47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1927 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1927  hypothetical protein  100 
 
 		 265 aa  531  1e-150  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.595624  normal  0.0101264 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2747  cytochrome c assembly protein  32.02 
 
 		 782 aa  87.4  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.250515  normal  0.330673 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2194  cytochrome c assembly protein  32 
 
 		 749 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0128686  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0708  cytochrome c assembly protein  27.89 
 
 		 791 aa  72.4  0.000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1683  cytochrome c assembly protein  31.43 
 
 		 760 aa  72.4  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00910499  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1754  cytochrome c assembly protein  31.43 
 
 		 748 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.133127  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1712  hypothetical protein  36.79 
 
 		 386 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.230634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1852  hypothetical protein  35.58 
 
 		 392 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2587  hypothetical protein  38.3 
 
 		 387 aa  67  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2104  hypothetical protein  35.58 
 
 		 392 aa  66.6  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.131572  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1772  hypothetical protein  35.58 
 
 		 392 aa  66.6  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.151465  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2071  cytochrome c assembly protein  26.58 
 
 		 883 aa  62.8  0.000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.183227 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2822  hypothetical protein  35.79 
 
 		 393 aa  62.8  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.506353  hitchhiker  0.00907782 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3781  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  34.34 
 
 		 1054 aa  57  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000633001  normal  0.0119892 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0862  LigA  38.04 
 
 		 544 aa  52.4  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0866  LigA  38.04 
 
 		 542 aa  52.4  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0066  cytochrome c biogenesis protein  30.69 
 
 		 901 aa  51.2  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0814  LigA  36.96 
 
 		 557 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0197  outer membrane lipoprotein MapA  32.1 
 
 		 1027 aa  49.3  0.00006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1032  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  30.39 
 
 		 1081 aa  48.1  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0775  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  30.39 
 
 		 1081 aa  48.1  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.239289  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1461  cytochrome C assembly protein  31.46 
 
 		 1031 aa  48.5  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1157  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  30.39 
 
 		 1081 aa  48.1  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1335  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  29.13 
 
 		 1017 aa  47.8  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.927141  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0711  ResB family protein  34.07 
 
 		 717 aa  47  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.2296 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5588  ResB family protein  33.33 
 
 		 727 aa  47.4  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.946506 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0691  ResB family protein  34.07 
 
 		 717 aa  47  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.371554  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0023  cytochrome c assembly protein  30.39 
 
 		 1211 aa  46.2  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.182494  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0395  ResB family protein  23.12 
 
 		 511 aa  46.2  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2229  ResB-like cytochrome c biosythesis protein  29.31 
 
 		 457 aa  46.2  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2757  ResB family protein  26.92 
 
 		 455 aa  45.8  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00175337  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1116  cytochrome c biogenesis protein, CcmF/CycK/CcsA family  29.36 
 
 		 1076 aa  45.8  0.0007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0404  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  31.33 
 
 		 1024 aa  45.4  0.0009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0322  c-type cytochrome biogenesis protein  29.63 
 
 		 456 aa  45.4  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0696  ResB family protein  27.92 
 
 		 458 aa  45.4  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.129347  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1132  ResB family protein  35.16 
 
 		 722 aa  45.4  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0665  ResB family protein  31.51 
 
 		 742 aa  44.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.335724  hitchhiker  0.00675242 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0809  cytochrome c biogenesis protein  26.21 
 
 		 899 aa  44.3  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.747072  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09813  hypothetical protein  30.61 
 
 		 1054 aa  43.5  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0985  ResB family protein  36.92 
 
 		 732 aa  43.5  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2199  ResB-like  31.78 
 
 		 423 aa  43.1  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.426303 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2588  ResB family protein  30.71 
 
 		 454 aa  42.7  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000492342  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0480  cytochrome c assembly protein  28.28 
 
 		 1045 aa  42.7  0.006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.379709  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0699  cytochrome c assembly protein  32.63 
 
 		 898 aa  42.7  0.006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00244296  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3842  ResB family protein  33.72 
 
 		 453 aa  42  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000782388  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0552  ResB family protein  28.48 
 
 		 461 aa  42  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0535  ResB family protein  28.48 
 
 		 461 aa  42  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>