154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1135 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1135  globin  100 
 
 		 127 aa  263  7e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11810  truncated hemoglobin  76.23 
 
 		 132 aa  199  1.9999999999999998e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.254894 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5317  globin  70.49 
 
 		 139 aa  178  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0702045  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1333  globin  68.8 
 
 		 127 aa  176  7e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.143229  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1823  globin  66.13 
 
 		 145 aa  173  6e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000381812  normal  0.0630387 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3425  globin  69.17 
 
 		 173 aa  171  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.646541 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1376  globin  65.83 
 
 		 124 aa  169  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.510666  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4636  globin  66.94 
 
 		 150 aa  167  5e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0856308  normal  0.0106718 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2031  globin  65.85 
 
 		 153 aa  167  5e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.250624  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1149  globin  65 
 
 		 140 aa  166  8e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.572775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2215  hypothetical protein  68.33 
 
 		 188 aa  166  9e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.307711  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7353  globin  65.57 
 
 		 129 aa  165  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23037 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4066  globin  61.42 
 
 		 136 aa  165  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.667271 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24650  truncated hemoglobin  60 
 
 		 133 aa  165  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0487801  normal  0.249418 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12495  hemoglobin-like oxygen-binding protein glbO  64 
 
 		 128 aa  164  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.134199 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1391  globin  61.07 
 
 		 135 aa  163  8e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.376518  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3913  globin  66.67 
 
 		 142 aa  163  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.237071 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2572  globin  62.2 
 
 		 136 aa  162  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.221799  normal  0.878587 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1359  globin  61.48 
 
 		 127 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.267788  decreased coverage  0.00000213655 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3610  globin  62.02 
 
 		 131 aa  160  7e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.459104  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3683  globin  62.02 
 
 		 131 aa  160  7e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.88101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3615  globin  62.02 
 
 		 131 aa  160  7e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.404542 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1098  globin  61.29 
 
 		 127 aa  160  7e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.18171  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3538  globin  64.17 
 
 		 142 aa  159  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.637564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1533  globin  58.87 
 
 		 129 aa  155  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.331833  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11540  truncated hemoglobin  61.9 
 
 		 148 aa  155  2e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7355  hypothetical protein  59.02 
 
 		 132 aa  152  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2414  globin  57.02 
 
 		 137 aa  151  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0149997  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3533  globin  59.5 
 
 		 149 aa  151  2.9999999999999998e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.841697 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1609  globin  58.87 
 
 		 132 aa  149  1e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.650446  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09780  truncated hemoglobin  57.5 
 
 		 357 aa  147  6e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2550  globin  59.69 
 
 		 129 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.881272 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2637  globin  60.83 
 
 		 153 aa  144  4.0000000000000006e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.4032 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2168  globin  54.55 
 
 		 149 aa  144  5e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000874397 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0936  globin  53.28 
 
 		 135 aa  136  1e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09000  truncated hemoglobin  52.07 
 
 		 178 aa  132  1.9999999999999998e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0562006  normal  0.0132331 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1225  globin  54.03 
 
 		 125 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0341074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1243  globin  46.4 
 
 		 133 aa  113  7.999999999999999e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0783  globin  44 
 
 		 133 aa  109  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259249 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0771  globin  45.45 
 
 		 137 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2370  globin  45.08 
 
 		 130 aa  108  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.16985  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1626  globin  43.8 
 
 		 137 aa  106  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4091  globin family protein  40.16 
 
 		 132 aa  100  9e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1250  globin family protein  39.34 
 
 		 132 aa  99.4  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1355  globin family protein  39.34 
 
 		 132 aa  99.4  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1317  hypothetical protein  39.34 
 
 		 132 aa  99  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.997153  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1116  hypothetical protein  39.34 
 
 		 132 aa  99.4  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1098  globin family protein  39.34 
 
 		 132 aa  99  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1092  globin family protein  39.34 
 
 		 132 aa  99  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.720422  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1209  hypothetical protein  39.34 
 
 		 132 aa  99.4  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1279  globin family protein  39.34 
 
 		 132 aa  99  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0911  globin  39.34 
 
 		 132 aa  97.8  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1105  globin  38.52 
 
 		 132 aa  97.8  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3650  globin  39.34 
 
 		 141 aa  92.4  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.260647 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0410  globin  38.76 
 
 		 144 aa  89  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.236118 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2346  globin  39.2 
 
 		 142 aa  88.2  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.636016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3444  hypothetical protein  38.52 
 
 		 130 aa  85.5  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.237349  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0132  globin  36.29 
 
 		 144 aa  85.5  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.823311 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2419  globin  34.71 
 
 		 123 aa  84.3  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1800  globin family protein  38.33 
 
 		 128 aa  84  6e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3955  globin  37.98 
 
 		 128 aa  84  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.405628  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1997  hypothetical protein  35.43 
 
 		 129 aa  83.6  9e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.174841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3010  globin  37.7 
 
 		 136 aa  83.2  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3261  globin  36.07 
 
 		 136 aa  81.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.4456 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1917  globin  42.16 
 
 		 134 aa  80.9  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.626219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2697  putative globin  37.3 
 
 		 136 aa  80.9  0.000000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1001  globin  37.1 
 
 		 121 aa  80.9  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.621706  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1020  globin  37.1 
 
 		 121 aa  80.9  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0280188  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1256  globin  38.58 
 
 		 137 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.331075 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1316  globin  39.02 
 
 		 137 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.129637 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1878  hypothetical protein  36.67 
 
 		 131 aa  79.3  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0042  globin  31.15 
 
 		 145 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0182573  hitchhiker  0.000000860997 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1355  globin  35.9 
 
 		 129 aa  79.3  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.610023  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0034  globin  31.4 
 
 		 145 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0103941 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2241  globin  41.18 
 
 		 134 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.723886  normal  0.694262 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3244  putative oxygen-binding protein, globin-like  38.21 
 
 		 137 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0774  putative oxygen-binding protein (globin)  34.96 
 
 		 126 aa  78.2  0.00000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.207145 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1464  putative globin  36.36 
 
 		 139 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251248 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0039  globin  30.58 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.102658  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0036  globin  30.33 
 
 		 145 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0572064  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1767  globin  37.27 
 
 		 137 aa  77.4  0.00000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0899  globin  37.19 
 
 		 147 aa  77.4  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5890  putative hemoglobin protein (truncated hemoglobin)  34.96 
 
 		 152 aa  77.4  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429127  normal  0.556027 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0697  globin  40.91 
 
 		 142 aa  77.4  0.00000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.462727 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0051  globin  33.59 
 
 		 143 aa  77  0.00000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.294967  normal  0.0701367 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1573  globin  37.19 
 
 		 144 aa  77  0.00000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.732575 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0039  globin  30.33 
 
 		 145 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0935  hypothetical protein  38.32 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2781  globin  39.13 
 
 		 141 aa  76.3  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.778315  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2330  globin  36.43 
 
 		 130 aa  76.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.260372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5606  globin-like protein  40.91 
 
 		 136 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.62023  normal  0.960923 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3454  globin  39.13 
 
 		 141 aa  75.9  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.273084  normal  0.734777 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0582  hypothetical protein  33.05 
 
 		 147 aa  75.1  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.709558  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1867  hypothetical protein  36.8 
 
 		 148 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1401  hypothetical protein  36.8 
 
 		 148 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1095  hypothetical protein  36.8 
 
 		 136 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0772  hypothetical protein  36.8 
 
 		 136 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1253  hypothetical protein  36.8 
 
 		 136 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1261  hypothetical protein  36.8 
 
 		 136 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.100755  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0378  hypothetical protein  36.8 
 
 		 136 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.746099  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>