0540  hypothetical protein  27.09 
 
 		 299 aa  46.6  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.612157  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4300  hypothetical protein  27.68 
 
 		 262 aa  46.6  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.336059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1022  decarboxylase family protein  29.27 
 
 		 315 aa  46.6  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0454  decarboxylase family protein  30.25 
 
 		 318 aa  46.6  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6192  hypothetical protein  28.48 
 
 		 342 aa  46.6  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.194706  normal  0.269121 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3081  hypothetical protein  24.31 
 
 		 243 aa  46.6  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000255019 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2835  hypothetical protein  21.76 
 
 		 216 aa  46.6  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000181982  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0682  putative DNA uptake protein  24.86 
 
 		 313 aa  46.2  0.0009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1094  hypothetical protein  26.64 
 
 		 279 aa  45.8  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.208202  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1915  hypothetical protein  25.14 
 
 		 266 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1542  hypothetical protein  25.56 
 
 		 304 aa  46.2  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0225266  normal  0.747447 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1161  hypothetical protein  27.78 
 
 		 264 aa  45.8  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0567  hypothetical protein  24.19 
 
 		 242 aa  45.8  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.892575  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1849  hypothetical protein  25.45 
 
 		 245 aa  46.2  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0086  hypothetical protein  35.71 
 
 		 241 aa  45.8  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10023  hypothetical protein  23.74 
 
 		 229 aa  45.4  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0872  hypothetical protein  23.33 
 
 		 239 aa  45.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.736442  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1265  hypothetical protein  27.17 
 
 		 288 aa  44.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0810477  normal  0.0231273 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2625  hypothetical protein  23.33 
 
 		 239 aa  45.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.553648 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2793  hypothetical protein  25.24 
 
 		 268 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0977  hypothetical protein  26.39 
 
 		 268 aa  45.1  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.213763  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2520  hypothetical protein  27.84 
 
 		 260 aa  45.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177513 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0727  hypothetical protein  24.5 
 
 		 247 aa  45.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0158  decarboxylase family protein  28.66 
 
 		 319 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1327  decarboxylase family protein  28.66 
 
 		 319 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1082  hypothetical protein  25.97 
 
 		 301 aa  44.7  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.868958  normal  0.280339 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0183  decarboxylase family protein  28.66 
 
 		 319 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2436  hypothetical protein  24.44 
 
 		 317 aa  44.7  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3841  hypothetical protein  29.88 
 
 		 258 aa  44.3  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.107126 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>