More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1154 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1154  ribosomal protein L16  100 
 
 		 141 aa  285  1e-76  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000356332  hitchhiker  0.0000299058 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23400  LSU ribosomal protein L16P  80.71 
 
 		 143 aa  228  3e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000203395  hitchhiker  0.00000101059 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2171  ribosomal protein L16  80 
 
 		 140 aa  221  4e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.501834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09930  LSU ribosomal protein L16P  79.85 
 
 		 140 aa  216  7e-56  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.11543  hitchhiker  0.0000034816 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01240  50S ribosomal protein L16  68.57 
 
 		 144 aa  200  7e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.844455  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2910  50S ribosomal protein L16  72.86 
 
 		 145 aa  199  9e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0118  50S ribosomal protein L16  69.29 
 
 		 144 aa  199  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0312557  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2289  50S ribosomal protein L16  69.06 
 
 		 139 aa  198  1.9999999999999998e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000386576  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1517  ribosomal protein L16  70.9 
 
 		 151 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.592014  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0114  50S ribosomal protein L16  68.57 
 
 		 141 aa  198  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0117  50S ribosomal protein L16  68.09 
 
 		 144 aa  197  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000995896  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0117  50S ribosomal protein L16  68.09 
 
 		 144 aa  197  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000580753  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0113  50S ribosomal protein L16  68.09 
 
 		 144 aa  197  3.9999999999999996e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.719700000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0111  50S ribosomal protein L16  68.09 
 
 		 144 aa  197  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000723278  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0117  50S ribosomal protein L16  68.09 
 
 		 144 aa  197  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167847  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0138  50S ribosomal protein L16  68.09 
 
 		 144 aa  197  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000009071  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0129  50S ribosomal protein L16  68.09 
 
 		 144 aa  197  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.87351e-62 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2704  ribosomal protein L16  67.86 
 
 		 145 aa  197  3.9999999999999996e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.589348  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5188  50S ribosomal protein L16  68.09 
 
 		 144 aa  197  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000330931  unclonable  1.07151e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0148  50S ribosomal protein L16  68.09 
 
 		 144 aa  197  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139217  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0111  50S ribosomal protein L16  67.38 
 
 		 144 aa  197  6e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000578104  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1844  50S ribosomal protein L16  68.35 
 
 		 139 aa  196  6e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.242343  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0296  50S ribosomal protein L16  68.12 
 
 		 139 aa  196  7.999999999999999e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0429  50S ribosomal protein L16  69.06 
 
 		 145 aa  196  7.999999999999999e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0009964  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0112  50S ribosomal protein L16  68.09 
 
 		 144 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000501448  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2416  50S ribosomal protein L16  67.63 
 
 		 139 aa  194  3e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000559542  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2057  50S ribosomal protein L16  68.35 
 
 		 139 aa  194  4.0000000000000005e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00129703  normal  0.24244 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0874  50S ribosomal protein L16  67.38 
 
 		 144 aa  193  7e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000946353  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0765  50S ribosomal protein L16  68.35 
 
 		 145 aa  192  9e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000894235  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2148  50S ribosomal protein L16  68.15 
 
 		 138 aa  192  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0586575  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0201  50S ribosomal protein L16  65.71 
 
 		 144 aa  192  1e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.126239  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3660  50S ribosomal protein L16  71.43 
 
 		 145 aa  192  2e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000506256  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0405  ribosomal protein L16  68.38 
 
 		 145 aa  192  2e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0188  50S ribosomal protein L16  66.19 
 
 		 139 aa  191  3e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000404592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0242  50S ribosomal protein L16  64.96 
 
 		 139 aa  191  4e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0245  50S ribosomal protein L16  64.96 
 
 		 139 aa  191  4e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3751  ribosomal protein L16  67.88 
 
 		 138 aa  190  5e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.596484  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2222  50S ribosomal protein L16  65.47 
 
 		 139 aa  189  8e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000157972  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2707  50S ribosomal protein L16  66.91 
 
 		 144 aa  189  9e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2392  50S ribosomal protein L16  66.91 
 
 		 144 aa  189  9e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2326  50S ribosomal protein L16  65.96 
 
 		 144 aa  188  2e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000195214  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3898  50S ribosomal protein L16  65.67 
 
 		 139 aa  187  2.9999999999999997e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1738  50S ribosomal protein L16  69.12 
 
 		 147 aa  187  4e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000521329  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0222  50S ribosomal protein L16  66.9 
 
 		 144 aa  187  4e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000752115  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2639  50S ribosomal protein L16  66.42 
 
 		 138 aa  187  5e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0232  50S ribosomal protein L16  67.65 
 
 		 143 aa  187  5e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3710  50S ribosomal protein L16  66.42 
 
 		 139 aa  187  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1562  50S ribosomal protein L16  66.18 
 
 		 138 aa  186  7e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0293  50S ribosomal protein L16  68.79 
 
 		 143 aa  186  9e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00638417  normal  0.0397052 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2850  50S ribosomal protein L16  61.76 
 
 		 140 aa  186  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.867321  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23091  50S ribosomal protein L16  63.57 
 
 		 158 aa  185  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2566  50S ribosomal protein L16  63.97 
 
 		 141 aa  186  1e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23740  LSU ribosomal protein L16P  65.22 
 
 		 139 aa  185  2e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0335503  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2453  50S ribosomal protein L16  65.71 
 
 		 144 aa  185  2e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.219362 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1476  50S ribosomal protein L16  63.83 
 
 		 144 aa  184  2e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000158186  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0609  ribosomal protein L16  65.44 
 
 		 140 aa  184  3e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.817649 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0698  50S ribosomal protein L16  63.97 
 
 		 142 aa  184  4e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000251243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0298  50S ribosomal protein L16  66.19 
 
 		 145 aa  184  4e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.11723e-28 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2225  50S ribosomal protein L16  63.83 
 
 		 142 aa  183  7e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.877159  normal  0.84916 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20800  LSU ribosomal protein L16P  64.49 
 
 		 139 aa  183  9e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0569  50S ribosomal protein L16  65.67 
 
 		 139 aa  183  9e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0190  50S ribosomal protein L16  66.91 
 
 		 140 aa  182  1.0000000000000001e-45  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.307321 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17090  50S ribosomal protein L16  66.42 
 
 		 138 aa  182  1.0000000000000001e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00239118  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0687  50S ribosomal protein L16  61.31 
 
 		 140 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.129729  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0960  50S ribosomal protein L16  63.57 
 
 		 142 aa  182  1.0000000000000001e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000390826  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0849  ribosomal protein L16  64.71 
 
 		 144 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2612  50S ribosomal protein L16  63.04 
 
 		 141 aa  181  2.0000000000000003e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000705593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1900  50S ribosomal protein L16  66.42 
 
 		 137 aa  181  2.0000000000000003e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.12767  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2968  50S ribosomal protein L16  64.93 
 
 		 138 aa  181  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.306381  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16711  50S ribosomal protein L16  61.59 
 
 		 179 aa  182  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2680  50S ribosomal protein L16  65.67 
 
 		 138 aa  182  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1567  50S ribosomal protein L16  61.15 
 
 		 142 aa  181  3e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00199901  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1824  50S ribosomal protein L16  61.7 
 
 		 144 aa  181  3e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.418493  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0065  50S ribosomal protein L16  66.42 
 
 		 137 aa  181  3e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00303691  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3428  ribosomal protein L16  64.96 
 
 		 138 aa  181  3e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.773709  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5131  ribosomal protein L16  62.69 
 
 		 137 aa  181  4.0000000000000006e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.77654 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0313  50S ribosomal protein L16  65.67 
 
 		 139 aa  181  4.0000000000000006e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183052 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1387  50S ribosomal protein L16  64.29 
 
 		 142 aa  180  5.0000000000000004e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000734854  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1299  50S ribosomal protein L16  64.29 
 
 		 142 aa  180  5.0000000000000004e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000108479  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4500  ribosomal protein L16  63.43 
 
 		 138 aa  180  7e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1347  ribosomal protein L16  65.44 
 
 		 137 aa  180  8.000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1093  50S ribosomal protein L16  64.93 
 
 		 139 aa  179  9.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0519804 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3005  50S ribosomal protein L16  61.76 
 
 		 137 aa  179  9.000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.840277  hitchhiker  0.00634453 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0708  50S ribosomal protein L16  60.28 
 
 		 141 aa  179  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000940858  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2311  50S ribosomal protein L16  61.7 
 
 		 144 aa  179  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000620596  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2270  50S ribosomal protein L16  61.7 
 
 		 144 aa  179  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000763654  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1299  50S ribosomal protein L16  64.18 
 
 		 140 aa  179  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.210849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1939  50S ribosomal protein L16  65.67 
 
 		 138 aa  179  2e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1962  50S ribosomal protein L16  60 
 
 		 158 aa  178  2e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0940  50S ribosomal protein L16  58.82 
 
 		 140 aa  178  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00197835  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3321  50S ribosomal protein L16  58.82 
 
 		 140 aa  178  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000147904 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0602  50S ribosomal protein L16  63.57 
 
 		 143 aa  179  2e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000397194  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1353  50S ribosomal protein L16  57.97 
 
 		 140 aa  178  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.298146  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1122  50S ribosomal protein L16  60 
 
 		 161 aa  177  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19961  50S ribosomal protein L16  60 
 
 		 161 aa  177  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.64825  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2652  ribosomal protein L16  62.69 
 
 		 138 aa  178  2.9999999999999997e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1074  50S ribosomal protein L16  60.29 
 
 		 140 aa  178  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000319005  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1643  50S ribosomal protein L16  63.24 
 
 		 160 aa  177  4e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17331  50S ribosomal protein L16  64.71 
 
 		 160 aa  177  4e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.613797  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17581  50S ribosomal protein L16  61.81 
 
 		 160 aa  177  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>