More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0729 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0729  protein of unknown function DUF205  100 
 
 		 220 aa  433  1e-121  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.382163  normal  0.327374 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1338  protein of unknown function DUF205  45.09 
 
 		 222 aa  148  5e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.265905  normal  0.438388 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09710  conserved hypothetical integral membrane protein TIGR00023  40.99 
 
 		 214 aa  143  2e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.201169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2138  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  37.74 
 
 		 215 aa  137  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.684068  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0507  membrane protein  41.95 
 
 		 194 aa  134  9e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06900  conserved hypothetical integral membrane protein TIGR00023  45.96 
 
 		 219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.704538 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3922  membrane protein  40.8 
 
 		 195 aa  126  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0926824  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0574  membrane protein  39.2 
 
 		 193 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000985335  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0587  membrane protein  39.2 
 
 		 193 aa  124  8.000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00102729 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3020  membrane protein  41.54 
 
 		 194 aa  122  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000130394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15271  membrane protein  35.32 
 
 		 197 aa  122  4e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2109  protein of unknown function DUF205  36.84 
 
 		 200 aa  121  9e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.119956  normal  0.406872 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2417  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  39.27 
 
 		 207 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1161  hypothetical protein  38.73 
 
 		 200 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15131  membrane protein  36.5 
 
 		 197 aa  121  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2952  membrane protein  41.21 
 
 		 194 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.71102  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2823  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  39.27 
 
 		 207 aa  119  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.571241 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4343  membrane protein  38.14 
 
 		 203 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.213593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1425  membrane protein  34.16 
 
 		 197 aa  116  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.412084  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0526  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  37.38 
 
 		 210 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.888162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2062  hypothetical protein  37.68 
 
 		 202 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0651  membrane protein  37.31 
 
 		 196 aa  115  6e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.623909  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0917  protein of unknown function DUF205  36.68 
 
 		 191 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.245059  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0575  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.21 
 
 		 202 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.24732  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2642  membrane protein  36.18 
 
 		 198 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0924  membrane protein  34.42 
 
 		 205 aa  112  5e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2422  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.6 
 
 		 197 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.130898 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3529  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.25 
 
 		 203 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.536272  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0517  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  35.81 
 
 		 202 aa  111  7.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0870487  normal  0.527764 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0425  protein of unknown function DUF205  33.82 
 
 		 195 aa  111  9e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493377  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0172  membrane protein  36.53 
 
 		 200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2695  hypothetical protein  33.64 
 
 		 224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1025  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  36.06 
 
 		 207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.942008  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6513  protein of unknown function DUF205  37.26 
 
 		 217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00773794  normal  0.103654 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0027  membrane protein  36.1 
 
 		 195 aa  109  3e-23  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1594  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  35.12 
 
 		 212 aa  109  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.22068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2553  hypothetical protein  34.48 
 
 		 194 aa  109  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17541  membrane protein  34.85 
 
 		 198 aa  108  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0813  membrane protein  37.56 
 
 		 200 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.979835  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2243  protein of unknown function DUF205  37.38 
 
 		 211 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.341308  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2753  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  37.38 
 
 		 206 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.329703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1757  protein of unknown function DUF205  36.95 
 
 		 198 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1382  hypothetical protein  35.18 
 
 		 193 aa  108  5e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1323  hypothetical membrane spanning protein  35.18 
 
 		 193 aa  108  5e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.143303  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0898  membrane protein  35.86 
 
 		 198 aa  108  5e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4789  hypothetical protein  36.02 
 
 		 226 aa  108  6e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.120033  normal  0.994064 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2245  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  35.92 
 
 		 196 aa  108  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.507918  normal  0.25691 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3030  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  37.33 
 
 		 196 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.758539  normal  0.296162 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3095  protein of unknown function DUF205  36.97 
 
 		 203 aa  108  8.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0484205  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0829  protein of unknown function DUF205  36.97 
 
 		 220 aa  108  8.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0575  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  34.11 
 
 		 200 aa  108  8.000000000000001e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2546  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  36.63 
 
 		 207 aa  107  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1078  hypothetical protein  35.61 
 
 		 216 aa  107  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.243198  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1643  protein of unknown function DUF205  37.26 
 
 		 212 aa  107  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.292064 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0753  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  36.79 
 
 		 214 aa  106  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0221  hypothetical protein  32.54 
 
 		 210 aa  106  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5145  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  32.35 
 
 		 189 aa  106  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.479047 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1324  hypothetical protein  34.8 
 
 		 195 aa  106  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0740  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  36.92 
 
 		 212 aa  105  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2664  hypothetical protein  34.45 
 
 		 201 aa  105  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0188674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1004  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  34.45 
 
 		 201 aa  105  5e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0134889  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3662  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  36.55 
 
 		 203 aa  105  6e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.128753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1171  hypothetical protein  37.56 
 
 		 198 aa  105  6e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4637  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  33.17 
 
 		 192 aa  105  7e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.481632 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4194  membrane protein  35.15 
 
 		 201 aa  105  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1982  membrane protein  36.92 
 
 		 198 aa  103  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0841  hypothetical protein  33.65 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.058622  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5952  protein of unknown function DUF205  34.42 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1851  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  34.78 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1269  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  34.78 
 
 		 231 aa  102  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.747048  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1199  protein of unknown function DUF205  35.38 
 
 		 215 aa  102  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.724049 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2834  hypothetical protein  33.18 
 
 		 214 aa  103  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0247  protein of unknown function DUF205  36.87 
 
 		 222 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.491401 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4349  membrane protein  36.14 
 
 		 201 aa  102  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2009  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  37.56 
 
 		 196 aa  102  4e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.401567 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00854  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  34.72 
 
 		 203 aa  102  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14881  membrane protein  34.26 
 
 		 198 aa  102  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1629  protein of unknown function DUF205  36.63 
 
 		 203 aa  102  6e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.507494  hitchhiker  0.001161 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1297  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  36.59 
 
 		 206 aa  102  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.114938  hitchhiker  0.00391908 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0293  hypothetical protein  37.02 
 
 		 210 aa  102  7e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3209  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  35.78 
 
 		 214 aa  101  7e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.468969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1944  membrane protein  35.58 
 
 		 242 aa  101  7e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0320  protein of unknown function DUF205  36.71 
 
 		 208 aa  101  7e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.254648  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0391  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  34.03 
 
 		 189 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.566862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0781  membrane protein  36.28 
 
 		 209 aa  101  1e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000234105  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2475  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  36.45 
 
 		 212 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0301507 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2604  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  36.45 
 
 		 212 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.740836  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2329  hypothetical protein  35.96 
 
 		 197 aa  101  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0425  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  34.55 
 
 		 189 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.954266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0104  membrane protein  36.63 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1389  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  35.61 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.942836  normal  0.154079 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3073  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  38.92 
 
 		 202 aa  100  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.306378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2284  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  35.12 
 
 		 198 aa  99.8  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.278877  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0422  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  33.51 
 
 		 189 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.134868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3856  protein of unknown function DUF205  37.68 
 
 		 204 aa  99.8  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0565232 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0918  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  36.06 
 
 		 203 aa  99  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0530373  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0541  hypothetical protein  35.18 
 
 		 192 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1070  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  36.06 
 
 		 203 aa  99.4  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0914  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  36.06 
 
 		 203 aa  99.4  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2815  protein of unknown function DUF205  35.78 
 
 		 205 aa  99.4  4e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0354959 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>