More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1325 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1325  recombination protein RecR  100 
 
 		 202 aa  412  1e-114  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.265741 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2128  recombination protein RecR  47.96 
 
 		 198 aa  177  7e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.505322  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3635  recombination protein RecR  47.42 
 
 		 198 aa  176  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0682949  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0029  DNA replication and repair protein RecR  46.19 
 
 		 199 aa  176  3e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.157728  hitchhiker  0.00000915246 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0033  recombination protein RecR  46.94 
 
 		 198 aa  173  9.999999999999999e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00162242  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0259  recombination protein RecR  46.6 
 
 		 200 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3693  recombination protein RecR  46.91 
 
 		 198 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3776  recombination protein RecR  46.91 
 
 		 198 aa  172  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0326868  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1365  recombination protein RecR  44.9 
 
 		 200 aa  171  5e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0514  recombination protein RecR  41.71 
 
 		 198 aa  171  6.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0501  recombination protein RecR  41.71 
 
 		 198 aa  171  6.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00457535  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0116  recombination protein RecR  41.71 
 
 		 198 aa  170  1e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0108  recombination protein RecR  45.69 
 
 		 199 aa  170  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0020  recombination protein RecR  41.84 
 
 		 198 aa  169  3e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153698  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0370  recombination protein RecR  42.5 
 
 		 199 aa  169  3e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000133419 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20770  recombination protein RecR  43.65 
 
 		 198 aa  168  6e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  2.21986e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1513  recombination protein RecR  46.73 
 
 		 222 aa  167  7e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0279848  normal  0.919824 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0044  recombination protein RecR  43.88 
 
 		 200 aa  167  8e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0424851  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0022  recombination protein RecR  41.33 
 
 		 198 aa  166  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5292  recombination protein RecR  41.33 
 
 		 198 aa  166  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000931615  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0021  recombination protein RecR  41.33 
 
 		 198 aa  166  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0021  recombination protein RecR  41.33 
 
 		 198 aa  166  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00242068  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0021  recombination protein RecR  41.71 
 
 		 198 aa  166  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000073919  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0026  recombination protein RecR  41.33 
 
 		 198 aa  166  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0025  recombination protein RecR  41.33 
 
 		 198 aa  166  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0028  recombination protein RecR  41.33 
 
 		 198 aa  166  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212912  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0017  DNA replication and repair protein RecR  40.91 
 
 		 199 aa  165  2.9999999999999998e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0297  recombination protein RecR  44.5 
 
 		 199 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0020  recombination protein RecR  40.7 
 
 		 198 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00591739  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0035  recombination protein RecR  40.61 
 
 		 199 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000323966  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0023  recombination protein RecR  41.33 
 
 		 198 aa  165  4e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0021  recombination protein RecR  41.33 
 
 		 198 aa  165  4e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0277  recombination protein RecR  40.2 
 
 		 213 aa  165  4e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0018  recombination protein RecR  42.21 
 
 		 198 aa  164  5.9999999999999996e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2791  recombination protein RecR  44.85 
 
 		 201 aa  164  5.9999999999999996e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0094882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9027  recombination protein RecR  43.15 
 
 		 199 aa  164  6.9999999999999995e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1144  recombination protein RecR  43.52 
 
 		 201 aa  164  8e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0987935  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4871  recombination protein RecR  42.64 
 
 		 199 aa  163  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0044  recombination protein RecR  43.65 
 
 		 199 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.118922  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0376  recombination protein RecR  45.26 
 
 		 199 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000959909  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1153  recombination protein RecR  46.94 
 
 		 195 aa  164  1.0000000000000001e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.332903 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0510  DNA replication and repair protein RecR  47.21 
 
 		 199 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.186911  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4814  recombination protein RecR  42.64 
 
 		 199 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0792  recombination protein RecR  39.69 
 
 		 201 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9313  recombination protein RecR  43.65 
 
 		 199 aa  162  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.430471  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0766  recombination protein RecR  38.58 
 
 		 198 aa  162  4.0000000000000004e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.290455  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3530  recombination protein RecR  43.68 
 
 		 199 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.188089  normal  0.594809 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0663  recombination protein RecR  39.59 
 
 		 198 aa  162  4.0000000000000004e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0143934  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0319  recombination protein RecR  43.16 
 
 		 199 aa  161  5.0000000000000005e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.697787  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2142  recombination protein RecR  39.59 
 
 		 199 aa  161  6e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000288624  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0054  recombination protein RecR  41.54 
 
 		 198 aa  161  6e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0057  recombination protein RecR  41.54 
 
 		 198 aa  161  6e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01600  DNA replication and repair protein RecR  42.05 
 
 		 198 aa  160  1e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000053602 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1288  recombination protein RecR  42.86 
 
 		 200 aa  160  1e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02350  DNA replication and repair protein RecR  42.49 
 
 		 198 aa  160  1e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000224797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04720  DNA replication and repair protein RecR  43.81 
 
 		 199 aa  160  1e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.41163  normal  0.431257 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0465  recombination protein RecR  42.13 
 
 		 199 aa  159  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.286719  normal  0.22081 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0094  recombination protein RecR  39.2 
 
 		 199 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.427132  hitchhiker  0.00000395528 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02640  DNA replication and repair protein RecR  43.81 
 
 		 199 aa  159  2e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.437188  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0554  recombination protein RecR  42.78 
 
 		 199 aa  159  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.407032  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0415  recombination protein RecR  42.78 
 
 		 199 aa  159  3e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.594093  normal  0.973959 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1108  recombination protein RecR  40.7 
 
 		 199 aa  159  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.425444  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0328  recombination protein RecR  39.5 
 
 		 200 aa  159  3e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0210  recombination protein RecR  44.22 
 
 		 197 aa  159  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00238733  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6148  recombination protein RecR  44.68 
 
 		 199 aa  159  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.625631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3201  recombination protein RecR  45.88 
 
 		 205 aa  159  4e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000136854  normal  0.489368 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1973  recombination protein RecR  41.24 
 
 		 199 aa  158  4e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3760  recombination protein RecR  45.36 
 
 		 198 aa  158  4e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12031  recombination protein RecR  40.7 
 
 		 199 aa  158  5e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0693  recombination protein RecR  42.78 
 
 		 199 aa  158  5e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0605  recombination protein RecR  40.93 
 
 		 198 aa  158  5e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.813504 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0052  recombination protein RecR  41.58 
 
 		 198 aa  158  5e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000011836  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0127  recombination protein RecR  41.41 
 
 		 202 aa  158  6e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1728  recombination protein RecR  42.33 
 
 		 195 aa  158  6e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000187366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2610  recombination protein RecR  43.06 
 
 		 215 aa  157  7e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12041  recombination protein RecR  40.7 
 
 		 199 aa  157  7e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0549  recombination protein RecR  42.13 
 
 		 199 aa  157  7e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.650198 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0272  recombination protein RecR  43.3 
 
 		 202 aa  157  8e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25940  DNA replication and repair protein RecR  42.78 
 
 		 204 aa  157  9e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0414  recombination protein RecR  40.74 
 
 		 195 aa  157  1e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3680  recombination protein RecR  44.21 
 
 		 189 aa  157  1e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0244  recombination protein RecR  39.09 
 
 		 199 aa  157  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000716421  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0593  recombination protein RecR  43.81 
 
 		 199 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1180  recombination protein RecR  43.65 
 
 		 197 aa  156  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0794  recombination protein RecR  41.36 
 
 		 197 aa  156  2e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0617027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1207  recombination protein RecR  43.65 
 
 		 197 aa  156  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.262054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0117  recombination protein RecR  43.32 
 
 		 203 aa  156  2e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000471102  normal  0.0497522 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0800  recombination protein RecR  41.88 
 
 		 197 aa  156  2e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.924037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0386  recombination protein RecR  38.66 
 
 		 198 aa  156  2e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.147094  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1409  recombination protein RecR  38.81 
 
 		 201 aa  156  2e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.468928  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3124  recombination protein RecR  43.65 
 
 		 199 aa  155  3e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0192329  hitchhiker  0.0000115295 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0193  recombination protein RecR  43.72 
 
 		 197 aa  156  3e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.54722e-32 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3924  recombination protein RecR  39.9 
 
 		 204 aa  155  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00096202  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2015  recombination protein RecR  41.45 
 
 		 199 aa  155  4e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2291  recombination protein RecR  41.45 
 
 		 205 aa  154  7e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.967474  normal  0.0406195 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11881  recombination protein RecR  40.1 
 
 		 199 aa  154  9e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1378  recombination protein RecR  43.84 
 
 		 205 aa  154  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.324017  normal  0.0221027 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5291  recombination protein RecR  43.2 
 
 		 212 aa  153  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1533  recombination protein RecR  42.49 
 
 		 205 aa  153  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6868  recombination protein RecR  40.2 
 
 		 201 aa  152  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.296067 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>