53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4122 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4122  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  100 
 
 		 608 aa  1175    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3524  hypothetical protein  53.23 
 
 		 633 aa  583  1.0000000000000001e-165  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.284733  normal  0.8933 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0763  beta-lactamase domain-containing protein  27.91 
 
 		 455 aa  114  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16190  hypothetical protein  31.89 
 
 		 470 aa  112  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326397  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1779  hypothetical protein  33.19 
 
 		 474 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1184  hypothetical protein  30.48 
 
 		 465 aa  111  5e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2664  hypothetical protein  30.4 
 
 		 466 aa  103  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3175  hypothetical protein  30.4 
 
 		 466 aa  103  9e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.333375  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2576  hypothetical protein  30.4 
 
 		 466 aa  103  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1413  hypothetical protein  30.4 
 
 		 466 aa  103  9e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.451407  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1636  hypothetical protein  30.4 
 
 		 466 aa  103  9e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.117479  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2523  hypothetical protein  30.19 
 
 		 466 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1955  hypothetical protein  29.79 
 
 		 470 aa  97.8  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2138  hypothetical protein  33.96 
 
 		 1751 aa  97.1  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4721  FAD dependent oxidoreductase  25.94 
 
 		 523 aa  89.4  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.450266  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0499  hypothetical protein  34.02 
 
 		 442 aa  88.6  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0065  hypothetical protein  30.15 
 
 		 473 aa  87  8e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.701081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2427  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.86 
 
 		 455 aa  75.5  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.232176  normal  0.116693 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3249  hypothetical protein  26.72 
 
 		 467 aa  74.3  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3286  hypothetical protein  33.88 
 
 		 466 aa  73.9  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.694377  normal  0.162486 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3720  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  35.51 
 
 		 460 aa  73.6  0.000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.481201  normal  0.0318368 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3411  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  35.51 
 
 		 460 aa  73.6  0.000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.574536 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3948  hypothetical protein  29.13 
 
 		 473 aa  73.6  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2156  FAD dependent oxidoreductase  24.22 
 
 		 480 aa  72  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3307  hypothetical protein  27.62 
 
 		 471 aa  71.6  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0771  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.31 
 
 		 481 aa  70.1  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.13756 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3530  hypothetical protein  31.95 
 
 		 445 aa  68.9  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3604  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family  33.47 
 
 		 460 aa  68.6  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0606198  normal  0.410787 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3458  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.59 
 
 		 453 aa  67  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.436975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03231  hypothetical protein  29.48 
 
 		 464 aa  67  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1700  StAR  27.82 
 
 		 479 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.91604  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3468  hypothetical protein  25.46 
 
 		 467 aa  63.9  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.343102  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3277  hydroxyacylglutathione hydrolase  24.74 
 
 		 443 aa  62.4  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0759  hypothetical protein  29.8 
 
 		 455 aa  62.4  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.786998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6633  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  31.58 
 
 		 468 aa  62.8  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0685536 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5579  hypothetical protein  28.86 
 
 		 456 aa  62.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2506  hypothetical protein  33.07 
 
 		 462 aa  62.8  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4518  FAD dependent oxidoreductase  29.55 
 
 		 485 aa  62.4  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.42013 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3118  hypothetical protein  31.01 
 
 		 469 aa  61.6  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0412381  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3848  hypothetical protein  31.01 
 
 		 469 aa  60.8  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2371  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.36 
 
 		 475 aa  60.8  0.00000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.447406  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5118  hypothetical protein  28.79 
 
 		 444 aa  58.9  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.917814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4618  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.8 
 
 		 883 aa  57.4  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03362  putative secreted protein  30.04 
 
 		 471 aa  57.8  0.0000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0229987  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1051  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family  29.02 
 
 		 474 aa  56.6  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.169159 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6552  hypothetical protein  26.25 
 
 		 453 aa  57  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0462223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1687  FAD dependent oxidoreductase  32.42 
 
 		 445 aa  55.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434523  normal  0.201156 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6060  hypothetical protein  25.36 
 
 		 454 aa  53.1  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2050  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  29.13 
 
 		 482 aa  52  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.765527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5543  hypothetical protein  28.17 
 
 		 490 aa  50.4  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1458  putative lipoprotein  25.28 
 
 		 624 aa  47.8  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.342191  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5466  hypothetical protein  27.45 
 
 		 499 aa  46.6  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1846  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0093  putative oxidoreductase  29.65 
 
 		 498 aa  44.3  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.256628 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>