More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6593 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_6593  adenylate kinase  100 
 
 
183 aa  362  1e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04190  Adenylate kinase  71.35 
 
 
184 aa  262  3e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3685  adenylate kinase  63.69 
 
 
184 aa  234  5.0000000000000005e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00243015  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3396  adenylate kinase  61.45 
 
 
181 aa  223  9e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5021  adenylate kinase  60.34 
 
 
187 aa  218  3e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.416871 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10747  adenylate kinase  59.22 
 
 
181 aa  217  6e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.188337 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1348  adenylate kinase  60.34 
 
 
181 aa  212  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1047  adenylate kinase  57.54 
 
 
181 aa  212  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.275542  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1075  adenylate kinase  57.54 
 
 
181 aa  212  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1063  adenylate kinase  57.54 
 
 
181 aa  212  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.67008  normal  0.276891 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2625  adenylate kinase  56.45 
 
 
189 aa  208  3e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.155499  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3884  adenylate kinase  54.59 
 
 
191 aa  206  2e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4300  adenylate kinase  52.58 
 
 
217 aa  205  3e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5145  adenylate kinase  50.47 
 
 
219 aa  197  5e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.498584 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0709  adenylate kinase  57.07 
 
 
191 aa  197  9e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.233202 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1148  adenylate kinase  54.19 
 
 
181 aa  196  1.0000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2632  adenylate kinase  53.19 
 
 
192 aa  193  1e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1107  adenylate kinase  49.53 
 
 
216 aa  192  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.211555 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0583  adenylate kinase  49.3 
 
 
217 aa  191  4e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4486  adenylate kinase  52.63 
 
 
204 aa  191  5e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2578  adenylate kinase  58.44 
 
 
184 aa  190  9e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0603  adenylate kinase  48.36 
 
 
217 aa  189  2e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1207  adenylate kinase  50 
 
 
217 aa  187  5e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00730136 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6028  adenylate kinase  47.42 
 
 
217 aa  187  7e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.16698 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0952  adenylate kinase  47.27 
 
 
225 aa  187  7e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.519364  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2955  adenylate kinase  48.65 
 
 
192 aa  187  9e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.913577  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0327  adenylate kinase  48.83 
 
 
217 aa  186  2e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000417947 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3902  adenylate kinase  49.77 
 
 
217 aa  184  5e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0631  adenylate kinase  48.92 
 
 
197 aa  184  6e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2667  adenylate kinase  47.57 
 
 
192 aa  184  8e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4294  adenylate kinase  49.3 
 
 
217 aa  184  8e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487166 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2213  adenylate kinase  47.51 
 
 
186 aa  182  2.0000000000000003e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1992  adenylate kinase  47.83 
 
 
197 aa  179  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.499697  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29530  Adenylate kinase  53.23 
 
 
194 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.754676  normal  0.534773 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0710  adenylate kinase  53.55 
 
 
184 aa  178  4e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000807977  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20660  Adenylate kinase  49.16 
 
 
193 aa  176  1e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.598531  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16960  Adenylate kinase  48.37 
 
 
205 aa  175  3e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.466629  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3302  adenylate kinase  46.52 
 
 
187 aa  174  6e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23590  Adenylate kinase  49.19 
 
 
201 aa  173  9.999999999999999e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1311  adenylate kinase  48.69 
 
 
195 aa  173  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.165933  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3122  adenylate kinase  50.54 
 
 
192 aa  171  6.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3722  adenylate kinase  51.63 
 
 
187 aa  171  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0240  adenylate kinase  45.41 
 
 
187 aa  171  7.999999999999999e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0210  adenylate kinase  45.41 
 
 
187 aa  170  9e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.389912  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16591  adenylate kinase  48.33 
 
 
186 aa  169  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.761674  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1929  adenylate kinase  44.56 
 
 
199 aa  169  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.312303  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2693  adenylate kinase  38.89 
 
 
216 aa  168  4e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2378  adenylate kinase  38.89 
 
 
216 aa  168  4e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2993  adenylate kinase  47.5 
 
 
191 aa  168  5e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0332  adenylate kinase  46.11 
 
 
199 aa  167  7e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.671813  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2439  adenylate kinase  46.77 
 
 
217 aa  167  7e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0272  adenylate kinase  47.57 
 
 
186 aa  167  7e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0648  adenylate kinase  45.99 
 
 
211 aa  166  1e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0974  adenylate kinase  40.85 
 
 
214 aa  166  2e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1977  adenylate kinase  44.5 
 
 
194 aa  166  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.100944  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5049  adenylate kinase  44.85 
 
 
309 aa  166  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449278  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0887  adenylate kinase  41.98 
 
 
217 aa  166  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.037956  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1728  adenylate kinase  46.49 
 
 
186 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0507539  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0608  adenylate kinase  50.26 
 
 
195 aa  164  5.9999999999999996e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.207021  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0086  adenylate kinase  39.15 
 
 
215 aa  164  9e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00306231  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1212  adenylate kinase  43.98 
 
 
194 aa  163  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1175  adenylate kinase  43.98 
 
 
194 aa  163  1.0000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0770986  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1111  adenylate kinase  40.18 
 
 
216 aa  162  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1117  adenylate kinase  40.19 
 
 
218 aa  162  3e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.018146  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2197  adenylate kinase  42.93 
 
 
200 aa  162  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.56266  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4111  adenylate kinase  40.18 
 
 
216 aa  162  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0722  adenylate kinase  41.04 
 
 
216 aa  161  4.0000000000000004e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.940289  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1087  adenylate kinase  40.19 
 
 
217 aa  161  4.0000000000000004e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.171059  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0132  adenylate kinase  45.21 
 
 
216 aa  161  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00113447  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1506  adenylate kinase  39.73 
 
 
216 aa  160  6e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.614097  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4216  adenylate kinase  39.73 
 
 
216 aa  160  6e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.584278 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2039  Adenylate kinase  46.24 
 
 
214 aa  160  7e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0443  adenylate kinase  45.7 
 
 
217 aa  160  8.000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3307  adenylate kinase  40.85 
 
 
214 aa  160  9e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2836  adenylate kinase  40.58 
 
 
217 aa  160  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02588  adenylate kinase  45.56 
 
 
182 aa  160  1e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0647  adenylate kinase  41.75 
 
 
222 aa  160  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00892777  hitchhiker  0.00000105788 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05570  adenylate kinase  45.41 
 
 
367 aa  160  1e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1954  Adenylate kinase  46.24 
 
 
214 aa  160  1e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1007  adenylate kinase  43.48 
 
 
192 aa  159  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.556108  normal  0.030357 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0615  adenylate kinase  47.09 
 
 
188 aa  159  2e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000660087  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0216  adenylate kinase  47.27 
 
 
187 aa  159  2e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0954  adenylate kinase  40.38 
 
 
214 aa  159  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.338741  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0521  adenylate kinase  40.34 
 
 
185 aa  159  3e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1932  adenylate kinase  41.59 
 
 
214 aa  157  6e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.791689 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0779  adenylate kinase  38.68 
 
 
214 aa  157  6e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000192318  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1725  adenylate kinase  38.21 
 
 
215 aa  157  6e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000477664  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2308  adenylate kinase  40 
 
 
218 aa  157  7e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00367216  normal  0.15407 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1551  adenylate kinase  40 
 
 
218 aa  157  7e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.399055  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1462  adenylate kinase  39.61 
 
 
219 aa  157  8e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000718997  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2952  adenylate kinase  40 
 
 
218 aa  157  9e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1338  adenylate kinase  38.97 
 
 
213 aa  156  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.389991  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3427  adenylate kinase  46.15 
 
 
335 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.139479 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1657  adenylate kinase  41.94 
 
 
194 aa  156  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.201865  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2713  Adenylate kinase  43.14 
 
 
423 aa  157  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.690631  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2066  adenylate kinase  40.55 
 
 
214 aa  156  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1925  adenylate kinase  45.16 
 
 
214 aa  156  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2316  adenylate kinase  43.48 
 
 
341 aa  156  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.210297  normal  0.170199 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1237  adenylate kinase  39.44 
 
 
214 aa  155  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000920741  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3646  adenylate kinase  43.08 
 
 
367 aa  156  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251255  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>