116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6766 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6766  hypothetical protein  100 
 
 		 360 aa  717    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0960  hypothetical protein  43.99 
 
 		 381 aa  233  3e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3234  hypothetical protein  41.46 
 
 		 361 aa  218  1e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0842  hypothetical protein  40.46 
 
 		 377 aa  214  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11250  predicted Rossmann fold nucleotide-binding protein  41.18 
 
 		 392 aa  201  1.9999999999999998e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.818521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4084  hypothetical protein  28.45 
 
 		 275 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3662  hypothetical protein  32 
 
 		 263 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0914373  normal  0.810533 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3898  hypothetical protein  28 
 
 		 261 aa  62  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0758722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4048  hypothetical protein  31.15 
 
 		 266 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1089  hypothetical protein  25.66 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3081  hypothetical protein  27.68 
 
 		 243 aa  60.8  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000255019 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1173  hypothetical protein  28.64 
 
 		 266 aa  60.1  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0612248  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3314  hypothetical protein  31.02 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.686515  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1863  hypothetical protein  26.84 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.9915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2520  hypothetical protein  29.8 
 
 		 260 aa  59.3  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177513 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2800  hypothetical protein  29.1 
 
 		 275 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.983756  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2032  hypothetical protein  27.23 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15410  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 1 TIGR00725/conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2 TIGR00730  30.73 
 
 		 267 aa  56.6  0.0000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.47781  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1555  hypothetical protein  26.37 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2426  lysine decarboxylase family protein  26.36 
 
 		 249 aa  55.5  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000109192 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0875  hypothetical protein  30.12 
 
 		 332 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.237559 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3091  decarboxylase family protein  27.76 
 
 		 454 aa  54.3  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00268916  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3379  hypothetical protein  27.8 
 
 		 260 aa  53.9  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.063845 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1161  hypothetical protein  30.22 
 
 		 264 aa  53.5  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2015  hypothetical protein  27.06 
 
 		 205 aa  53.1  0.000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2487  hypothetical protein  26.82 
 
 		 287 aa  52.8  0.000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.100188 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1018  hypothetical protein  25.89 
 
 		 196 aa  52.8  0.000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1373  hypothetical protein  26.82 
 
 		 287 aa  52.8  0.000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2047  hypothetical protein  24.25 
 
 		 245 aa  52.8  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0014212  normal  0.263203 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3841  hypothetical protein  28.08 
 
 		 258 aa  52  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.107126 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19460  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  29.28 
 
 		 288 aa  52  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0125018 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4300  hypothetical protein  26.59 
 
 		 262 aa  52  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.336059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1082  hypothetical protein  27.27 
 
 		 225 aa  51.2  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.396045  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06300  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  28.25 
 
 		 260 aa  51.2  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3023  hypothetical protein  28.31 
 
 		 248 aa  51.2  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.897661  normal  0.886093 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0872  hypothetical protein  25.14 
 
 		 239 aa  50.8  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.736442  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4494  hypothetical protein  25.29 
 
 		 252 aa  50.4  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.535293  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3871  hypothetical protein  25.29 
 
 		 252 aa  50.4  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4828  hypothetical protein  25.29 
 
 		 252 aa  50.1  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.203832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3656  hypothetical protein  25.29 
 
 		 252 aa  50.4  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.387963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0868  conserved hypothetical protein TIGR00730  25.24 
 
 		 266 aa  50.1  0.00006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0604  decarboxylase family protein  25.14 
 
 		 249 aa  50.1  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.266669  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2215  hypothetical protein  29.3 
 
 		 263 aa  50.1  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.531186  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6911  hypothetical protein  27.42 
 
 		 261 aa  50.1  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.135288  normal  0.167118 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0774  hypothetical protein  29.15 
 
 		 255 aa  49.7  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2835  hypothetical protein  22.37 
 
 		 216 aa  49.7  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000181982  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2839  hypothetical protein  26.63 
 
 		 271 aa  49.3  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2835  hypothetical protein  24.71 
 
 		 247 aa  49.3  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1809  hypothetical protein  27.11 
 
 		 454 aa  48.9  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2625  hypothetical protein  23.87 
 
 		 239 aa  48.9  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.553648 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3242  hypothetical protein  25.29 
 
 		 252 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0247899 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8428  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  28.33 
 
 		 267 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3768  hypothetical protein  25.29 
 
 		 252 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00574254  hitchhiker  0.00551314 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0496  hypothetical protein  27.23 
 
 		 269 aa  48.1  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2219  hypothetical protein  24.57 
 
 		 252 aa  48.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0357  hypothetical protein  27.59 
 
 		 245 aa  48.5  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.216985  normal  0.764349 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3650  hypothetical protein  23.85 
 
 		 460 aa  48.5  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1915  hypothetical protein  24.11 
 
 		 266 aa  48.5  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1441  hypothetical protein  25.56 
 
 		 197 aa  48.1  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00785449  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6789  hypothetical protein  24.71 
 
 		 218 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0818446  hitchhiker  0.00000113726 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0682  putative DNA uptake protein  26.07 
 
 		 313 aa  48.9  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7947  hypothetical protein  27.66 
 
 		 259 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0318  decarboxylase family protein  24.57 
 
 		 249 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0852  decarboxylase family protein  24.57 
 
 		 249 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.134375  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1499  decarboxylase family protein  24.57 
 
 		 244 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780956  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1695  decarboxylase family protein  24.57 
 
 		 244 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.232557  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2547  hypothetical protein  24.57 
 
 		 244 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0928666  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2404  decarboxylase family protein  24.57 
 
 		 244 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0352  decarboxylase family protein  24.57 
 
 		 244 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4418  hypothetical protein  24.71 
 
 		 247 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.52452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0395  hypothetical protein  25.45 
 
 		 245 aa  47.8  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0342519  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3030  hypothetical protein  25.68 
 
 		 235 aa  47.4  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.862157  hitchhiker  0.00666776 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4407  hypothetical protein  26.26 
 
 		 318 aa  47.4  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0974  hypothetical protein  22.61 
 
 		 229 aa  47.4  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130247 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0476  hypothetical protein  26.05 
 
 		 218 aa  47.4  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3801  hypothetical protein  26.76 
 
 		 454 aa  47.4  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.121315  hitchhiker  0.00000603572 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0269  hypothetical protein  27.23 
 
 		 270 aa  47  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0977  hypothetical protein  28.31 
 
 		 268 aa  47  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.213763  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0727  hypothetical protein  24.89 
 
 		 247 aa  47  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4023  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  35.37 
 
 		 635 aa  46.6  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.625051  normal  0.0865565 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2231  hypothetical protein  24.14 
 
 		 317 aa  45.8  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0164  hypothetical protein  23.5 
 
 		 242 aa  45.8  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1542  hypothetical protein  26.06 
 
 		 304 aa  45.8  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0225266  normal  0.747447 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0709  hypothetical protein  23.81 
 
 		 259 aa  46.2  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1094  hypothetical protein  26.29 
 
 		 279 aa  45.4  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.208202  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2756  decarboxylase family protein  27.78 
 
 		 292 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2614  decarboxylase family protein  27.78 
 
 		 292 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.672113  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3751  hypothetical protein  27.15 
 
 		 283 aa  45.4  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0136365  normal  0.197215 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4510  hypothetical protein  23.29 
 
 		 242 aa  46.2  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.649813  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2436  hypothetical protein  22.99 
 
 		 317 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14401  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2928  hypothetical protein  28.64 
 
 		 263 aa  46.2  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00045368 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5499  hypothetical protein  43.75 
 
 		 241 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.026859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2452  hypothetical protein  23.59 
 
 		 242 aa  45.1  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1022  decarboxylase family protein  27.62 
 
 		 315 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0454  decarboxylase family protein  28.74 
 
 		 318 aa  44.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1842  hypothetical protein  29.06 
 
 		 289 aa  45.1  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0573823  normal  0.171511 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3301  hypothetical protein  25.14 
 
 		 301 aa  44.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0516405  normal  0.954723 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0299  hypothetical protein  22.38 
 
 		 244 aa  45.1  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000150026  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1298  hypothetical protein  31.94 
 
 		 288 aa  45.1  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.244078  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2043  hypothetical protein  22.41 
 
 		 317 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>