More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1025 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_1025  Luciferase-like monooxygenase  100 
 
 
340 aa  682    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6468  luciferase family protein  59.59 
 
 
356 aa  390  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0486136 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0352  luciferase-like  58.81 
 
 
355 aa  385  1e-106  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3726  hypothetical protein  57.23 
 
 
351 aa  362  6e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000427742  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3458  hypothetical protein  51.98 
 
 
339 aa  341  9e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.147347  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0580  luciferase-like monooxygenase  53.37 
 
 
352 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5936  putative monooxygenase with luciferase-like ATPase activity  53.03 
 
 
343 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3089  luciferase-like protein  54.6 
 
 
339 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2855  luciferase-like monooxygenase  53.37 
 
 
352 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1048  luciferase family protein  54.29 
 
 
332 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1051  luciferase-like monooxygenase  54.29 
 
 
332 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1747  luciferase-like monooxygenase  53.87 
 
 
336 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2739  luciferase-like monooxygenase  53.87 
 
 
336 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2799  luciferase-like monooxygenase  53.37 
 
 
352 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1765  luciferase-like monooxygenase  53.87 
 
 
397 aa  335  5e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2861  luciferase-like monooxygenase  53.37 
 
 
424 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4281  flavin-dependent oxidoreductase  54.77 
 
 
332 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0690  luciferase-like  54.46 
 
 
332 aa  334  1e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1169  luciferase family protein  54.46 
 
 
332 aa  334  1e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1145  luciferase family protein  54.46 
 
 
332 aa  334  1e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3339  hypothetical protein  52.29 
 
 
339 aa  334  1e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2136  luciferase family protein  53.92 
 
 
332 aa  332  4e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.962379 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2838  luciferase family protein  52.41 
 
 
338 aa  332  5e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0259325  normal  0.0416707 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0498  hypothetical protein  50.3 
 
 
341 aa  329  3e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5546  luciferase-like  52.47 
 
 
337 aa  328  6e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4004  hypothetical protein  51.22 
 
 
347 aa  327  2.0000000000000001e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1795  luciferase family protein  52.27 
 
 
336 aa  326  3e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.838711 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1545  Luciferase-like monooxygenase  53.07 
 
 
331 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2932  putative flavin-dpendent alkanal monooxygenase, luciferase-like  52.76 
 
 
331 aa  325  7e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.741431 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3720  hypothetical protein  50.61 
 
 
351 aa  325  8.000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3587  hypothetical protein  50.61 
 
 
351 aa  325  8.000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1994  luciferase family oxidoreductase, group 1  53.99 
 
 
341 aa  325  9e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3792  Luciferase-like monooxygenase  55.49 
 
 
361 aa  324  1e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.186196  hitchhiker  0.000277385 
 
 
-
 
NC_004310  BR1087  luciferase family protein  51.23 
 
 
327 aa  324  1e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.1113  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2172  luciferase family protein  51.7 
 
 
331 aa  325  1e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.115486  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0815  hypothetical protein  50 
 
 
335 aa  323  2e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0773662  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1047  luciferase family protein  51.23 
 
 
327 aa  323  3e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.360006  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3316  luciferase-like  48.8 
 
 
335 aa  322  6e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.645597  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0386  Luciferase-like monooxygenase  49.54 
 
 
328 aa  320  1.9999999999999998e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2289  luciferase family oxidoreductase, group 1  51.36 
 
 
340 aa  319  3e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.770296 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6282  luciferase family protein  52.29 
 
 
335 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.975045  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3503  luciferase-like  50.46 
 
 
328 aa  318  1e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1438  Luciferase-like monooxygenase  50.31 
 
 
331 aa  317  2e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0843804  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0592  hypothetical protein  49.69 
 
 
335 aa  315  6e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1713  luciferase family oxidoreductase, group 1  49.24 
 
 
338 aa  315  7e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.165772  normal  0.921889 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0647  luciferase-like protein  49.24 
 
 
331 aa  311  7.999999999999999e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3321  luciferase family oxidoreductase, group 1  50.93 
 
 
357 aa  310  2e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586399  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7218  Luciferase-like monooxygenase  50.76 
 
 
335 aa  310  2e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140559  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3043  luciferase family protein  51.67 
 
 
327 aa  309  4e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0564  luciferase family protein  50.45 
 
 
337 aa  308  8e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.98714  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4452  luciferase family protein  49.7 
 
 
333 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3597  hypothetical protein  47.55 
 
 
335 aa  307  2.0000000000000002e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0164889 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3465  hypothetical protein  46.93 
 
 
335 aa  306  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00186  flavin-dependent oxidoreductase  50.78 
 
 
328 aa  306  3e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.395347  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0214  luciferase family protein  52.13 
 
 
327 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.527708 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3463  hypothetical protein  46.93 
 
 
335 aa  306  5.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3456  hypothetical protein  46.93 
 
 
335 aa  305  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3631  hypothetical protein  46.93 
 
 
335 aa  305  5.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2640  luciferase family protein  49.24 
 
 
343 aa  305  5.0000000000000004e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0060  luciferase family protein  51.98 
 
 
333 aa  305  7e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3571  hypothetical protein  46.93 
 
 
335 aa  305  7e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1563  putative oxidoreductase  51.34 
 
 
335 aa  305  8.000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1789  luciferase-like protein  49.08 
 
 
333 aa  305  8.000000000000001e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1357  luciferase family oxidoreductase, group 1  50.62 
 
 
332 aa  305  8.000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.34279 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0545  Luciferase-like monooxygenase  46.63 
 
 
335 aa  304  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3642  hypothetical protein  46.63 
 
 
335 aa  304  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4479  hypothetical protein  46.63 
 
 
335 aa  304  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0538  hypothetical protein  46.63 
 
 
335 aa  304  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0742204 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3352  hypothetical protein  46.63 
 
 
335 aa  304  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0098  luciferase-like  48.94 
 
 
333 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1692  luciferase family protein  46.93 
 
 
330 aa  304  2.0000000000000002e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3534  hypothetical protein  46.63 
 
 
335 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0039  luciferase  48.64 
 
 
333 aa  301  1e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3612  hypothetical protein  46.32 
 
 
335 aa  301  1e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2201  luciferase-like monooxygenase  52 
 
 
338 aa  300  3e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.123209 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0927  luciferase-like  50.46 
 
 
333 aa  300  3e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.928282  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3964  Luciferase-like monooxygenase  50.77 
 
 
343 aa  300  3e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2514  luciferase family protein  46.87 
 
 
353 aa  300  3e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0889  luciferase-like  49.23 
 
 
328 aa  300  3e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.761673  normal  0.656027 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0761  luciferase family oxidoreductase, group 1  51.99 
 
 
337 aa  300  3e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390481  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0153  bacterial luciferase family protein  48.64 
 
 
333 aa  299  4e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3958  Luciferase-like monooxygenase  51.08 
 
 
346 aa  299  6e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.298501  normal  0.321099 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03027  predicted enzyme  46.32 
 
 
335 aa  298  7e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02978  hypothetical protein  46.32 
 
 
335 aa  298  7e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3670  luciferase family protein  50.46 
 
 
343 aa  298  1e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0103  luciferase family protein  47.48 
 
 
334 aa  296  3e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32520  hypothetical protein  50.74 
 
 
333 aa  296  3e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.985458  normal  0.231393 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2449  luciferase family protein  49.07 
 
 
336 aa  296  4e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4222  Luciferase-like monooxygenase  48.36 
 
 
338 aa  295  6e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.504496  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2679  putative luciferase-like monooxygenase  50.46 
 
 
353 aa  295  7e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172098  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3262  Luciferase-like monooxygenase  47.53 
 
 
331 aa  295  7e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0088  luciferase family protein  47.48 
 
 
334 aa  295  9e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161707 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2755  hypothetical protein  50.45 
 
 
333 aa  295  1e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2368  Luciferase-like monooxygenase  44.51 
 
 
334 aa  295  1e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0105651 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0106  luciferase family protein  47.16 
 
 
334 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0045714 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1983  luciferase family protein  45.06 
 
 
338 aa  293  4e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437489  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3510  Luciferase-like monooxygenase  47.13 
 
 
333 aa  291  8e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.218874 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3603  flavin dependant oxidoreductase  47.29 
 
 
338 aa  291  9e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.141561  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0103  luciferase family protein  46.88 
 
 
334 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000816879 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2562  Luciferase-like monooxygenase  51.53 
 
 
348 aa  291  1e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.261536  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>