225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3716 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



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Alignment on homolog gene
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E-value
Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2381  lysine 2,3-aminomutase  75.48 
 
 		 467 aa  723    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.119662  hitchhiker  0.000263761 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2339  Lysine 2,3-aminomutase  68.81 
 
 		 456 aa  657    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000106877  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3953  Lysine 2,3-aminomutase  72.87 
 
 		 475 aa  685    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2661  L-lysine 2,3-aminomutase  69.8 
 
 		 468 aa  659    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0706515  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2262  radical SAM domain-containing protein  76.29 
 
 		 491 aa  717    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000903747  normal  0.0317169 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3716  Lysine 2,3-aminomutase  100 
 
 		 459 aa  941    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.769472  n/a   
 
 
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NC_013159  Svir_21810  L-lysine 2,3-aminomutase  81.3 
 
 		 459 aa  785    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.359691  normal  0.123054 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0181  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  33.1 
 
 		 473 aa  215  1.9999999999999998e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1080  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.82 
 
 		 436 aa  166  8e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1070  L-lysine 2,3-aminomutase  31.28 
 
 		 416 aa  161  2e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.628059 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0207  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.14 
 
 		 422 aa  159  1e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1886  L-lysine 2,3-aminomutase  28.35 
 
 		 420 aa  154  4e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185712 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0988  hypothetical protein  30.75 
 
 		 483 aa  151  3e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.709939  normal  0.113697 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0192  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.88 
 
 		 423 aa  150  5e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.863108  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0711  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.09 
 
 		 460 aa  144  3e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.62516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0171  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  32.45 
 
 		 420 aa  143  8e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2334  L-lysine 2,3-aminomutase  28.68 
 
 		 473 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2145  L-lysine 2,3-aminomutase  28.68 
 
 		 473 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2083  lysine 2,3-aminomutase  28.68 
 
 		 473 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2079  lysine 2,3-aminomutase  28.68 
 
 		 473 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.492987  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2300  L-lysine 2,3-aminomutase  28.68 
 
 		 473 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2325  L-lysine 2,3-aminomutase  28.68 
 
 		 473 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2408  L-lysine 2,3-aminomutase  28.68 
 
 		 473 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.481514  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2281  L-lysine 2,3-aminomutase  28.68 
 
 		 473 aa  141  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1688  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.65 
 
 		 472 aa  141  3e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.157129  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2886  L-lysine 2,3-aminomutase  29.33 
 
 		 416 aa  141  3e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1079  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.44 
 
 		 440 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3042  L-lysine 2,3-aminomutase  28.68 
 
 		 473 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.137592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2118  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.42 
 
 		 472 aa  140  6e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.284772  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3041  L-lysine 2,3-aminomutase  29.72 
 
 		 527 aa  139  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0740  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  34.9 
 
 		 406 aa  139  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0211  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30.14 
 
 		 437 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0802  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.67 
 
 		 437 aa  135  1.9999999999999998e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0696  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.46 
 
 		 440 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000415374  normal  0.0401463 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1643  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.95 
 
 		 393 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0240  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.7 
 
 		 437 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0628  radical SAM domain-containing protein  27.53 
 
 		 439 aa  134  3e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00861881  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1315  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30.39 
 
 		 413 aa  134  5e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.603808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0601  L-lysine 2,3-aminomutase  27.25 
 
 		 439 aa  133  6.999999999999999e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3223  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30.67 
 
 		 356 aa  133  9e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_569  lysine 2,3-aminomutase  26.52 
 
 		 439 aa  131  3e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013552  DhcVS_197  L-lysine 2,3-aminomutase/beta-lysine acetyltransferase, GNAT family  27.32 
 
 		 730 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1576  hypothetical protein  28.26 
 
 		 438 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0162039 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0670  L-lysine 2,3-aminomutase  26.29 
 
 		 414 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.420719 
 
 
-
 
NC_002936  DET0221  GNAT family L-lysine 2,3-aminomutase/acetyltransferase  27.12 
 
 		 708 aa  129  8.000000000000001e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.893806  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1401  hypothetical protein  26.85 
 
 		 457 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.536513  n/a   
 
 
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NC_011126  HY04AAS1_0099  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.58 
 
 		 365 aa  129  1.0000000000000001e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.521426  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1223  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.7 
 
 		 433 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010730  SYO3AOP1_0796  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  23.14 
 
 		 374 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2548  L-lysine 2,3-aminomutase  30.21 
 
 		 375 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0600  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  32.57 
 
 		 427 aa  128  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0133  L-lysine 2,3-aminomutase  26.94 
 
 		 730 aa  125  2e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0345  L-lysine 2,3-aminomutase  26.46 
 
 		 453 aa  124  4e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000388257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0666  L-lysine 2,3-aminomutase  26.13 
 
 		 433 aa  124  4e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0598217  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0274  L-lysine 2,3-aminomutase  25.56 
 
 		 435 aa  124  5e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1795  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.85 
 
 		 433 aa  123  8e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1916  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.07 
 
 		 403 aa  122  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1402  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.69 
 
 		 415 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.522319  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1301  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.69 
 
 		 415 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.156548  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0106  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  25.87 
 
 		 433 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.928991  normal  0.154212 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1649  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.36 
 
 		 437 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1893  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.72 
 
 		 454 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.836798  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0136  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30.14 
 
 		 396 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192198  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3939  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.12 
 
 		 419 aa  120  6e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0153502  normal  0.0100362 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1776  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30.11 
 
 		 411 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0350095  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2398  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.07 
 
 		 344 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.723604  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0189  L-lysine 2,3-aminomutase  27.06 
 
 		 454 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0215  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.22 
 
 		 437 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2520  hypothetical protein  31.63 
 
 		 347 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.707016  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1765  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.56 
 
 		 346 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.930699  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0947  L-lysine 2,3-aminomutase  30.27 
 
 		 305 aa  115  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00167419  hitchhiker  0.00202939 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1821  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30.32 
 
 		 344 aa  114  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00597572 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1840  L-lysine 2,3-aminomutase  28.81 
 
 		 344 aa  114  5e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000138489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0035  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  32.91 
 
 		 520 aa  114  5e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1679  L-lysine 2,3-aminomutase  30.77 
 
 		 335 aa  112  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1818  lysine 2,3-aminomutase  27.32 
 
 		 397 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0095  lysine 2,3-aminomutase  28.27 
 
 		 342 aa  112  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.069905  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1754  L-lysine 2,3-aminomutase  29.81 
 
 		 353 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.117521  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2067  KamA family protein  27.92 
 
 		 342 aa  110  5e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3908  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30.59 
 
 		 362 aa  109  9.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.935392 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0453  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.93 
 
 		 363 aa  109  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.284633 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3283  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.03 
 
 		 337 aa  109  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.770595 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1316  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.1 
 
 		 385 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6024  L-lysine 2,3-aminomutase  28.86 
 
 		 349 aa  106  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3476  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.33 
 
 		 350 aa  105  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1886  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  31.71 
 
 		 356 aa  104  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0898  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.29 
 
 		 340 aa  104  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12260  KamA family protein  28.05 
 
 		 407 aa  104  4e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4126  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  27.65 
 
 		 350 aa  104  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.100876  normal  0.401423 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1949  hypothetical protein  31.94 
 
 		 335 aa  103  5e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.667816  normal  1 
 
 
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NC_010505  Mrad2831_2740  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30.14 
 
 		 347 aa  103  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.525407 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2103  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.08 
 
 		 341 aa  103  5e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009524  PsycPRwf_0487  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.79 
 
 		 372 aa  103  9e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000738292  normal  1 
 
 
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NC_013093  Amir_4485  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.87 
 
 		 381 aa  102  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009483  Gura_2149  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  28.66 
 
 		 347 aa  102  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000218503  n/a   
 
 
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NC_010511  M446_0377  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  30.31 
 
 		 356 aa  101  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.284595 
 
 
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NC_010338  Caul_0763  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.33 
 
 		 347 aa  101  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.475279  normal  0.239148 
 
 
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NC_011145  AnaeK_1302  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  26.82 
 
 		 402 aa  101  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.188876  n/a   
 
 
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NC_007964  Nham_2300  hypothetical protein  27.82 
 
 		 366 aa  100  7e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.286942  n/a   
 
 
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NC_009050  Rsph17029_3965  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  29.5 
 
 		 345 aa  100  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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