39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0178 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0178  protein tyrosine/serine phosphatase  100 
 
 		 395 aa  820    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3082  protein tyrosine/serine phosphatase  25.4 
 
 		 295 aa  62.4  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3997  protein tyrosine/serine phosphatase  30.56 
 
 		 277 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0144957 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2362  protein tyrosine/serine phosphatase  44.68 
 
 		 244 aa  53.9  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.35654  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6870  protein tyrosine/serine phosphatase  31.37 
 
 		 265 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.226052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2202  protein tyrosine/serine phosphatase  41.94 
 
 		 243 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.534636  normal  0.21358 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5073  protein tyrosine/serine phosphatase  25.7 
 
 		 228 aa  51.2  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.293049  normal  0.751452 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1239  protein tyrosine/serine phosphatase  26.22 
 
 		 261 aa  51.2  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.030043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0646  protein tyrosine/serine phosphatase  29.69 
 
 		 316 aa  50.4  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.821476  normal  0.141742 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2291  protein tyrosine/serine phosphatase  27.27 
 
 		 247 aa  50.4  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2344  protein tyrosine/serine phosphatase  26.59 
 
 		 262 aa  49.7  0.00009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14410  protein tyrosine/serine phosphatase  40.98 
 
 		 253 aa  48.9  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0513449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2377  protein tyrosine/serine phosphatase  29.67 
 
 		 636 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00188756 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10864  conserved hypothetical protein  25.77 
 
 		 289 aa  48.5  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24750  protein tyrosine/serine phosphatase  40 
 
 		 315 aa  47.4  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0606708  normal  0.137069 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2401  protein tyrosine/serine phosphatase  38.6 
 
 		 262 aa  47.8  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000223295  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0660  protein tyrosine/serine phosphatase  23.74 
 
 		 253 aa  47  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.107087  hitchhiker  0.00669457 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1687  protein tyrosine/serine phosphatase  31.53 
 
 		 234 aa  47  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1050  protein tyrosine/serine phosphatase  32.61 
 
 		 262 aa  47  0.0006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000542198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2360  protein tyrosine/serine phosphatase  38.78 
 
 		 250 aa  47  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.388249 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1720  protein tyrosine/serine phosphatase  23.93 
 
 		 239 aa  46.6  0.0007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.088444  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10154  phosphotyrosine protein phosphatase ptpb  25.18 
 
 		 276 aa  46.6  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1241  hypothetical protein  28.06 
 
 		 252 aa  45.8  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.34714 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02130  protein tyrosine/serine phosphatase  28.78 
 
 		 256 aa  45.4  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.393393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3678  protein tyrosine/serine phosphatase  43.86 
 
 		 238 aa  45.4  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0733676  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0718  protein tyrosine/serine phosphatase  30.71 
 
 		 269 aa  44.3  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4203  protein tyrosine/serine phosphatase  27.04 
 
 		 257 aa  44.7  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.537851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3383  protein tyrosine/serine phosphatase  41.43 
 
 		 250 aa  44.3  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000524951  hitchhiker  0.000566628 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23060  protein tyrosine/serine phosphatase  26.23 
 
 		 354 aa  43.9  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.463058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4923  protein tyrosine/serine phosphatase  37.74 
 
 		 345 aa  43.9  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3550  protein tyrosine/serine phosphatase  29.91 
 
 		 243 aa  43.9  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0890003 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1877  protein tyrosine/serine phosphatase  42.22 
 
 		 637 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.880378 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4624  protein tyrosine/serine phosphatase  48.84 
 
 		 292 aa  43.9  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.81745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0543  protein tyrosine/serine phosphatase  47.37 
 
 		 306 aa  43.5  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4313  protein tyrosine/serine phosphatase  24.12 
 
 		 247 aa  43.5  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1747  protein tyrosine/serine phosphatase  26.45 
 
 		 267 aa  43.5  0.007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000126573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4857  protein tyrosine/serine phosphatase  40 
 
 		 266 aa  43.1  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.999319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1268  protein tyrosine/serine phosphatase  30.83 
 
 		 251 aa  43.1  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  normal  0.321151 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2034  protein tyrosine/serine phosphatase  26.04 
 
 		 182 aa  42.7  0.01  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000196792  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>