68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6286 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6286  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  100 
 
 		 250 aa  497  1e-140  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.343257  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0156  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  45.2 
 
 		 227 aa  163  3e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.839813  hitchhiker  0.000129213 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0149  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.8 
 
 		 227 aa  153  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5875  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.44 
 
 		 264 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00114618  normal  0.882563 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0723  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.19 
 
 		 254 aa  96.3  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.75056  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0425  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.18 
 
 		 257 aa  95.1  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2873  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.09 
 
 		 300 aa  89  7e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0332194  normal  0.172876 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3480  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.75 
 
 		 250 aa  83.6  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0516  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.81 
 
 		 474 aa  83.2  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3037  peptidase M7 snapalysin  29.65 
 
 		 392 aa  81.3  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.872515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5855  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.91 
 
 		 261 aa  78.6  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0679921  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8717  hypothetical protein  28.86 
 
 		 278 aa  78.6  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4945  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.85 
 
 		 514 aa  78.2  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5959  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.67 
 
 		 271 aa  74.7  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.252451  normal  0.94497 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3211  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.69 
 
 		 260 aa  73.2  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  hitchhiker  0.0000000383198 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4967  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.71 
 
 		 303 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000147965 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5247  hypothetical protein  30.48 
 
 		 273 aa  66.6  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.523133 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0055  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.65 
 
 		 416 aa  65.1  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.16054 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1101  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.42 
 
 		 519 aa  63.9  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5502  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.63 
 
 		 275 aa  63.5  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000292489  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6053  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.97 
 
 		 843 aa  63.2  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3741  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.24 
 
 		 257 aa  62.4  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7211  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.19 
 
 		 841 aa  62.4  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0794016 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0600  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.51 
 
 		 277 aa  58.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1426  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.21 
 
 		 282 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.258182 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1430  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.71 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.973827  normal  0.236711 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1704  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.71 
 
 		 282 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.204445  normal  0.237842 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5497  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.03 
 
 		 272 aa  54.7  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000000909989  normal  0.722104 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01372  hypothetical protein  26.91 
 
 		 268 aa  53.9  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49772  predicted protein  27.24 
 
 		 582 aa  53.9  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0432  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.48 
 
 		 248 aa  54.3  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.903752 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5498  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.98 
 
 		 275 aa  53.9  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000964373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2924  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.07 
 
 		 432 aa  52.4  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0719819  normal  0.462707 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_40462  predicted protein  30 
 
 		 508 aa  52.4  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.1729  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5869  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.39 
 
 		 247 aa  52  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_9911  peptidase S1 (chymotrypsin) family protein  28.02 
 
 		 262 aa  51.6  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37254  predicted protein  24.68 
 
 		 399 aa  51.2  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3593  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.18 
 
 		 650 aa  52  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001191  secreted trypsin-like serine protease  27.18 
 
 		 379 aa  50.8  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0521  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.83 
 
 		 542 aa  51.2  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5866  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.72 
 
 		 249 aa  50.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4175  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.48 
 
 		 290 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4440  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.94 
 
 		 290 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0403087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2925  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.78 
 
 		 440 aa  49.3  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.109953  normal  0.424332 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3349  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.23 
 
 		 732 aa  48.5  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.185499  hitchhiker  0.0040915 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3157  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.67 
 
 		 249 aa  48.1  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0408273  hitchhiker  0.0067091 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02366  serine protease similarity, trypsin family (Eurofung)  26.05 
 
 		 249 aa  48.1  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.454558 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4968  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.93 
 
 		 257 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113067 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004097  secreted trypsin-like serine protease  27.39 
 
 		 538 aa  47.8  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000141932  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1835  serine protease  24.06 
 
 		 660 aa  46.2  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2859  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  26.48 
 
 		 279 aa  46.2  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5818  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.14 
 
 		 259 aa  46.2  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1429  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.92 
 
 		 251 aa  45.8  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160131  normal  0.321686 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2926  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.58 
 
 		 427 aa  45.4  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.190852  normal  0.455404 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1703  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.92 
 
 		 251 aa  45.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.333064  normal  0.213318 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04979  elastase  27.45 
 
 		 333 aa  45.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3469  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.25 
 
 		 255 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.140296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0079  2-alkenal reductase  28.65 
 
 		 474 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0556  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.47 
 
 		 494 aa  44.3  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0947915  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0091  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.65 
 
 		 474 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000577253  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5018  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.7 
 
 		 270 aa  43.9  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0219219  normal  0.251525 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1258  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.85 
 
 		 359 aa  43.9  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0475  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  40.26 
 
 		 374 aa  43.5  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.17019  normal  0.149604 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003394  putative trypsin  29.55 
 
 		 443 aa  42.7  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0073  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.65 
 
 		 474 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0820  putative trypsin  24.69 
 
 		 403 aa  42.4  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000898339  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1830  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.46 
 
 		 465 aa  42.4  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.135779 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2723  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  25.69 
 
 		 552 aa  42  0.01  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.547831  normal  0.0221435 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>